- Transcript 'KH2012:KH.C8.342.v1....'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C8.342.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
HPCA; HPCAL1; NCALD
Gene model
Location
KhC8 [5,985,036 / 5,996,383]
Amino acid sequence
Length: 196
>KH.C8.342.v1.A.SL1-1
QVMGKQNSKLKPEDIRDLRAATEFNEHELQEWYKGFIKDCPSGNLTMDEFQKIYANFFPQ
GDASKFAAHVFRTFDSNGDSTIDFREFIVALSVTSRGNLEEKLKWAFSMYDCDGNGIISR
DEMLEIVRAIYKMVGAVMKMPEDESTPEKRTDKIFKQMDKNLDGSISLEEFVEGAKKDPS
IVRLLQCTPGSGGLGM
Nucleotide sequence
Length: 2,299
>KH2012:KH.C8.342.v1.A.SL1-1
CACAAGTCATGGGCAAGCAAAATAGTAAATTGAAGCCAGAAGACATTCGTGACCTCAGGG
CTGCTACTGAGTTTAATGAACATGAACTTCAAGAATGGTATAAAGGATTTATTAAGGATT
GTCCTTCCGGAAACTTAACTATGGACGAGTTCCAGAAGATCTACGCAAACTTCTTCCCAC
AAGGAGACGCCTCAAAGTTTGCAGCTCATGTCTTCAGAACGTTTGACTCAAACGGCGACA
GTACAATCGATTTTCGGGAGTTTATTGTTGCGCTGAGTGTCACTTCACGTGGAAATTTAG
AGGAAAAATTAAAATGGGCGTTCTCGATGTACGACTGCGATGGGAACGGGATTATTTCAA
GAGATGAAATGCTGGAGATAGTTAGGGCGATATACAAGATGGTAGGAGCAGTGATGAAAA
TGCCTGAAGACGAATCAACCCCAGAGAAAAGAACCGACAAAATATTTAAACAGATGGATA
AAAACTTAGACGGGAGTATTTCACTAGAAGAATTTGTGGAGGGGGCGAAGAAAGATCCAT
CTATCGTCCGTTTGTTGCAGTGTACCCCTGGCTCTGGTGGACTTGGAATGTGAAAAGCAA
TTTAAGACATTTTGTTTTAAAATGCTTTTTAAAAAAAAAAAAGATTTTTTTTAGATTTTT
GTTTGATTTTATCTAACATCAGGTAGTGAACGTGTATAGCCATTTGTGTCGTGCTCATTA
TTATTAATTGGATTCTATTCCTGTTTCATGTACGCTTAACCACACACTGGTTGGTACGCC
AATTGCCATAAAGATTTTTTGTTATTTTTCTGGTTAAAACCTATAAGCTGAAAGCTATGT
CGCAATTTTTGCTTATATTTTACAAAAAAAAATGATTTTTTTTCTCATCTTTTGTTGCTA
ATTTTAAGCATGAAATAACTGAAATTGATGTCATTCTATCTTTATATCATATATGAGTAG
TAATTGTTAAGCATAGGAGAACTTGCACATAACAAAACCTATCTGAAACATGGTCATCAT
TTGGACACTCTCCTATAGTTGAATTTGGATTGTAAATTAGCGTTTCATTTACACATGGGC
AAATGACTGAATGTGCAAGCAACACTTCTTGGATGTGAACCTTTCCCCAGACTTTCTCCA
GACTAAAGTTTTATTTTGTCACAATCCAACAGAATGCCTTAATTTTGGAAACTGTTTAAA
TTATAGAAAAAAGTTAAATTTTCAGCAGTTGGCAAACTTACTGGCTGTATACAAATTCTG
TTTATCAATCAAAATACAATATTTGTTACACAGTTTGGAATATATGCTAACATACTAATT
CTCAATGATAACTTTTAAGATTTGTTAGCCTAAAAAAAGGCTAGAAATATGCTTTTTAAT
ACTCCAAAAAGGCGGTATGGGTTAAAAATTGCTTTGTGGGACAGATTTGATAATTCTGCC
ATAGTTTGCCCTCTGCTGAAGTAAACCATTATCAAGGGTTTTATTTTTAACCTCATAACT
GCTGCTGCATGAAAGCATCATTCAAATAGCTGTGTACATAAAATTTAGATTTGTAAATAC
TCGCTTTAAGTCTGGGATGTCTTAGAACAAATTTTACCGTAGTTCTCCATTAACAGTTAT
TTTTTATTTAAAATTTTGGTTGAAAACTTTGAAATTAATTTAAAAATTCTGGATTTTTTT
TGAGTGTTTTATATTAAAAATCGTAAATATTTTTATAATTGCTTCAGTTTGTACCACAAG
CTTTGAAAACTTTTAAAACATGCTTGTCTAAACACAAAATTGTCATTTGCTTTTATTTAA
GATTAATTTGAAAATTAAAAATGATGAAAATTTATGTTTTTTAAAAACGAATCTACTAAT
TCAATTTTAACAAAAATTCCTAACTTTTATTGCATAACCTGACATAATTTGAATAACTTT
TTGATGCATTTACTGTCCATATATTCTAATATGTCTGGTGTCTTTGGTGAAACACAGACT
ACATATTGTTCAATTTGTACTTTACTATTTGCAACAAAAATAAATTGTCACTTTAACATT
ATTCCAAACAACCGCAATGTAACCTGAAAGACTTGCACACCATGAAGACGGCAGGCTTTG
CACTTACAGAAATACAAAAATGCACTAAAAATTGTCATTTCTACCAGGTGTCATTCATTT
AACTCATTTTGCACAAAAAGGTAAAAATCTTGTTTTTTTGCATAAAAATCCTGTTTCTTT
GCAAAAAATCTTGTTTATTAAAGTTAAATTCTTAAAAATTAAAGTGTTTTAAATTTTTGA
GATTACAATTCCACTATAA
| SUPERFAMILY |
EF-hand-dom_pair (IPR011992) - T[3-187] 1.18E-53 |
| Pfam |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[41-91] 6.5E-6 - T[100-173] 1.9E-16 |
| ProSiteProfiles |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[62-97] 11.305 - T[98-133] 13.481 - T[146-181] 12.282 |
| SMART |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[66-94] 0.18 - T[102-130] 3.2E-6 - T[150-178] 0.012 |
| CDD |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[69-128] 3.09484E-15 - T[102-176] 2.42496E-15 |
| ProSitePatterns |
EF_Hand_1_Ca_BS (IPR018247) - T[111-123] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| HPCA_HUMAN | 78.01 % | 318 | 1.83E-112 |
| HPCL1_HUMAN | 80.105 % | 330 | 5.24E-117 |
| NCALD_HUMAN | 77.487 % | 322 | 3.45E-114 |