Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C4.9.v2.A.nonSL3-1

Possible name(s)

B3GALNT2; B3GALT6

Gene model

KH2012:KH.C4.9

Location

KhC4 [3,744,938 / 3,746,233]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 262

>KH.C4.9.v2.A.nonSL3-1
LKVLPLKIIIAPKMDNPTNAHNMNTLVCVECQEKAQRLYSKFPESGNLKIEHCVKCGKPV
DKYIEYDTTLLLLDLLLLNKAAWRHVLYNSDIGYLHWKLVAVCLFCDGYMKWVMSANKAS
AKVVESEDLVFLAAKQVELYVLTFISFLEFIVFLSATVLSHYILTFCSSKIETVSLTSVV
RCVVLAGTGKLLFIPAIIWAQSDTGTYLQLIVLYVLFCSALSLSIVTHRNSIVTFLIITC
AFLVSEPLIKPISDWLLSQKFH

Nucleotide sequence

Length: 1,040

>KH2012:KH.C4.9.v2.A.nonSL3-1
CTCTTTTAAAGTGTGGCGAATGCTATCGAAGGTATCTGCGCTTTCAGCTGTGATTGCTTT
TGTTGCTGTGTTAATCTGCATTTGGAAATTTGATGATTCTGGCAGCGAGGAACGTACAAG
CTACAAGTTAGTCCTTGGGATTTTGTCAGCACGTGACCATTTCAAGGAAAGACAAGTTAT
AAGGGAAACCTGGATGAAATTAGTGACTCAAAGTTCTTCCCTTAAAAATAATCATTGCAC
CTAAGATGGATAACCCAACAAACGCACACAATATGAACACGCTGGTATGCGTTGAATGCC
AAGAAAAAGCCCAACGACTTTATTCAAAATTTCCTGAAAGCGGTAACTTGAAAATTGAAC
ACTGTGTAAAATGCGGCAAGCCAGTTGATAAATACATTGAATATGATACTACTTTGCTGT
TGTTGGATCTATTGCTGCTTAATAAGGCAGCATGGCGCCATGTACTGTACAATTCTGACA
TTGGGTATCTGCATTGGAAGTTAGTGGCTGTGTGCTTATTCTGTGACGGTTACATGAAAT
GGGTAATGTCTGCTAACAAAGCCTCAGCCAAAGTTGTTGAATCAGAAGACCTTGTATTTC
TTGCTGCAAAACAAGTAGAACTTTATGTGTTGACATTTATATCATTTCTTGAATTTATTG
TGTTTTTAAGTGCAACTGTTCTCAGTCATTACATTTTAACGTTTTGCAGTAGCAAAATAG
AAACTGTTTCCCTGACTTCTGTTGTACGTTGCGTGGTGTTGGCTGGAACTGGAAAGTTAT
TGTTTATTCCAGCAATAATTTGGGCACAATCTGATACTGGGACTTATTTACAGTTGATTG
TGCTTTATGTCCTTTTTTGTAGTGCCTTGTCATTAAGCATTGTTACTCATAGAAATTCCA
TTGTAACTTTTTTGATAATCACATGTGCGTTCTTAGTATCTGAACCTTTGATAAAACCTA
TTAGTGATTGGTTGCTGTCACAAAAATTCCATTGAATGCATTGTCATTTGAATGTTTTGT
AGTTTTCTGCATTAAATTAA

InterProScan

PANTHER	Arv1 (IPR007290) - T[26-253] 1.1E-34
Pfam	Arv1 (IPR007290) - T[27-220] 3.2E-36

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
ARV1_HUMAN	30.804 %	108	2.03E-28