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  1. Transcript 'KH2012:KH.C4.76.v1.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C4.76.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

LINS1

Location

KhC4 [758,920 / 760,993]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 539

>KH.C4.76.v1.A.ND1-1
QIFKAKNYNKTKIWTFVNAATTKYDVNSEKLNMESQELCCQTSNFDVHIVYKLLLKYQQQ
NNYFSLSHHCKGLCNSLSHLLHTHKSLQNPGKQWLCISSILLHFTILEKLFLLLNQCSDY
LSNCTVQCPLLLRTLLEFTKLGSPIVYYSSFKTIEVVLCTLKKHEHCHVVFYSQLTSAYQ
WIQELNLHESENVDTINISCSFYAKVVKNVENEEELIKQPHLANMKWLSNMLSKVCEPTS
IQFLELCRIIYSIPGKSSHFHSYMLQLYNVLLGRLTNISYTTRPYCIALLKDFLPCQPCV
EKGYEMVANTLLKTVQKFLNAIEYEYSESEVVKIHFGGYELQENCAYPMTASECIDLINS
CLRASAIICCACPSDINTCISQDRHILSLLFPFPKMSTILSKMLDLFMEQDDGLMEFLLL
HLQTFIKCVQFKIYLFDPHEAFISLQIKLSFDFSVLLDWLMSNETDFLLYFVKYLKYLQT
SPERFCDSCKIMGHVKHQVLNELANLKLRIAKLHMKELFPYNPQPLIKNLENVIKLTRL

Nucleotide sequence

Length: 2,016

>KH2012:KH.C4.76.v1.A.ND1-1
GCGCAGCTTGTAGTTGGTTTTGGTTGGTCTTACTCATAGCTTATGAAGCAGATTTTGAAA
TATCGAGTACGTTCGAACCGAAGTACTAGTTGGTTGTTTAATTAGATAACAATATTTATG
TAAATTTTTGTTTTTGTGCGATAGCATTAAATAAGTTTTGCAAAAATGTTTTTGCAATTT
TACTTGGACGAAAACGGTAAACGCGTGTATACTTTAAAAAAGGAAAATCCCACCGACGGT
TCAACTCCAACCAAGTCCGCACACCCAGCAAGGTTTTCACCCGATGACAAATATTCAAGG
CAAAGAATTATAATAAAACGAAGATTTGGACTTTTGTTAACGCAGCAACCACAAAGTATG
ATGTAAATAGCGAAAAGTTAAACATGGAAAGTCAAGAACTATGTTGCCAAACGTCTAATT
TTGATGTACATATTGTATATAAACTTTTGTTAAAATATCAACAACAAAATAATTATTTTA
GTCTTAGCCATCATTGCAAAGGCTTGTGTAACAGCTTATCACATTTATTGCATACACATA
AGTCTTTGCAAAACCCTGGGAAACAATGGCTATGTATTTCATCAATATTATTACATTTTA
CAATACTTGAAAAACTGTTTTTGTTGCTAAACCAATGTAGTGATTACCTATCTAATTGTA
CTGTCCAGTGTCCACTGCTTTTGCGTACCTTACTGGAATTCACCAAACTGGGTTCTCCTA
TAGTTTACTATTCATCTTTTAAAACAATTGAAGTTGTATTGTGTACACTAAAAAAACATG
AGCACTGCCATGTTGTTTTTTATTCTCAGTTAACCAGTGCTTATCAATGGATACAAGAAT
TAAATCTTCATGAAAGTGAAAATGTGGACACCATTAACATATCATGCAGTTTTTATGCTA
AAGTTGTAAAAAATGTGGAGAATGAAGAGGAATTGATAAAACAGCCACATTTGGCAAACA
TGAAATGGTTGTCCAATATGTTAAGCAAAGTATGTGAACCTACTTCCATTCAGTTTTTGG
AATTATGTCGTATTATTTACTCTATTCCTGGAAAGTCAAGCCATTTCCATAGTTATATGT
TGCAGTTATACAATGTCCTTCTTGGGCGGCTCACAAACATTTCTTATACTACAAGACCTT
ATTGCATAGCTCTTTTGAAAGATTTTCTACCATGCCAGCCCTGTGTGGAAAAGGGTTATG
AAATGGTGGCTAACACGCTTCTTAAAACTGTTCAAAAATTTCTAAATGCAATTGAATATG
AATATTCTGAAAGCGAAGTGGTCAAAATCCATTTTGGTGGGTATGAGTTGCAGGAAAATT
GTGCCTATCCAATGACTGCATCAGAATGTATTGACCTTATCAATAGTTGCCTTAGAGCAA
GTGCCATCATATGTTGTGCATGCCCTTCAGATATCAACACATGCATATCGCAAGACCGAC
ATATATTATCACTCCTGTTTCCCTTTCCTAAAATGTCAACCATTCTTTCTAAAATGTTAG
ACCTTTTTATGGAACAAGATGATGGGTTAATGGAATTCTTGTTGCTTCATCTGCAAACGT
TTATCAAATGTGTTCAGTTTAAAATCTATCTATTTGATCCACATGAAGCATTCATCTCTC
TTCAGATCAAACTCTCATTTGACTTCTCGGTCTTGTTAGATTGGCTGATGTCAAATGAAA
CGGATTTTCTTTTATATTTTGTGAAATACCTAAAATACTTACAAACCTCTCCTGAAAGAT
TTTGTGATTCATGTAAGATAATGGGGCATGTAAAACACCAGGTTTTAAATGAACTTGCAA
ACCTAAAACTACGTATTGCCAAGTTGCATATGAAAGAATTGTTTCCTTACAATCCGCAAC
CCCTGATTAAGAACTTAGAGAATGTCATTAAATTAACTCGCTTGTAACAATTTTTGTATT
AAATTTAACATTGAGATGCATGATTGATAAAATATTTCAGGTCATGACATGTTCTTTTGA
GATCTTGTGCTATAGCCTGTAACACAATAAAAACAA

InterProScan

PANTHER
Protein_Lines (IPR024875) - T[31-536] 2.0E-32
Pfam
LINES_N (IPR032794) - T[294-489] 2.3E-16
Pfam
Lines_C (IPR029415) - T[503-533] 3.6E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value