Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S11...'
  2. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S11...'
  3. Transcript 'KH2012:KH.C6.257.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C6.257.v1.A.SL4-1

Possible name(s)

LPAR2; S1PR1; S1PR2

Location

KhC6 [429,127 / 445,709]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 501

>KH.C6.257.v1.A.SL4-1
RCINTKMATTPILPSDFIFFDQVNSTTVLPPGNYAANVSTDIDLGSSFNQTQGNICEPIN
NPPLIITAGIISMAVIIGNGLVILAIIGGNSRFFRPMYWFIVHLSFSDLLVGLMLLWNYC
LAGIFNINNTLTSLSFLFGIWVTSACCSVFGILLLAIDRYMQVVHKALHKLYFNQFTVGL
SIFLSWLIPLLGFLVIPISLNLSCKDTCRCIEGKYMECKPVTICSQIIPPYTKNYVLAVA
MYLFLIMPWPILIYSLIFIKARRSTQVLRQKLRTRDIRLIHTLVVIMVVLIVTITPSGVI
LIIVXXXXXXXXXXVDYTFYIVVIATLNSLANPVLYIWRITAIRVSLQRRFWCFFSPPKH
PGIESRSSRIGKKTTDRFNSDVVSVDVSEANHRPTERFLFCGRTMFTSNVSDISQESTPD
SQRGSAHKSPWSRNKHGLSVELQPVLNPKPSTHSPLCQNVVVEEVWRENNSHLSSRSTFR
TKRVSSGSNIDEELPLRPVQN

Nucleotide sequence

Length: 2,245

>KH2012:KH.C6.257.v1.A.SL4-1
AGTCACATTTTATAGAGATGTATTAATACAAAGATGGCTACTACACCCATTTTACCGAGT
GATTTTATATTTTTTGATCAAGTAAATTCTACAACAGTGTTGCCACCAGGAAATTATGCA
GCTAATGTAAGCACTGATATAGATCTGGGCTCTTCATTTAATCAGACGCAGGGCAACATA
TGTGAGCCAATTAACAACCCTCCATTAATAATAACAGCTGGAATAATATCAATGGCTGTC
ATTATTGGAAATGGGCTTGTCATTCTCGCTATTATTGGCGGAAATTCAAGGTTTTTTCGC
CCTATGTACTGGTTCATAGTTCACTTAAGCTTCTCAGACTTGTTAGTTGGTTTAATGTTG
TTGTGGAATTACTGCCTGGCCGGCATTTTCAACATTAACAACACATTAACAAGTTTATCA
TTCTTATTTGGTATTTGGGTAACCAGTGCATGCTGTTCTGTGTTTGGTATTCTGTTACTT
GCAATAGACAGGTATATGCAGGTTGTTCACAAAGCTTTGCATAAGTTATACTTCAACCAA
TTCACTGTCGGTTTATCCATATTCTTATCATGGCTGATTCCTTTGCTTGGTTTCTTGGTA
ATCCCAATCTCACTAAATCTTTCTTGCAAAGATACATGCAGATGCATTGAAGGAAAATAC
ATGGAGTGCAAACCAGTGACAATATGCTCGCAAATTATACCGCCCTACACAAAGAACTAT
GTCTTAGCAGTGGCGATGTATTTATTCCTAATAATGCCTTGGCCAATCCTAATTTACAGT
CTTATATTTATTAAGGCAAGGAGAAGTACTCAAGTTTTGCGTCAAAAACTTCGTACGAGA
GATATACGTCTCATACACACTCTAGTGGTGATTATGGTCGTTCTTATTGTAACAATCACA
CCGAGTGGAGTTATTTTAATAATCGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTG
GATTACACGTTCTACATTGTCGTAATTGCCACGTTAAACTCACTCGCAAATCCTGTGCTT
TATATATGGAGGATAACGGCGATCCGTGTCTCGCTCCAGAGGAGGTTCTGGTGTTTTTTC
TCCCCTCCAAAACATCCCGGGATCGAGAGCAGATCTTCCAGGATTGGGAAGAAAACAACT
GACAGGTTCAACTCCGACGTAGTAAGCGTTGATGTCTCTGAAGCTAACCACAGACCAACC
GAGCGCTTCCTTTTCTGCGGACGTACCATGTTCACGTCAAATGTTTCCGATATAAGCCAA
GAATCAACTCCCGATTCCCAGAGGGGCAGTGCGCATAAGAGCCCTTGGTCGCGTAATAAA
CACGGTTTATCTGTCGAGCTTCAGCCGGTTTTGAACCCGAAACCCTCCACTCATTCCCCA
TTATGTCAGAATGTAGTGGTTGAAGAAGTTTGGAGGGAGAATAACAGTCATTTGAGTTCC
CGCTCAACTTTTCGTACGAAGCGAGTCAGTTCGGGATCAAATATCGATGAAGAACTTCCG
TTGCGTCCTGTGCAAAACTGAGGTCATGTGACATGATATGCTTTAGTGAGCATGAGGTCA
TGTGACTTGTCATGGTTCAGTGAGCGTGGGGTCATGTGACTTGTCATAGCTCACCATTTT
AGCACTCTAGCTTTCCTAGTGGTCATTTTATGTCCGCGTTTAATTTATCTTTAAATTTTA
CCGCATAAATTTTAAAAGTGCAATGTATACCATAAATCTAACTTCTAAAGAAACTAATTT
ATTTATTGTATGAAAAAACTGAAACTACCAAATTACGCAACCAAAGATAAAAAAAGCACA
TAAGTTCCTTATACCAAACGTCCTAGTTAAATGTTTTTACATTTATTCTTGCCTTGCGTA
CTATTACACAACATTGCTGTTTTTAATGTTCCAAATACGAGTTTCATTTTCCCAAATATT
TTTGATTTTTTTAAACATTTTTTTCAGTGCCCTTATTTTTTGCATAGTTTTTTCCTATAA
ATGGCTGCTTCATGTATATTTAAAACTAGTTTTAAACTTGATTTTGTGCTTTTTTACCTT
GTATTTTTGTCATACATTCGGTAAAAGTACTTTTTTTGATGAAGTTTTTGCCTTTTACAA
TATCAATGCATAATCAAGTCTATTTTTATTGATCAAACAACAATATTCCTTTTTTAGTTT
AAAATTTTATGTTTTCATTATTGCCCCAGCCCCAATTTGGAACTGAATAAAGAATTATGA
AAACCAGTGCTTCTCAACCCCAAAA

InterProScan

PRINTS
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[63-87] 3.9E-17 - T[97-118] 3.9E-17 - T[141-163] 3.9E-17 - T[279-303] 3.9E-17 - T[318-344] 3.9E-17
Pfam
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[78-336] 4.5E-16
ProSiteProfiles
GPCR_Rhodpsn_7TM (IPR017452) - T[78-336] 23.381
ProSitePatterns
GPCR_Rhodpsn (IPR000276) - T[147-163] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S1PR1_HUMAN 25.946 % 85.9 4.0E-18
S1PR2_HUMAN 27.729 % 90.9 6.93E-20