- Transcript 'KH2012:KH.C8.342.v1....'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C8.342.v1.A.SL2-1
Possible name(s)
HPCA; HPCAL1; NCALD
Gene model
Location
KhC8 [5,984,926 / 5,996,383]
Amino acid sequence
Length: 197
>KH.C8.342.v1.A.SL2-1
AQVMGKQNSKLKPEDIRDLRAATEFNEHELQEWYKGFIKDCPSGNLTMDEFQKIYANFFP
QGDASKFAAHVFRTFDSNGDSTIDFREFIVALSVTSRGNLEEKLKWAFSMYDCDGNGIIS
RDEMLEIVRAIYKMVGAVMKMPEDESTPEKRTDKIFKQMDKNLDGSISLEEFVEGAKKDP
SIVRLLQCTPGSGGLGM
Nucleotide sequence
Length: 2,409
>KH2012:KH.C8.342.v1.A.SL2-1
ACGTTTTTGAACAGTTATTAATCATTTCTGTAGTTGTACAATGAGCTATTTTTATTAAAC
TGTTTTTACTGAAAAAATTCCAATTCTTTTGTTTTTATCATTGTTTTGAGCACAAGTCAT
GGGCAAGCAAAATAGTAAATTGAAGCCAGAAGACATTCGTGACCTCAGGGCTGCTACTGA
GTTTAATGAACATGAACTTCAAGAATGGTATAAAGGATTTATTAAGGATTGTCCTTCCGG
AAACTTAACTATGGACGAGTTCCAGAAGATCTACGCAAACTTCTTCCCACAAGGAGACGC
CTCAAAGTTTGCAGCTCATGTCTTCAGAACGTTTGACTCAAACGGCGACAGTACAATCGA
TTTTCGGGAGTTTATTGTTGCGCTGAGTGTCACTTCACGTGGAAATTTAGAGGAAAAATT
AAAATGGGCGTTCTCGATGTACGACTGCGATGGGAACGGGATTATTTCAAGAGATGAAAT
GCTGGAGATAGTTAGGGCGATATACAAGATGGTAGGAGCAGTGATGAAAATGCCTGAAGA
CGAATCAACCCCAGAGAAAAGAACCGACAAAATATTTAAACAGATGGATAAAAACTTAGA
CGGGAGTATTTCACTAGAAGAATTTGTGGAGGGGGCGAAGAAAGATCCATCTATCGTCCG
TTTGTTGCAGTGTACCCCTGGCTCTGGTGGACTTGGAATGTGAAAAGCAATTTAAGACAT
TTTGTTTTAAAATGCTTTTTAAAAAAAAAAAAGATTTTTTTTAGATTTTTGTTTGATTTT
ATCTAACATCAGGTAGTGAACGTGTATAGCCATTTGTGTCGTGCTCATTATTATTAATTG
GATTCTATTCCTGTTTCATGTACGCTTAACCACACACTGGTTGGTACGCCAATTGCCATA
AAGATTTTTTGTTATTTTTCTGGTTAAAACCTATAAGCTGAAAGCTATGTCGCAATTTTT
GCTTATATTTTACAAAAAAAAATGATTTTTTTTCTCATCTTTTGTTGCTAATTTTAAGCA
TGAAATAACTGAAATTGATGTCATTCTATCTTTATATCATATATGAGTAGTAATTGTTAA
GCATAGGAGAACTTGCACATAACAAAACCTATCTGAAACATGGTCATCATTTGGACACTC
TCCTATAGTTGAATTTGGATTGTAAATTAGCGTTTCATTTACACATGGGCAAATGACTGA
ATGTGCAAGCAACACTTCTTGGATGTGAACCTTTCCCCAGACTTTCTCCAGACTAAAGTT
TTATTTTGTCACAATCCAACAGAATGCCTTAATTTTGGAAACTGTTTAAATTATAGAAAA
AAGTTAAATTTTCAGCAGTTGGCAAACTTACTGGCTGTATACAAATTCTGTTTATCAATC
AAAATACAATATTTGTTACACAGTTTGGAATATATGCTAACATACTAATTCTCAATGATA
ACTTTTAAGATTTGTTAGCCTAAAAAAAGGCTAGAAATATGCTTTTTAATACTCCAAAAA
GGCGGTATGGGTTAAAAATTGCTTTGTGGGACAGATTTGATAATTCTGCCATAGTTTGCC
CTCTGCTGAAGTAAACCATTATCAAGGGTTTTATTTTTAACCTCATAACTGCTGCTGCAT
GAAAGCATCATTCAAATAGCTGTGTACATAAAATTTAGATTTGTAAATACTCGCTTTAAG
TCTGGGATGTCTTAGAACAAATTTTACCGTAGTTCTCCATTAACAGTTATTTTTTATTTA
AAATTTTGGTTGAAAACTTTGAAATTAATTTAAAAATTCTGGATTTTTTTTGAGTGTTTT
ATATTAAAAATCGTAAATATTTTTATAATTGCTTCAGTTTGTACCACAAGCTTTGAAAAC
TTTTAAAACATGCTTGTCTAAACACAAAATTGTCATTTGCTTTTATTTAAGATTAATTTG
AAAATTAAAAATGATGAAAATTTATGTTTTTTAAAAACGAATCTACTAATTCAATTTTAA
CAAAAATTCCTAACTTTTATTGCATAACCTGACATAATTTGAATAACTTTTTGATGCATT
TACTGTCCATATATTCTAATATGTCTGGTGTCTTTGGTGAAACACAGACTACATATTGTT
CAATTTGTACTTTACTATTTGCAACAAAAATAAATTGTCACTTTAACATTATTCCAAACA
ACCGCAATGTAACCTGAAAGACTTGCACACCATGAAGACGGCAGGCTTTGCACTTACAGA
AATACAAAAATGCACTAAAAATTGTCATTTCTACCAGGTGTCATTCATTTAACTCATTTT
GCACAAAAAGGTAAAAATCTTGTTTTTTTGCATAAAAATCCTGTTTCTTTGCAAAAAATC
TTGTTTATTAAAGTTAAATTCTTAAAAATTAAAGTGTTTTAAATTTTTGAGATTACAATT
CCACTATAA
| SUPERFAMILY |
EF-hand-dom_pair (IPR011992) - T[4-188] 1.26E-53 |
| Pfam |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[42-92] 6.6E-6 - T[101-174] 1.9E-16 |
| ProSiteProfiles |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[63-98] 11.305 - T[99-134] 13.481 - T[147-182] 12.282 |
| SMART |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[67-95] 0.18 - T[103-131] 3.2E-6 - T[151-179] 0.012 |
| CDD |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[70-129] 2.75341E-15 - T[103-177] 2.02455E-15 |
| ProSitePatterns |
EF_Hand_1_Ca_BS (IPR018247) - T[112-124] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| HPCA_HUMAN | 78.01 % | 318 | 1.6E-112 |
| HPCL1_HUMAN | 80.105 % | 330 | 3.52E-117 |
| NCALD_HUMAN | 77.487 % | 322 | 3.92E-114 |