Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C7.297.v2.R.ND2-2

Possible name(s)

SLC22A3; SLC22A4; SLC22A5

Gene model

KH2012:KH.C7.297

Location

KhC7 [12,448 / 15,083]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 439

>KH.C7.297.v2.R.ND2-2
FDLVCDQNYLNALSTSLFYVGMLVGSIVFGNSADRFGRKPVMITSFVFVLGCMLGVSLST
SVEMYMLFRTSTAIFLSGSNVGSFVYAMEILPQKWIGIFGVIYQGICTIGYMVLSAIAYE
WRDWREIMLASTAVSSPFMLFALIIPESPRWQFTNGIDKEAIKTTKNMAKWNGVVLTQED
WDRATKNADKNITIPKKYSSLDLFKTPGIRLVATKAMFVWFSTTALFYGLVLNTGALAGD
VFVNNVLGGVAGMSSMILCMLLMNRIGRRKLICSLLIIGSSCLLLSVVINQYKKANSGLE
TLSLAFAFAGRFGITGATEVMYPFIAEVFPTVIRGNGVGIASSCSRIGGILAPFVISLQH
YLTWLPDVVFAGLALMAGLVSLTLPETNGCGLMETIEEAEIFYKNRRFKDSSDGMVADVE
TLDNEVRNDLIESADTSVL

Nucleotide sequence

Length: 1,529

>KH2012:KH.C7.297.v2.R.ND2-2
AATTTTTAGTTTGACCTGGTATGTGACCAAAACTACCTAAATGCTTTATCAACATCTTTA
TTCTACGTTGGAATGCTGGTTGGGTCAATTGTATTTGGTAACAGTGCTGACCGTTTTGGG
CGTAAGCCAGTGATGATAACTTCATTTGTCTTCGTCCTGGGATGTATGTTAGGCGTGTCG
TTAAGTACTTCAGTTGAAATGTACATGTTATTCAGAACATCAACTGCAATATTTCTGTCT
GGCTCCAATGTTGGGAGCTTTGTTTATGCTATGGAAATCTTACCACAAAAGTGGATTGGG
ATATTTGGTGTGATTTACCAAGGGATTTGTACCATTGGGTATATGGTTTTATCTGCAATA
GCTTATGAATGGAGAGACTGGCGAGAAATCATGCTTGCTTCAACTGCCGTTTCATCCCCC
TTTATGTTATTTGCTTTGATCATTCCAGAGTCACCAAGATGGCAATTCACCAATGGAATT
GACAAGGAGGCCATTAAGACAACAAAGAATATGGCAAAGTGGAATGGGGTGGTTTTGACT
CAAGAGGACTGGGATAGAGCTACAAAAAATGCAGACAAGAATATAACTATTCCAAAAAAA
TATTCTTCTCTGGATTTGTTCAAAACACCTGGTATTAGATTAGTAGCAACAAAGGCAATG
TTTGTATGGTTCTCAACTACTGCGCTATTTTATGGTTTAGTATTGAATACTGGGGCTTTA
GCTGGAGATGTTTTTGTGAACAACGTTTTAGGTGGGGTTGCAGGAATGTCTTCCATGATC
CTTTGCATGTTATTGATGAATAGGATTGGAAGGAGGAAGTTGATTTGTAGTTTGCTAATC
ATCGGAAGTTCGTGCTTGCTTTTAAGCGTTGTTATCAACCAATACAAAAAGGCAAATAGT
GGTCTTGAAACTTTGAGCCTAGCTTTTGCTTTTGCTGGAAGGTTTGGAATAACAGGTGCT
ACTGAAGTGATGTATCCGTTTATTGCTGAAGTCTTTCCAACTGTTATAAGGGGAAATGGT
GTTGGAATTGCTTCAAGTTGTTCTCGCATTGGAGGAATTCTTGCACCTTTTGTGATATCT
TTGCAACATTACCTGACATGGCTGCCTGATGTTGTATTTGCTGGATTAGCATTAATGGCG
GGATTAGTCTCACTTACTCTTCCTGAAACCAATGGATGTGGATTGATGGAAACCATAGAA
GAAGCTGAAATATTTTATAAAAACAGGAGGTTTAAAGATTCCAGTGATGGCATGGTAGCC
GATGTAGAAACTTTGGATAATGAAGTTCGGAACGATCTCATTGAATCAGCAGACACATCC
GTTCTATAAAGTTGACAATGTGTTTTGCAATTACTGTTTTAAACACTAGTGGCTCTCTAA
ATCACTTTCAGTTACTACTCCTGTTTTAGTATTGTAGTCAAACTATTCATATTCATACAG
GAGTCTTTGAAATTTGTACTATTATTATACCTTCATTAAGAAAACACTTTGAAGTGGTGT
ATTAAAACACATGTGTAGTTACGGAGTAA

InterProScan

ProSiteProfiles	MFS_dom (IPR020846) - T[1-389] 24.415
Pfam	MFS_sugar_transport-like (IPR005828) - T[10-394] 1.0E-35
SUPERFAMILY	MFS_trans_sf (IPR036259) - T[12-386] 5.1E-43
CDD	MFS_dom (IPR020846) - T[12-385] 2.73127E-20

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
S22A5_HUMAN	32.419 %	211	1.51E-62
S22A4_HUMAN	32.401 %	203	1.36E-59
S22A3_HUMAN	31.592 %	196	4.33E-57