Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C6.105.v1.A.ND3-1

Possible name(s)

TSPAN5

Gene model

KH2012:KH.C6.105

Location

KhC6 [73,716 / 78,927]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 372

>KH.C6.105.v1.A.ND3-1
FGFYNFTMGVINDDLPPNYDDVTIQVPTDSVQPDTQTQIGDPSTRNHVRFANSNRVVEIE
RLPDSISNMENCMKSLKRMLCLECCDTNTRRKPEIIIIVSFIIMMIVGFVQLGIGLASVV
EGSAVSILSGILSLNTFGICMVIGGVLLSLLSLLTLKTIITTTDTLNLSMTGLRTLLIGY
IYILLFAGASAIIVSEFTNQDFVSKVILGINDTLTGHTVSSGWSEMQERWECCGTTSYTD
WKYSKWAKNIYRTNNLNSSYAVLPNSCLIDFRSKRHCVALVGRKVANGEGYVVLSGIKPL
IDCAFSFNPRYEYIYATTCATYYVPYLTSLMRSMLITDLCLLFVVFLLFILLYNVASHLP
SRQRVAAYSVQT

Nucleotide sequence

Length: 1,585

>KH2012:KH.C6.105.v1.A.ND3-1
TTTAATTGGTTAAATACATAATTCTTTAAGTGTACTCGCATGGATATAAAACGACTACTC
AAAAACCTTGGCAATTCAGTATAATTTGGATTCTATAACTTTACCATGGGAGTTATAAAC
GACGATCTTCCGCCGAATTATGACGATGTCACGATTCAAGTTCCAACTGATTCAGTACAG
CCAGATACACAAACTCAAATTGGTGATCCATCGACGAGAAATCACGTGAGATTTGCTAAC
TCCAATAGGGTCGTTGAAATTGAAAGATTACCAGATTCTATAAGTAATATGGAAAACTGC
ATGAAATCGTTGAAACGAATGCTGTGCCTTGAGTGCTGTGATACCAATACTAGAAGAAAG
CCAGAAATAATCATAATTGTCAGTTTTATTATTATGATGATCGTTGGATTTGTTCAATTG
GGAATTGGGCTCGCTTCTGTCGTCGAGGGGAGCGCCGTATCTATTCTTTCAGGAATTTTA
TCACTAAATACATTCGGAATATGCATGGTTATAGGAGGTGTCCTACTTTCCCTGCTTAGT
CTCCTTACTCTAAAGACGATAATAACTACAACGGACACATTAAATCTGAGTATGACTGGA
CTTCGTACCCTACTTATCGGGTACATTTACATTTTGTTATTTGCTGGAGCATCGGCTATT
ATTGTCTCGGAGTTTACGAACCAAGACTTTGTCAGTAAAGTTATTCTCGGAATAAACGAC
ACTTTAACTGGACACACAGTAAGCTCTGGATGGTCAGAAATGCAGGAACGCTGGGAATGC
TGTGGTACTACTTCATATACAGACTGGAAGTACAGTAAATGGGCAAAAAATATCTACAGA
ACTAATAACCTAAATAGTTCCTATGCTGTACTACCAAACTCATGCCTTATTGACTTTCGA
AGCAAACGACATTGCGTTGCACTCGTTGGCAGAAAAGTTGCAAATGGCGAAGGATATGTC
GTCTTGTCAGGTATAAAACCACTGATAGACTGCGCTTTTAGCTTTAATCCACGATATGAG
TATATATACGCGACAACTTGCGCTACTTATTATGTACCATACCTTACATCTCTAATGAGA
AGCATGCTAATTACTGATCTTTGCTTGCTTTTTGTTGTTTTTTTGCTCTTTATTCTGCTT
TATAATGTGGCTTCACATCTCCCAAGCCGCCAACGGGTTGCAGCATATTCTGTACAGACA
TGACAAATTGATATTTTAATTTTTAAGTGAAACACTTTTTGTTACCACACTTCATGGAAA
CTACAGCTGTGACTGTGATTTAAATGCCTTTAAAAGCAGAAATCACATTTTTATGCACTT
TTATACAAATCACTGTGTATAGAATAGGAGTTCCAGTTTAATATACCGTCAAAAGCATTG
ATTCACTGTTAATATGTTGCAATTGCATCTTTTTTTAGTCTTGAGTAATCTATAAAAGCA
TGTTATTCAAAAAATGGTGCCTACAAATAATGTAATCAGATTAAAAATATGCCTGAAAAA
AGCGAATGCATAATAAGTCAATTATCAGCCTAAATTTAAACACCACTAGTATTGTACGAA
ACATGAATAAAATAGTTCAAGAGGT

InterProScan

Pfam	Tetraspanin/Peripherin (IPR018499) - T[96-351] 1.5E-10
SUPERFAMILY	Tetraspanin_EC2_sf (IPR008952) - T[199-269] 9.15E-7

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value