- Transcript 'KH2012:KH.S1206.2.v1...' >
- Clone 'cima877507' >
- Transcript 'KH2012:KH.C9.68.v2.A...' >
- Transcript 'KH2012:KH.C8.38.v7.A...' >
- Transcript 'KH2012:KH.C14.237.v1...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C14.237.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
GAA; MGAM; MGAM2
Gene model
Location
KhC14 [3,201,667 / 3,205,816]
Amino acid sequence
Length: 697
>KH.C14.237.v1.A.SL1-1
MIMYHGAFSLQTTRPISYQFLQMSSALPTNDIYGLGERHGGALVSTNWNRLLFWARDQRP
QENENLYGDHAFYMGIENDGKAHGVFLLNSNAKEIELQPSPALTWRTIGGILDFYVFLGP
TPEEVVQQYTQVIGRTFMPPYWSLGFHLCRWGYGSSNNTWDIVKRMREAKIPQDVQWNDI
DYMSKRLDFTYDKTTFDTLPQMVEDLHENGQHYIMIIDPGISNKQPTGTYPAYKQGIELD
VFIKDPRTNAPISGEVWPGSTVYPDYTHPNINSYWKNQLSGYEDKINFDGVWVDMNEPSN
FVTGSTTGCPNNQTLCSSSKHYNETIHYNVHSLTGLLEMKATSEVMASIRKKRPFVISRS
TFPSAGMYGGHWSGDITSTWPDLRQSIASVINFNMFGIPMVGADICGFSGSTNEELCIRW
MQLGAFYPFSRNHNMKLTRGQAPVDFSTPVQVPMRNALLKRYLFLPYLYTLFYSSHINGT
TVARGLMIEFPEDHTARKIDEQFMWGSGLLISPCLYVSSSRVNAYFPRGLWYDCTTENFG
NKINSQGQYETLSAPLNGSIPLHIRGGNIIPAQYPELNTVKSRKQPFILFVAPDNTGKAC
GQLYWDDGETLLGDGSIKHVAIDFVLLDNTLSSYASNFNYTESMMVSDISIFGISTKPKS
VTFNKKEIVKTEIVNGNTLRVEVSADLKENFELKWVL
Nucleotide sequence
Length: 2,814
>KH2012:KH.C14.237.v1.A.SL1-1
TCACGTAGGCAATGCAATTTCTTTCTTTATATTTATCTCTGATTTTGTTACGGGTCTGCA
TCATTGAAGCAATACAATGTAGCATTGAAAACCAAGACAGTACATAATTTTCAATTATGT
GGTTATCAGGGTCGACTGTTATCCCGAAACTATTCCAGCTGTCAAAGAACACTGTGAGCA
AAGAGGATGTTGTTATAACTCGAATCCGAATGTAAATGATAATGTACCATGGTGCTTTTT
CCCTACAGACTACAAGGCCTATAAGCTACCAGTTTTTACAGATGTCCAGTGCCCTGCCCA
CAAATGACATATATGGCTTGGGAGAACGGCACGGCGGTGCTTTGGTCAGCACAAATTGGA
ACAGATTGTTGTTCTGGGCACGAGATCAGCGCCCACAAGAAAACGAGAACTTATATGGCG
ACCATGCATTTTATATGGGCATTGAAAATGATGGTAAAGCGCATGGTGTCTTCTTATTGA
ACAGTAATGCTAAGGAAATAGAGTTACAGCCTTCACCAGCTCTAACATGGAGAACTATTG
GAGGAATTCTTGATTTCTATGTGTTTTTGGGACCCACACCCGAAGAAGTTGTGCAACAGT
ATACTCAAGTAATTGGGCGGACATTTATGCCCCCATATTGGTCCCTAGGCTTCCACTTAT
GTAGATGGGGATATGGGAGTTCCAACAATACTTGGGATATAGTGAAGCGTATGCGAGAAG
CAAAAATTCCCCAGGATGTGCAGTGGAATGATATTGATTATATGTCCAAGCGCTTGGATT
TCACATACGACAAAACCACTTTCGATACTCTCCCACAAATGGTGGAGGACCTTCATGAAA
ACGGGCAGCATTATATCATGATTATAGACCCTGGTATATCTAATAAACAACCTACTGGGA
CTTATCCAGCTTATAAACAAGGGATAGAATTAGATGTTTTCATTAAGGATCCGCGGACAA
ATGCTCCAATAAGTGGAGAAGTTTGGCCTGGCTCAACTGTCTATCCAGACTACACTCATC
CTAATATTAATTCTTACTGGAAAAATCAGTTATCTGGTTATGAAGACAAGATAAACTTCG
ATGGTGTTTGGGTTGATATGAATGAACCTTCAAATTTTGTCACTGGATCAACAACTGGTT
GTCCAAATAACCAGACCTTGTGTTCATCGTCTAAGCATTATAATGAAACAATCCACTATA
ATGTACACAGCCTTACTGGACTTTTGGAAATGAAAGCCACAAGTGAGGTAATGGCATCCA
TACGGAAGAAAAGACCATTTGTAATATCAAGGTCTACTTTTCCAAGTGCTGGTATGTATG
GCGGGCATTGGAGCGGTGACATTACAAGTACCTGGCCTGATCTAAGGCAGTCAATTGCCA
GTGTTATAAATTTTAATATGTTTGGTATTCCAATGGTGGGAGCAGACATTTGTGGATTTT
CTGGCAGTACTAATGAAGAGCTGTGTATTAGATGGATGCAACTTGGGGCATTTTATCCAT
TTAGTAGAAATCATAACATGAAATTAACAAGGGGGCAAGCACCAGTGGATTTTTCAACAC
CAGTGCAAGTCCCTATGAGAAATGCACTGCTGAAGAGGTATCTGTTCCTTCCATACCTGT
ACACCTTGTTTTATTCATCCCATATTAATGGTACAACTGTGGCAAGAGGTTTGATGATAG
AGTTCCCAGAGGACCATACAGCAAGAAAAATTGATGAGCAGTTTATGTGGGGCAGTGGGC
TTTTAATATCTCCGTGTTTATATGTTTCTTCTAGCCGTGTTAATGCTTACTTTCCACGCG
GTTTGTGGTATGATTGCACGACTGAAAACTTTGGCAATAAGATCAACTCGCAAGGACAAT
ATGAGACACTCTCTGCTCCTTTGAATGGCTCAATACCTCTTCATATTAGAGGTGGGAACA
TAATACCAGCTCAGTATCCAGAATTGAACACAGTGAAGAGCAGAAAACAACCCTTTATCT
TATTTGTGGCTCCAGATAACACAGGAAAAGCTTGTGGGCAGCTGTACTGGGATGATGGAG
AGACACTTTTGGGTGATGGTTCTATCAAGCATGTTGCCATTGATTTTGTTTTATTGGACA
ATACCTTGTCCTCGTATGCTTCCAATTTTAACTACACTGAAAGCATGATGGTTTCAGATA
TTTCTATATTTGGTATTAGCACTAAACCTAAATCTGTTACATTTAACAAAAAAGAAATAG
TGAAAACGGAAATAGTAAACGGTAATACACTAAGAGTTGAGGTTTCAGCTGATTTAAAAG
AAAACTTTGAGCTTAAGTGGGTTTTGTGATAACATAGTATGCTACATTGCTACATTACCC
AAATGCATGAACACCATATATATATAATTAATTATATATATAAGCTTTAAAATGTAACTA
AAATTGCCAAACAACAAGCATAAAATGGTACAAATCTCAAGTTTTTAAAAAGAAATATTA
ATAAATTATAATGATGCTGCAGTACTGTGTAATATGTGTGCAATAATAATTGCGTATGCT
GTTTTATCCGAAGCATTGAGCATTGTAGTTTGTCACTGTGTATATTTGTGCCATATAAAC
CATGTTTCTTAATTATATATATACATAAATGAAAAAAAATCCTCATTTATTTCATTTTCA
TTCTTTAATTTTGTTTTACATTATGATGATTAGATTGGCTAATAGAAAAAGTGCTGTTAA
TTTTTTTAACACATAAAAAATGCTGTTAAATTGATTGCAGGTGTAATTTAATCCATTTCT
ACCAATCGAATTGGTAGATCATGATCCGCTTGATTAAAAAACAAACGTCTTATA
| SUPERFAMILY |
Gal_mutarotase_sf_dom (IPR011013) - T[16-122] 4.39E-24 |
| Pfam |
Glyco_hydro_31_N_dom (IPR025887) - T[31-91] 2.2E-7 |
| Pfam |
Glyco_hydro_31 (IPR000322) - T[115-570] 3.8E-155 |
| SUPERFAMILY |
Glycoside_hydrolase_SF (IPR017853) - T[123-480] 3.28E-79 |
| ProSitePatterns |
Glyco_hydro_31_AS (IPR030458) - T[290-297] . |
| ProSitePatterns |
Glyco_hydro_31_CS (IPR030459) - T[402-432] . |
| Gene3D |
Glyco_hydro_b (IPR013780) - T[464-566] 8.0E-31 - T[567-697] 1.6E-26 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| MGA_HUMAN | 42.437 % | 565 | 0 |
| MGAL_HUMAN | 42.275 % | 547 | 5.16E-173 |
| LYAG_HUMAN | 46.067 % | 676 | 0 |