- Transcript 'KH2012:KH.C6.257.v1....'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C6.257.v1.A.SL3-1
Possible name(s)
LPAR2; S1PR1; S1PR2
Gene model
Location
KhC6 [429,127 / 445,720]
Amino acid sequence
Length: 501
>KH.C6.257.v1.A.SL3-1
RCINTKMATTPILPSDFIFFDQVNSTTVLPPGNYAANVSTDIDLGSSFNQTQGNICEPIN
NPPLIITAGIISMAVIIGNGLVILAIIGGNSRFFRPMYWFIVHLSFSDLLVGLMLLWNYC
LAGIFNINNTLTSLSFLFGIWVTSACCSVFGILLLAIDRYMQVVHKALHKLYFNQFTVGL
SIFLSWLIPLLGFLVIPISLNLSCKDTCRCIEGKYMECKPVTICSQIIPPYTKNYVLAVA
MYLFLIMPWPILIYSLIFIKARRSTQVLRQKLRTRDIRLIHTLVVIMVVLIVTITPSGVI
LIIVXXXXXXXXXXVDYTFYIVVIATLNSLANPVLYIWRITAIRVSLQRRFWCFFSPPKH
PGIESRSSRIGKKTTDRFNSDVVSVDVSEANHRPTERFLFCGRTMFTSNVSDISQESTPD
SQRGSAHKSPWSRNKHGLSVELQPVLNPKPSTHSPLCQNVVVEEVWRENNSHLSSRSTFR
TKRVSSGSNIDEELPLRPVQN
Nucleotide sequence
Length: 2,256
>KH2012:KH.C6.257.v1.A.SL3-1
TTTTATTTCAGAGTCACATTTTATAGAGATGTATTAATACAAAGATGGCTACTACACCCA
TTTTACCGAGTGATTTTATATTTTTTGATCAAGTAAATTCTACAACAGTGTTGCCACCAG
GAAATTATGCAGCTAATGTAAGCACTGATATAGATCTGGGCTCTTCATTTAATCAGACGC
AGGGCAACATATGTGAGCCAATTAACAACCCTCCATTAATAATAACAGCTGGAATAATAT
CAATGGCTGTCATTATTGGAAATGGGCTTGTCATTCTCGCTATTATTGGCGGAAATTCAA
GGTTTTTTCGCCCTATGTACTGGTTCATAGTTCACTTAAGCTTCTCAGACTTGTTAGTTG
GTTTAATGTTGTTGTGGAATTACTGCCTGGCCGGCATTTTCAACATTAACAACACATTAA
CAAGTTTATCATTCTTATTTGGTATTTGGGTAACCAGTGCATGCTGTTCTGTGTTTGGTA
TTCTGTTACTTGCAATAGACAGGTATATGCAGGTTGTTCACAAAGCTTTGCATAAGTTAT
ACTTCAACCAATTCACTGTCGGTTTATCCATATTCTTATCATGGCTGATTCCTTTGCTTG
GTTTCTTGGTAATCCCAATCTCACTAAATCTTTCTTGCAAAGATACATGCAGATGCATTG
AAGGAAAATACATGGAGTGCAAACCAGTGACAATATGCTCGCAAATTATACCGCCCTACA
CAAAGAACTATGTCTTAGCAGTGGCGATGTATTTATTCCTAATAATGCCTTGGCCAATCC
TAATTTACAGTCTTATATTTATTAAGGCAAGGAGAAGTACTCAAGTTTTGCGTCAAAAAC
TTCGTACGAGAGATATACGTCTCATACACACTCTAGTGGTGATTATGGTCGTTCTTATTG
TAACAATCACACCGAGTGGAGTTATTTTAATAATCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNTTGTGGATTACACGTTCTACATTGTCGTAATTGCCACGTTAAACTCACTCGCAA
ATCCTGTGCTTTATATATGGAGGATAACGGCGATCCGTGTCTCGCTCCAGAGGAGGTTCT
GGTGTTTTTTCTCCCCTCCAAAACATCCCGGGATCGAGAGCAGATCTTCCAGGATTGGGA
AGAAAACAACTGACAGGTTCAACTCCGACGTAGTAAGCGTTGATGTCTCTGAAGCTAACC
ACAGACCAACCGAGCGCTTCCTTTTCTGCGGACGTACCATGTTCACGTCAAATGTTTCCG
ATATAAGCCAAGAATCAACTCCCGATTCCCAGAGGGGCAGTGCGCATAAGAGCCCTTGGT
CGCGTAATAAACACGGTTTATCTGTCGAGCTTCAGCCGGTTTTGAACCCGAAACCCTCCA
CTCATTCCCCATTATGTCAGAATGTAGTGGTTGAAGAAGTTTGGAGGGAGAATAACAGTC
ATTTGAGTTCCCGCTCAACTTTTCGTACGAAGCGAGTCAGTTCGGGATCAAATATCGATG
AAGAACTTCCGTTGCGTCCTGTGCAAAACTGAGGTCATGTGACATGATATGCTTTAGTGA
GCATGAGGTCATGTGACTTGTCATGGTTCAGTGAGCGTGGGGTCATGTGACTTGTCATAG
CTCACCATTTTAGCACTCTAGCTTTCCTAGTGGTCATTTTATGTCCGCGTTTAATTTATC
TTTAAATTTTACCGCATAAATTTTAAAAGTGCAATGTATACCATAAATCTAACTTCTAAA
GAAACTAATTTATTTATTGTATGAAAAAACTGAAACTACCAAATTACGCAACCAAAGATA
AAAAAAGCACATAAGTTCCTTATACCAAACGTCCTAGTTAAATGTTTTTACATTTATTCT
TGCCTTGCGTACTATTACACAACATTGCTGTTTTTAATGTTCCAAATACGAGTTTCATTT
TCCCAAATATTTTTGATTTTTTTAAACATTTTTTTCAGTGCCCTTATTTTTTGCATAGTT
TTTTCCTATAAATGGCTGCTTCATGTATATTTAAAACTAGTTTTAAACTTGATTTTGTGC
TTTTTTACCTTGTATTTTTGTCATACATTCGGTAAAAGTACTTTTTTTGATGAAGTTTTT
GCCTTTTACAATATCAATGCATAATCAAGTCTATTTTTATTGATCAAACAACAATATTCC
TTTTTTAGTTTAAAATTTTATGTTTTCATTATTGCCCCAGCCCCAATTTGGAACTGAATA
AAGAATTATGAAAACCAGTGCTTCTCAACCCCAAAA
| PRINTS |
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[63-87] 3.9E-17 - T[97-118] 3.9E-17 - T[141-163] 3.9E-17 - T[279-303] 3.9E-17 - T[318-344] 3.9E-17 |
| Pfam |
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[78-336] 4.5E-16 |
| ProSiteProfiles |
GPCR_Rhodpsn_7TM (IPR017452) - T[78-336] 23.381 |
| ProSitePatterns |
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[147-163] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| S1PR1_HUMAN | 25.946 % | 85.9 | 4.0E-18 |
| S1PR2_HUMAN | 27.729 % | 90.9 | 6.93E-20 |