Aniseed - Transcript Card

Transcript 'KH2012:KH.C3.389.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C3.389.v1.A.nonSL4-1

Possible name(s)

RAB14; RAB2A; RAB2B

Gene model

KH2012:KH.C3.389

Location

KhC3 [5,037,365 / 5,040,495]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 216

>KH.C3.389.v1.A.nonSL4-1
LFAMSYAYLFKYIIIGDTGVGKSCLLLQFTDKRFQPVHDLTIGVEFGARMITIDGRQIKL
QIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRDTFNHLTTWLEDARQHSSSNMVIMLI
GNKSDLEARREVKKEEGEAFAREHGLIFMETSAKTAANVEEAFINTAKEIYEKIQEGVFD
INNEANGIKLGPQHSPASGGSGSNRPRQSSDGGGCC

Nucleotide sequence

Length: 1,566

>KH2012:KH.C3.389.v1.A.nonSL4-1
ATGTTTTATTTTGCAGACTTTTAGCAGTTAAATTTAATTAAATTTCAGATTTTTGTAATT
ATTTGCGATGTCGTATGCTTACCTATTTAAATACATCATCATCGGTGATACTGGTGTCGG
TAAATCATGTCTGCTACTTCAGTTTACCGACAAAAGATTTCAACCAGTTCACGATTTAAC
TATAGGTGTTGAGTTTGGTGCAAGAATGATAACAATTGATGGGAGACAAATAAAGTTACA
GATATGGGATACGGCTGGACAAGAATCCTTTCGTTCAATCACACGATCATATTACAGAGG
AGCAGCGGGAGCTCTACTTGTTTATGATATTACTCGGAGAGATACATTCAACCACCTCAC
AACTTGGTTGGAGGATGCAAGACAACATTCTTCCTCAAACATGGTCATCATGCTGATTGG
TAACAAAAGTGATTTGGAAGCAAGAAGAGAGGTAAAAAAGGAGGAGGGTGAAGCATTTGC
ACGAGAACATGGGCTTATATTCATGGAGACCTCTGCTAAAACAGCTGCAAATGTTGAAGA
AGCTTTCATCAACACAGCAAAGGAAATCTATGAAAAAATACAAGAGGGAGTCTTTGACAT
TAACAATGAGGCAAACGGCATAAAACTTGGACCTCAACATTCACCTGCATCAGGGGGTAG
CGGAAGTAATCGACCGCGACAGTCTTCTGATGGAGGTGGATGCTGCTAATTATTATTCAA
TGCAAGCTACTGATATGGGTGCTGAAAGACGCTGGTACACACCATTATTATGCTTATATT
ATGCGGTCCATGGTTGTGCAGAAAAAAACATGTTTTCTGGTATGTGCAATTCCTTTCTTA
CTCATAAAATCTTCTTCACAGCAATTTTTAAGTTCCTATGCTGTGCTCATTCACCCATGC
AACTCTTTGAAGTGATGCAACTTTTTTGTTAAAGTTGACTTTCTGTGCCACAATGTAAAT
CAAAGATGTGACCAATTTAGTTGTAGATCTCTTAGATAGATGGAAAATGTAGATTGCACT
TTGTGACCAATATGTACATTCTAATTTGATTATTTGGTGTAATAATTTCAGAACTATATT
TTCAGTTAAACAAAACAAAAATCTTAACCAAAATATCAGACATTTAAAGCTTGGTTCGCA
AAACATTGCTGGTTCTAATAAGTAATCGTTTTGTACACATTTGATAGAAACTGTGTACTG
ACATGCTTTTTTGACACGTGTACATAGCGGCGTTATTGTTGTCTCATAGATTTCCGAATA
TTTATTGTATGTTTTAGACACTATTTTGTCCAATTGTTGTACCCAGTAAACCTTGTATTG
TGGTTATGAAAGTGCCATTATCAACGAATGTCTTATTTTCGAAAGATAACAGTATATAAA
CTTAATTTGGATATTAACTATTATTGCCATTTTTCATGACCATTTAGGACTACAAACAAC
AAGTAAATTTTGTAACTAACCAGATTTCAAAATATGATTCGTGTGCCCATTACTTCGTCA
CCCATTTGTAAAATACTTTCTTCGTGGGTGCTTCAGAGCAGTCTTAATAAAATGTTTTGA
TGTTCA

InterProScan

SUPERFAMILY	P-loop_NTPase (IPR027417) - T[5-185] 3.71E-59
TIGRFAM	Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[10-164] 7.8E-33
Pfam	Small_GTPase (IPR001806) - T[11-171] 1.0E-62

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
RAB2A_HUMAN	89.671 %	390	1.53E-140
RAB2B_HUMAN	84.722 %	382	3.02E-137
RAB14_HUMAN	59.155 %	266	3.4E-91