- Transcript 'KH2012:KH.C2.57.v1.A...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C2.57.v1.A.SL3-1
Possible name(s)
YTHDF1; YTHDF2; YTHDF3
Gene model
Location
KhC2 [153,895 / 157,256]
Amino acid sequence
Length: 646
>KH.C2.57.v1.A.SL3-1
SYCDISCIFKYKTFECNIYFVMSNATLDPDQHHKTQTGRSRMQNGLESKGQTGRNDEFDS
SYMHQANVNPAYGMAPTSDSYMPSYYGQMPFPYMGSSEWSTGSTDNMPYLSGFGGEAQQH
SFLPDAMFSHPPAALGNTPAYYNQPYNFFQHGTDFSPWASHSSAHGTGMPETPGGTGFGQ
QTAAPTYNGDYYPSIMPATPHDYLGTGEAIVSNGSVLGHGAPGAAIPGVGGSTVMSSGDP
IGKLPVGSSSNSMKMVEQGIQNMGLGMSSMSGDPMKQMQVTPVIPMPGGGSIVSAGAPQN
ATNISGQSSQSASSSNNSTPVPGSNAPKPVSWAAIASKPAKPQPKPKAKSMVGPGLPPPI
KHNMDIGTWDSQTPAKGPAKGQMPGQPGAPQRWSAPRQGPADGSVSSNHHSANAGNTNTN
FHYNNAQTKEESGNEVLEKLKAENDYNPKRLTIDVRNARFFVIKSYSEDDIHRSIKYNIW
CSTDHGNKRLDAAFREQQGHGPVILLYSVNGSGHFCGVAEMLTQIDYSKRAGVWAQDKWK
GKFQVKWIYAKDVPNSQLRHIRLENNENKPVTNSRDTQEVPAEKGRQVLKIISSYKHQTS
IFDDFSHYERRQVEEEGLRQKRNELRSRDNHKEKQSAHPDQASPKN
Nucleotide sequence
Length: 2,659
>KH2012:KH.C2.57.v1.A.SL3-1
GCTTGTTTAAAGTTACTGCGATATTAGCTGTATATTTAAATACAAAACGTTCGAATGCAA
TATTTATTTCGTTATGTCCAATGCAACATTAGATCCTGATCAACATCATAAAACTCAAAC
TGGTCGAAGCAGAATGCAGAATGGTTTAGAAAGTAAAGGTCAGACTGGAAGGAATGATGA
GTTTGATTCAAGTTATATGCATCAAGCTAATGTGAATCCGGCTTATGGCATGGCACCAAC
CAGCGACTCCTACATGCCAAGTTATTATGGCCAGATGCCGTTTCCTTACATGGGAAGTTC
AGAGTGGTCAACAGGGAGTACAGATAACATGCCGTATTTATCTGGATTTGGTGGGGAAGC
TCAACAACACAGCTTTCTACCTGATGCCATGTTCAGTCACCCTCCAGCTGCACTTGGAAA
TACACCAGCGTATTACAACCAACCGTATAATTTTTTTCAACATGGAACTGACTTTAGTCC
GTGGGCATCACATAGCTCGGCACATGGGACTGGAATGCCAGAAACTCCTGGTGGAACTGG
CTTCGGCCAGCAAACTGCTGCACCAACTTATAATGGTGATTATTATCCATCAATTATGCC
GGCAACTCCGCATGATTATTTAGGTACTGGTGAAGCTATAGTTTCCAATGGTAGTGTCTT
GGGTCATGGTGCCCCAGGTGCTGCGATACCAGGTGTTGGTGGAAGTACTGTCATGTCAAG
TGGTGACCCTATTGGTAAACTACCCGTTGGTTCTTCATCAAATAGCATGAAGATGGTTGA
ACAGGGTATACAGAATATGGGACTTGGTATGTCTTCAATGTCTGGCGATCCTATGAAGCA
AATGCAAGTAACTCCTGTCATTCCCATGCCTGGTGGGGGATCTATTGTGTCAGCAGGTGC
ACCACAAAATGCAACCAACATTAGTGGACAATCAAGCCAAAGCGCCAGTTCAAGTAACAA
TAGCACACCAGTGCCTGGTTCCAATGCACCAAAGCCAGTATCATGGGCAGCTATTGCATC
AAAACCTGCAAAACCGCAACCTAAACCGAAAGCTAAATCGATGGTTGGGCCAGGACTACC
ACCACCTATTAAGCATAACATGGATATTGGAACTTGGGACTCTCAGACTCCAGCTAAAGG
ACCAGCGAAAGGTCAAATGCCAGGTCAACCAGGTGCCCCGCAGAGATGGTCGGCTCCACG
GCAGGGACCTGCAGATGGTTCAGTTTCATCGAATCACCATTCTGCAAATGCTGGAAACAC
AAACACTAATTTCCACTACAACAATGCACAAACTAAAGAAGAATCAGGAAATGAGGTGTT
GGAAAAATTAAAAGCTGAAAATGACTACAACCCAAAACGGTTGACCATCGACGTTCGGAA
TGCAAGATTTTTTGTAATTAAATCGTATTCTGAAGATGATATTCATCGTTCTATCAAATA
CAACATTTGGTGCTCCACTGACCATGGCAACAAACGATTGGATGCAGCGTTTCGTGAACA
GCAAGGACATGGCCCGGTTATTTTACTCTACTCTGTAAACGGTTCTGGTCATTTCTGTGG
CGTTGCAGAAATGCTCACTCAGATTGACTACAGCAAGCGTGCTGGTGTTTGGGCTCAGGA
TAAGTGGAAAGGAAAGTTTCAGGTGAAATGGATTTATGCGAAGGACGTTCCTAACAGCCA
GCTTCGTCATATTCGTCTTGAAAATAATGAGAATAAACCGGTGACAAACTCACGTGACAC
TCAGGAGGTTCCTGCAGAGAAAGGAAGACAAGTTCTTAAAATCATTAGTAGCTATAAACA
TCAAACAAGTATATTTGATGACTTTTCACATTACGAACGCCGTCAAGTGGAAGAAGAAGG
TCTTCGTCAAAAACGTAATGAACTGAGATCTCGGGACAATCACAAAGAAAAACAATCAGC
TCATCCAGACCAAGCGTCGCCAAAAAATTAATCAATTAGTTTTGTTAGTATGCCTAATTT
AGTTTGTCACCACTGCTTAGCTGGAAACTTAATTTGTTTGTATAATATGAAGTGATTGTA
TTCTTTATTTCATTATGGCGTCTCGGTTTGGGCTGTTGTTGTGGAAATTTCAAACGTTGT
GGTGGAAAATGTAAATTCTTTGCATGGTCATTTTACCTTAAAAAGAACACAATTATTGGT
TAGTAGGGACTAAGGGTTACTAACTATGCGATGCCAGACCGTCCTACTACAAATATAAAA
TAATAAGAATGAACCACACCACAGATAATCATGATCATTTGTGCCTCATAACAAAGTTAT
TCAGTGCCACCACAATAATACCATCATTCGTAATCCATGCATAGTAGCGTAAGATCTCAT
TAGTTTGAATATTCGTTGTAAAATATTTATTGTTTTCTTGGTATCTGTAATAATGATGAG
TGTCAAATCCTTGTTCCAACATACAAGGCAATCACTTGACCTTCATCTTCATTGAAAATT
ATTGGAACTATGCTAATAATTATGTAATGAAGTTACTTGCAAATTATTATGTAAATATAA
TCTTGGGCTTCGTTATCATCACAGCACGATGTGTGCAACCGCTGAAGTTTTCAGTGTTTT
ATTTCGTAGGTTGTTCTGTTCGTGTGTATTGGTTCCACTAAATTTCTATCGTATAACGAA
ATTAACATAATATAAATTC
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| YTHD1_HUMAN | 42.584 % | 402 | 3.76E-133 |
| YTHD2_HUMAN | 42.813 % | 420 | 6.28E-140 |
| YTHD3_HUMAN | 63.927 % | 301 | 6.71E-94 |