Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C7.160.v1.R.ND2-1

Possible name(s)

FAM109A; FAM109B; RASGRF1

Gene model

KH2012:KH.C7.160

Location

KhC7 [4,931,713 / 4,934,292]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 230

>KH.C7.160.v1.R.ND2-1
FDRDPIGAIVLEESSVQLTEGGDSPYTFSIHFSGEESRVYKLTASNDEDCLGWIKALSNS
SYRYLEILVEGLEKEVGSYTSDCQLGETRRSLISSRSHGTASLSSGLELDENHFQISPKS
NSLANLADSENDLMNFDELSMKNERSPKLTRSASSDDFLKTNYLSVEGSKRGTSPKRGKR
TIKLSPRVGRKKNGKSMAKTNVFKHRNTISSTHKLSHRESLHVFRETSAI

Nucleotide sequence

Length: 1,666

>KH2012:KH.C7.160.v1.R.ND2-1
ATTCGACCGCGATCCGATTGGAGCCATCGTGCTCGAAGAGTCCTCGGTACAGCTCACTGA
AGGAGGGGACTCCCCGTATACTTTCTCCATCCACTTCAGTGGGGAGGAATCACGAGTTTA
CAAACTCACCGCATCCAATGATGAAGATTGCTTGGGATGGATCAAAGCTTTGTCTAACTC
AAGTTACAGATATTTGGAAATCCTTGTTGAAGGTTTGGAAAAAGAAGTTGGTTCGTACAC
CTCGGATTGTCAACTAGGAGAGACGAGGAGAAGTCTCATCAGCAGCAGGTCACATGGTAC
GGCTTCTTTATCCTCAGGTTTGGAATTAGATGAAAATCACTTCCAGATAAGCCCAAAGTC
GAACTCACTCGCCAACTTGGCAGACTCTGAGAACGACTTAATGAATTTTGATGAATTATC
GATGAAAAATGAGCGGTCTCCAAAACTAACTCGATCTGCCTCATCGGACGATTTTCTTAA
AACAAACTATTTGTCTGTTGAGGGTAGTAAGAGAGGGACTTCCCCTAAACGAGGAAAACG
AACCATTAAATTGAGTCCAAGAGTGGGGCGGAAGAAAAACGGGAAATCCATGGCAAAAAC
TAATGTATTCAAACATAGAAACACCATTTCCTCAACCCACAAGTTATCACACAGGGAAAG
TCTTCACGTTTTTAGAGAAACATCAGCAATATAGACAAGAAATTATTGATTTTATTGAAA
TTATTGAGTGATCTGTTTCTTATACAGAACATTTTATGTGCAATTTACAAGCTACCTATT
ATTTTGCTACCATGTTTATTGTGATGTCACATACAGGTTGTGTGCAGATAATGCAGGTTG
GGTCATTTGTGACTAGTTTTATGTCCTTCAAAATATTGCGATGTTATGGTTGGTAGAAAC
ATGTTTATTTTTAGTTATGTTGCATTTAGCTAAATTTAAGAAAAAGTTAGGCAAATTCAA
CAGTCCGAACTCATTCACTGGTTGTTTTTACCTTACACATTATATAGTGTTGACGCTGTT
TACAAGAATGAATCGTATATTTCTGTAATACCTGTTGTATCCGTGAGATTTTAAGTTTAA
AAAACAGTTCTTCAAACTATTTTCTATGGCCGCTAGACGACGCTAAAGGTGCGCGATGGG
TTGAACGTGGAAAAAATGTGTCGATTTTTATTAAATGTGAATGAAGTATTCGTATTGTTA
CATTATACTTAGTTTATTTCGCATAAGCATTGACCTTTTTCCAAGTGCAAATTATGACTC
ATTAAATATCAACCAATTAGCGATTGAATTGCTGTGACTCAGCCAATAGGAAACAAGTAT
CGGTATTTGAATTGGATTAACAACAAAACAAATGCAGCTGAAGTTTACGAATTACTTGCT
TATCCTGCGACTTTTATTGCAGCATTTGGCAAGTAAATCTAGCCTTAGGTGATATTTTGT
ATGCGTGCCAATACAACAACAATGGCGGTCGAATGCTGCACGCTTCGTATGTTTATAACG
TAGTAGTTTGGTCGAAATTATGCGTTACATTAAACCCAAGGTGTTGAAGGGCATATTTGT
TGTAAAACATCGGTATTGGGCTTGTAAATGATTGAAACGTGTTTGCTTTGCACGGTAATA
ACAATGTCAGCGTAGATTACACAATAAAAGTTTATGATGAAGTAAA

InterProScan

ProSiteProfiles	PH_domain (IPR001849) - T[1-62] 8.512
Gene3D	PH-like_dom_sf (IPR011993) - T[2-66] 2.8E-6
Pfam	PH_domain (IPR001849) - T[3-61] 3.5E-6

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value