Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C7.447.v1.A.SL3-1

Possible name(s)

CHSY3; CSGALNACT1; CSGALNACT2

Gene model

KH2012:KH.C7.447

Location

KhC7 [2,076,543 / 2,079,020]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 474

>KH.C7.447.v1.A.SL3-1
KMRFLRGLNILRIMTGIMLGFLSRIAFEQLRGSTRLTVGTHMDNIKSLDCPKCPIDDHCT
LCEPTHVKNPTENIPSAYKPKGMYEVTRWLQFDEHYVYDIINEEPKIPLVGHWLEEVRAV
TQVAMDYINANRMLGQSWSLVKLHDGYLRRDALRGTEYILDVVVQPASHNFSYFINERMF
RVNLVHPLKSMGEAEEVRVQRHVEGRLKIIVPVKITSPGIVASIDNFVKSKPKPQVHLVL
VLFLGSNKKEISGYKNKLQELETKIKSHQKVNIQIYPVEGLYSYFKGVRYGIKKATISTD
VVLLATIEAAFTEQLYHHCQANAIPKKRVYFPIAFGQFNPDIIKKGMPPGKPKDVNKRDH
NKFTGYWMHDTFDFVCANQADMVGILNNLSSLGRRMGSTTEALGTKIYDAFLRSDIEVIC
AVEPGLYRTYGMTCSKGELTDKSYQHCMRTKAMSLGSKPALGILYINEVLQKKN

Nucleotide sequence

Length: 1,808

>KH2012:KH.C7.447.v1.A.SL3-1
TACTGCATTTTCTATTGTCAGTATATGCTAGGTTGTTTTAAAGGAATAATATAATGCATA
ACAGAGGGTTATGACCAAGATCCAATGCCTTATGTTTGAAAGCAACTTGAAGAAAGGAAT
AAAAGATGAGGTTTCTAAGAGGATTGAACATTCTACGTATTATGACCGGGATAATGCTGG
GTTTTTTAAGTCGGATTGCATTTGAACAATTAAGGGGTTCAACTAGACTTACTGTAGGGA
CCCACATGGATAACATAAAGAGCCTTGATTGCCCAAAATGCCCAATTGATGACCACTGTA
CACTGTGTGAACCTACACACGTCAAAAACCCTACAGAAAATATTCCGAGTGCTTATAAAC
CAAAGGGTATGTATGAGGTCACTAGGTGGCTTCAGTTTGATGAGCATTACGTCTATGACA
TCATAAATGAAGAACCGAAGATTCCGTTAGTAGGACACTGGCTTGAAGAGGTTCGAGCTG
TCACTCAAGTTGCAATGGATTATATAAACGCCAACAGAATGCTAGGGCAAAGCTGGAGTT
TAGTTAAATTACACGATGGATATTTAAGAAGAGATGCTTTGCGTGGTACGGAGTATATAC
TAGATGTGGTGGTGCAGCCCGCAAGTCATAACTTTAGTTATTTCATAAATGAGAGAATGT
TTAGGGTGAATCTTGTGCATCCCTTGAAGTCAATGGGTGAAGCAGAAGAAGTAAGAGTCC
AACGTCATGTGGAGGGTCGGTTGAAGATAATTGTACCAGTAAAGATTACCTCGCCTGGCA
TTGTGGCATCGATAGATAACTTTGTGAAATCAAAACCTAAACCCCAAGTTCACCTAGTGC
TTGTTCTATTTCTTGGAAGCAACAAAAAAGAAATATCTGGGTATAAAAATAAACTTCAAG
AACTGGAAACCAAAATTAAAAGCCACCAAAAAGTGAACATACAAATCTACCCTGTGGAAG
GTTTATACAGCTATTTCAAGGGGGTAAGATATGGAATAAAGAAGGCAACGATATCTACTG
ATGTTGTTTTACTTGCAACCATTGAAGCTGCTTTCACAGAGCAATTATATCATCACTGTC
AAGCAAATGCTATCCCTAAAAAACGAGTATATTTTCCTATTGCATTCGGACAATTCAACC
CAGACATTATTAAAAAAGGAATGCCGCCTGGGAAACCTAAAGATGTCAACAAGAGAGACC
ATAATAAATTCACAGGGTATTGGATGCATGACACTTTTGACTTTGTATGTGCTAATCAAG
CTGACATGGTCGGAATACTTAACAATTTAAGCTCTCTGGGCAGAAGAATGGGCTCGACTA
CAGAGGCACTCGGGACCAAAATATACGATGCTTTTTTACGAAGTGACATTGAGGTTATAT
GTGCAGTGGAGCCAGGGTTGTATAGGACTTATGGCATGACGTGTTCAAAAGGTGAATTAA
CAGATAAATCATATCAACATTGTATGAGAACTAAGGCTATGAGTCTCGGTTCAAAGCCCG
CGCTGGGTATTTTATATATAAATGAAGTTTTGCAGAAGAAAAACTGATTTTTTGAAAAAG
TAATTTTCTTGTTTCTTTTTAATATTATGCCAAAACATTGTGTATCTGTGTTTTAGTTTA
TGTGCCAATTTCCTTTTTAGTTAAATGGCTGCAACTGTAGTTAACTACATTTTTAAAGCA
TCGTAATATGGTGAAGCAATAATATATAGTTAAAAAAATATATTTTAATTATTGTGTGCA
ATTATTTTTGTCATACTGTCTAAATGCGATACTAATTAGAATTTGTTATTAAAAAAGCAT
CTTGCCAA

InterProScan

Pfam	Chond_GalNAc (IPR008428) - T[72-461] 1.8E-55

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CHSS3_HUMAN	21.973 %	85.1	1.73E-17
CGAT2_HUMAN	23.739 %	90.9	1.85E-19