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  1. Transcript 'KH2012:KH.C2.216.v2....'
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Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C14.118.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

GPM6A; GPM6B; PLP1

Location

KhC14 [1,333,351 / 1,340,391]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 441

>KH.C14.118.v1.A.SL1-1
FQFYLDLKMSVHSLHDLVEAESYQGYNIDRNGEVTEFYDHRNEDGTNSISTARHPLVTTS
HPATTVATTPKRKKVRYRDAGCCDGCVNCLITIGTMPFATAFAVLLCWLGTAMFIGGGWS
ALDGTMNLWAQFGPMAGNPYNHPPPQYLYTGNALTPQFINLNRDDLGNRVPAVFQAIKYS
FYGLIPFMFVFTIMLACDNRHSSRAMASKKRSCKSSSSGICLTAALIGVTYILILAWVFF
LAFTTLGVYYYRISMLRCSDLQEREFSTGVLKDVCIDLVQLGVMMFKNTQDNGFGKLCGP
GDSMQSYGKLEGYCQNYYVVYQYMLVAFSGCLLNIIAMINFIMILTINYNDLARKRAAPT
RSTASAAPSQASTTPIVARSVRSIPNTSVGPPPYVVSNRDYDRERRSSKDIELDYMLDSA
SSYERPREEDSHMGVNYYYRR

Nucleotide sequence

Length: 3,016

>KH2012:KH.C14.118.v1.A.SL1-1
GTTTCAGTTTTACTTGGATTTAAAAATGTCTGTACACAGTTTACACGACTTAGTAGAGGC
AGAGTCGTACCAAGGATACAACATTGATAGGAATGGAGAAGTGACAGAATTTTACGACCA
CAGAAATGAAGATGGGACAAACAGTATTTCAACAGCAAGACACCCCTTGGTCACCACAAG
CCACCCAGCAACTACAGTTGCTACAACCCCGAAAAGGAAAAAAGTTCGATACAGAGATGC
AGGTTGCTGTGATGGATGTGTGAATTGTTTGATCACGATTGGAACAATGCCGTTTGCAAC
AGCGTTTGCTGTCTTGCTCTGCTGGCTAGGAACAGCCATGTTTATAGGTGGTGGTTGGTC
TGCTCTGGATGGTACAATGAATTTGTGGGCACAATTTGGGCCAATGGCTGGCAATCCATA
CAATCACCCACCACCACAATACCTATACACTGGTAATGCACTAACACCACAGTTCATCAA
CTTAAACAGAGATGATTTAGGAAACAGAGTACCTGCTGTTTTCCAAGCGATCAAGTATTC
GTTTTACGGATTAATTCCATTCATGTTTGTGTTTACGATTATGTTAGCATGTGACAATCG
TCATTCGTCTCGTGCCATGGCTTCTAAGAAACGAAGTTGTAAATCATCAAGCTCAGGCAT
CTGTCTCACCGCTGCGCTCATAGGTGTCACATACATCCTCATACTGGCTTGGGTATTTTT
CCTTGCGTTCACAACGCTTGGTGTCTACTATTATCGGATATCTATGCTTAGATGTTCTGA
TTTGCAAGAGCGAGAATTCAGCACTGGTGTTTTAAAAGATGTTTGCATTGACCTTGTACA
GTTAGGCGTCATGATGTTCAAAAACACACAAGACAATGGATTTGGGAAACTATGTGGACC
TGGTGATAGCATGCAGAGTTATGGGAAACTGGAGGGCTACTGTCAGAATTACTACGTGGT
GTACCAGTACATGCTTGTGGCTTTTAGTGGGTGCTTGCTTAACATTATCGCAATGATCAA
CTTTATAATGATTCTTACTATTAACTACAACGATCTTGCCCGCAAACGAGCGGCCCCAAC
GAGATCTACGGCCTCTGCTGCTCCAAGCCAAGCCTCGACGACGCCCATAGTAGCACGCTC
TGTACGTAGCATACCCAACACCAGTGTAGGGCCCCCGCCTTACGTGGTAAGCAATCGAGA
CTATGACAGAGAACGGCGCTCGTCTAAAGACATAGAGTTAGATTACATGTTAGATTCTGC
AAGCAGTTATGAAAGGCCTCGTGAAGAAGATAGCCACATGGGTGTAAATTATTACTACAG
ACGCTAAGGTTTGGTTTATAAACTTTATATGTTACATAAACAAAACTCAAGAAGTATATT
TGTAAAAATACTTCGAAAAAGTCGAATTTTTGTGTCTTTATGAAAAAAAACTCTTTTTAA
TCTGCTAAAATGAAATGTTTATGGTGTTTTTAACAAAAAAAATACTTTTTTTGTATTTGC
TTACTTTTTACTGCATATGCTACAAAACGTAAACAAACAACATTTGAAGAATAATAAACC
CTTATCCTCACGACTCCCGTGGAACGTTGTTATTTCTTTAATAAACAATCCGGTTTTTGG
ATATTATGTGCTAAAGGCGTCCCGTCTTTCCCCACACTAATATATATATATATATTGATA
TGTTGTATGTATACACACATGCTAATGAAACATCATGTTTTACTGACCAGTTGGTTATGT
TTTACACAATCAGATATCATACATTGCTCGTTATACTATACAGTTACCATTACATATGTA
TTTGCCTGGTCGCAAACGGATAAATAGTTTTTGTCCTTTTTATATAGTAGATGGGGCATG
ATGGGACATGTTTTTACTCATTGTCGTCCCATTTGGTTGTCAACAAGTTATATTTACAGA
ATCATAAAACCGAAGCCTCTTTTTTTAAAAATGCGTTGTTATTTGTTTAAAACACGGTCA
GAAAATATGGGTTTTAGGTGCTAACAGTATCCCATCTTACCCCACAATACTATATGTACA
GTGCTGTTGCGTGAAACTTAGTTTTATTCTAGTAAAATGAGAGCTGTCGTATCGTGTTGT
CTTAACGTATCAAAAATAACCCTGTATGTACTAACAGTGAGAAAAAGCTGAGTTCTTGAT
ACGCTAAAAAATCATCTTTCTATAAACGTCCCACTTTTTGCAAATGACTTGTAAATGCTA
TTTGACCATATACCAGTTTCTTTTTATGTCACGGTTAAATTGTTCTGTTACAAAAATATA
CCTTATATCCATAGATGTTTAACGTAATTTTGACAATTTCGCGTAAAAAAACGTTTTTGA
ACTAATGAAAATCGAACAAAATTTTTAAATAAATTTTTAATTTAGGTCATTTTTGCTTTT
TAAACTGCAAATTTTAACTGCAACTAACATTTAACTTTAAAACATTACCCACTTTTGACT
GTTTCAAAGCCCGTAACTGTCTGTCCATTCACTCCAGTATTACAGCTACATAAACAAATT
TCTTGTTTTCTCGACGGTGCCTTTTTATATTTTGCATATTGTAATGTTTTATTCTTACAC
ACATGTTTGTACAGCATTGTGCTAATGTCATATTGTACCATCTTCCCCCATTCAAGTAGG
TTGGGGTAAGATGGTCCATGTTTTCATTCTGATTTATTGCAATATTTACAGAATTTTATA
ACAAAATTTTCACGACTTTAAAAGAGTCGTTAACCGTTAAAATTACAATATATGTATATG
TTGTGTGGTAATGGTATCCCATCTTACCCCACAGTACTATACCCTTAAAAAATCCAAACA
ATCTACAAGAATTTACTCTTTTTCTGGTAACGTATAATTTTATAATATCTATAAATATAT
TGCATACCGTAATTGCATCGTTGTTTTGGTACCAAATGTTTATCCTTGTATTTACCTGCT
TTTTTATTCTAAATATTACAGCGTCTCCCTATGGTAGCTGTAGAATTAGTGACCAATAAA
ACGTGTGAGTTGCAAA

InterProScan

PANTHER
Myelin_PLP (IPR001614) - T[9-356] 3.1E-54
Pfam
Myelin_PLP (IPR001614) - T[82-131] 8.8E-7 - T[172-352] 4.9E-26
PRINTS
Myelin_PLP (IPR001614) - T[88-117] 2.9E-7 - T[226-252] 2.9E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
GPM6B_HUMAN 26.087 % 96.7 1.27E-22