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  1. Transcript 'Haaura.CG.MTP2014.S4...'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C14.240.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C14.240.v1.C.ND1-1

Possible name(s)

CCR4; CX3CR1; GPR15

Location

KhC14 [197,700 / 203,540]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 250

>KH.C14.240.v1.C.ND1-1
SVYVGTAHHPVHVSSIMGNLAEQWPLMIAIDIFNAGNFLYPSLKIYHVIACVIAFLVALL
IVLVMCVGTIHRTGGLAAILPYRIHLSLLRRNRRKKKDETDDTAGAMALHRKHSIQLSYM
RNMTHFILSVSIVYVVCRFPANIVLLLDSLQIPITISPVGLAAIGTIAFSHSLLNPIVFY
VTLQPMRKAVHHLFQPCCTRTIETKRGTTTTDPTNTNITSALAQNRKRSQLSARISVVST
ISINQNETTF

Nucleotide sequence

Length: 2,393

>KH2012:KH.C14.240.v1.C.ND1-1
GTTTAATTTGTTAAACATGTCTAACAACACGAACTACACAGCCACCCCAACGTCCATGTG
TATGTTGATCAGGACATACACCTCTAATGAAACTTTGTTTAACAACGAACATAGCACAGT
GATTATCAGAATCTCACTATCGACACTCGTGTTCATGATCAACTCAATGCTTGTTGCTGG
TTTGGTCAAAAGTTGGTCAAAGTTTCGCCAAAATATTTATATTTTCGTCCTCGCCATTGT
GACATGTGATGCCCTGCTTGGATTGGTGAACGCGACTAATGGAATACATCACCTAGCAGC
TGGAAATATTCTGGATAAATCTGGAGCCCGATACCGATACGAAACAGCTTGGTTCTACAT
GATAAAGTCTTCCATATTTATGGCGGCTGAGGTGTTTACAGCTGGCCATACAGCTTTGAT
TGCTCTTGCTTTCTCTCGGTATATTTCAGCTCAATCGCATCAACATATGGAACAATTACA
CAAACGTAACACAGCTCCTGGCAGTTCCTCTCAAATGAACAAGTCTCTTCTTTTATCTCG
GAGGAAAAGTTGGATTTTGTCGCTAAATGTTTTCGTTCTCTCCCTAGCGATTTTTATAAT
CGGTCTATGTTGGAACTGCACATCATCCTGTTCATGTTTCTTCGATAATGGGAAACTTAG
CCGAACAATGGCCGCTCATGATTGCCATCGACATTTTCAATGCAGGTAACTTTCTCTACC
CTTCGTTGAAGATATACCACGTGATCGCTTGCGTCATTGCCTTCCTCGTAGCTTTGCTGA
TAGTTCTCGTTATGTGTGTTGGGACCATACATCGAACGGGGGGGCTGGCCGCCATCTTAC
CTTACAGAATTCATCTAAGTTTGCTCAGAAGAAACAGAAGAAAGAAAAAAGATGAGACCG
ACGACACAGCTGGTGCAATGGCGCTTCATAGAAAACATTCGATACAACTTTCGTACATGA
GAAACATGACGCACTTTATCCTATCCGTGTCAATAGTGTACGTGGTTTGCAGATTCCCAG
CTAATATTGTTCTTCTGTTGGATTCCCTCCAAATACCAATAACAATATCACCTGTTGGGC
TTGCGGCCATTGGAACAATTGCTTTCTCCCACTCGCTACTTAACCCAATTGTGTTCTACG
TTACATTACAACCAATGCGAAAAGCGGTCCATCATCTTTTCCAACCATGTTGTACTAGAA
CCATTGAAACGAAGAGGGGAACCACCACAACTGATCCCACAAACACAAACATAACATCAG
CGTTGGCTCAAAACAGAAAGCGTTCACAACTTAGTGCGCGCATAAGTGTAGTGTCCACCA
TTTCGATTAATCAGAACGAAACTACGTTTTAAACTGGATGGGGAAAATGGGAAACAACAT
GGCCTGCTATATGCTATGGTGGGAAAAGATGGAACACCTTTAGCACATAGCATCCAAATA
TCATGGCCGTGTTTTAAACAATTACCAACGGTCTATGGGAGTCGTGAGGATACGGTTTTA
AAATTCTTTGAATGTTCTTTGTTTATTACCAAATTGAACGAGAAAATAGAATGAAAAGTG
TCCCATCCTCCCACCCTACTATATTATAGATGCCAAATATAGAGACAAAGACATGAAGTT
CATTAATGACAATAATTGACTATTATAGTGAGGTGGGGAAGATGGGGCACCTTTAAGCAC
AACATATCCCAATATCTTGATCGTGTTTTAAATAATAATTAACAACGCTCGTTTAGGTTC
GCAGGGCTACGGTTATATAATTCTGTGAATGTTCTTTGTGTACTACCAATTGGAACGAGA
AAACAGAACGAAAATATGTCCCATCTTAACCCACCCTACTTTGAGTTTACTTTTCTGCCT
CAATCTTTAAATGTCCGTGTTTTATCGGGCAGTCACATGACCACTTATCACCTATATTGA
TAGATTAATGTGAAGTCACATCGGTACTACCTCTAACGTTATCACACGCAAGGAAGAAGT
AGGTCACACATCCGTTAGTTACTGTGGGCTTTCACAGCAGTAACATCTGGTTAACTTTTG
TTGTTTTTGCAAGTTTCTAAGACAGCTGATTAAATTAAACAATTAGACTGTCCCAGGGCC
TGTTAAGTTTTTGAATACGGGTCACGCACCGATTATAGCACGTCAATAGCCTCTGGCTAA
AACCACTAAAAATGTTTTGAAACAAAACATAATATCGCCAAATGAGTTCTCAAAAACGTA
TTTATACACACCTTATAACCGTGTTATAATAATTTGTGTCCATTTATTAAAGCTTAGCTC
TCTCGTTGTTTTGTTTATTATTTAATATTGTAATAGAAATACACAGTGGTTGGCTGATTT
TGGCAAATGTTTTGAATTCGTTACCATAAATAAAATGTCGAAATGCAACTTTG

InterProScan

ProSiteProfiles
GPCR_Rhodpsn_7TM (IPR017452) - T[1-179] 9.88
Pfam
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[44-178] 1.2E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value