Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C14.516.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

AGTR1; P2RY12; RGR

Gene model

KH2012:KH.C14.516

Location

KhC14 [1,399,434 / 1,405,930]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 294

>KH.C14.516.v1.A.ND1-1
SIAFVLHLEDVRDFKMELEFGITRTAYGIAMLMMAAVATFGYSVYILAIWSSKKLQTKHI
WLTSLACADLLMMVHLFMDGLSSFHQGRRPKGIFECQVSAHMGLFSGFVSIASMTWICID
RYYRKFKPEKVGVNYCFYVIIVWAMSFLAASGPALGFGAYESAEENTVKCLIDLENTDMN
TIKYFVVVGFLFFFYPIFKMIKYNTKFAYKSEEEKAVVIAAPVSFVLGYLPYLVYACLKL
TIGLPPLNQASIAFLYLLPKFISVMNPYMYMRSDPELLRAAKRVVNFDFDQKIE

Nucleotide sequence

Length: 1,634

>KH2012:KH.C14.516.v1.A.ND1-1
TTTTAAGAAGTGGCCATTACAGCAACCAATTACTCCGCGTAAAGTATCGCATTTGTTTTA
CACTTAGAAGACGTACGGGATTTTAAAATGGAGCTGGAATTCGGTATAACACGAACTGCT
TATGGAATCGCAATGCTTATGATGGCTGCAGTTGCTACATTCGGATACTCTGTCTACATA
CTCGCAATTTGGAGTTCAAAAAAACTGCAAACGAAACATATATGGCTGACTTCGCTTGCT
TGTGCCGATCTCCTAATGATGGTACATTTATTTATGGATGGCCTATCCAGCTTTCACCAA
GGCAGAAGACCTAAAGGGATATTTGAATGCCAGGTTAGCGCACATATGGGCTTATTCTCT
GGCTTTGTCAGTATAGCCAGCATGACTTGGATTTGTATTGACCGTTACTACAGAAAGTTT
AAGCCAGAAAAAGTTGGAGTGAACTATTGCTTCTATGTGATAATAGTGTGGGCTATGAGC
TTCTTAGCAGCAAGTGGTCCAGCATTGGGGTTTGGGGCTTATGAGAGCGCGGAGGAAAAT
ACAGTCAAGTGTTTGATTGATTTGGAAAATACAGACATGAACACGATCAAATATTTTGTG
GTTGTAGGATTTCTATTTTTCTTCTATCCGATTTTCAAAATGATTAAATACAATACGAAG
TTTGCTTACAAATCGGAAGAGGAAAAGGCGGTTGTGATCGCTGCACCAGTTTCATTCGTA
CTCGGTTATCTCCCATATTTAGTTTACGCTTGCTTAAAACTTACAATCGGCTTACCACCT
CTCAATCAAGCTTCAATAGCTTTTCTATACCTTCTGCCGAAGTTCATATCCGTTATGAAC
CCCTATATGTACATGCGTTCGGATCCCGAGTTACTGCGTGCAGCAAAACGAGTCGTCAAC
TTTGATTTTGACCAGAAAATTGAATAGATTTTAAACCATATATTTTATTACGTTATATGC
ATTACAATATTTTTAATGTATAATAACGGTGCCTTGAATCGCGAATATAATATATATGTG
TGTAGACAATCTGTACAAGTACCACTTTTTAACGTAAAGCTGGCTGGGGTAAGATGGTAC
ATGTTTCTTTTTCATTTATCTTTCCTTTGGTGGTAAACAAAGAATATTTACAAAATTATA
TAACCGTATCCTCATGCCTTTAAAATTTCGTATTTATTTATTAGCGTGCTTATTAAGAAA
TATTAGGCAATATGTGTTAAAACCCGTATTACCCTACGGTACTATAAAATGAGCTCTTTT
AACCCGTTATAATAATAACTTTAATTTGTCCCTTCTTTTACGGTAGCGAAGAATTAGAAA
TATTTTAAACAAAAGGACATGATTTAGCGAAAAAAAAACAATTGTTAAAATAAGGCTTAC
GATTAAAAAAATATTCCATAATTTTTTTAGAAGGCTATTTAAAATATGTTAATACTTGTT
GTTTATTACCAACTGCAAGAGAAAGGCGAATTAAATCATGTCCCATCTTACCCCTGCTTA
AAATATAACAAAACATGTAAACATATTGCTTGTAAACAACATACAATTCTTGTTGAACGC
GAATTTTCCGCAGTCAACGGCGCCTATAGGCATAACAGCAATTGTGCGTTTTTTATAGCA
CGTTGATTACTTGA

InterProScan

ProSiteProfiles	GPCR_Rhodpsn_7TM (IPR017452) - T[41-270] 14.153
Pfam	GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[45-208] 1.4E-18
PRINTS	GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[58-79] 1.0E-6 - T[103-125] 1.0E-6 - T[214-238] 1.0E-6 - T[252-278] 1.0E-6

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value