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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C8.342.v1.A.SL3-1
Possible name(s)
HPCA; HPCAL1; NCALD
Gene model
Location
KhC8 [5,984,940 / 5,996,383]
Amino acid sequence
Length: 197
>KH.C8.342.v1.A.SL3-1
AQVMGKQNSKLKPEDIRDLRAATEFNEHELQEWYKGFIKDCPSGNLTMDEFQKIYANFFP
QGDASKFAAHVFRTFDSNGDSTIDFREFIVALSVTSRGNLEEKLKWAFSMYDCDGNGIIS
RDEMLEIVRAIYKMVGAVMKMPEDESTPEKRTDKIFKQMDKNLDGSISLEEFVEGAKKDP
SIVRLLQCTPGSGGLGM
Nucleotide sequence
Length: 2,395
>KH2012:KH.C8.342.v1.A.SL3-1
TTATTAATCATTTCTGTAGTTGTACAATGAGCTATTTTTATTAAACTGTTTTTACTGAAA
AAATTCCAATTCTTTTGTTTTTATCATTGTTTTGAGCACAAGTCATGGGCAAGCAAAATA
GTAAATTGAAGCCAGAAGACATTCGTGACCTCAGGGCTGCTACTGAGTTTAATGAACATG
AACTTCAAGAATGGTATAAAGGATTTATTAAGGATTGTCCTTCCGGAAACTTAACTATGG
ACGAGTTCCAGAAGATCTACGCAAACTTCTTCCCACAAGGAGACGCCTCAAAGTTTGCAG
CTCATGTCTTCAGAACGTTTGACTCAAACGGCGACAGTACAATCGATTTTCGGGAGTTTA
TTGTTGCGCTGAGTGTCACTTCACGTGGAAATTTAGAGGAAAAATTAAAATGGGCGTTCT
CGATGTACGACTGCGATGGGAACGGGATTATTTCAAGAGATGAAATGCTGGAGATAGTTA
GGGCGATATACAAGATGGTAGGAGCAGTGATGAAAATGCCTGAAGACGAATCAACCCCAG
AGAAAAGAACCGACAAAATATTTAAACAGATGGATAAAAACTTAGACGGGAGTATTTCAC
TAGAAGAATTTGTGGAGGGGGCGAAGAAAGATCCATCTATCGTCCGTTTGTTGCAGTGTA
CCCCTGGCTCTGGTGGACTTGGAATGTGAAAAGCAATTTAAGACATTTTGTTTTAAAATG
CTTTTTAAAAAAAAAAAAGATTTTTTTTAGATTTTTGTTTGATTTTATCTAACATCAGGT
AGTGAACGTGTATAGCCATTTGTGTCGTGCTCATTATTATTAATTGGATTCTATTCCTGT
TTCATGTACGCTTAACCACACACTGGTTGGTACGCCAATTGCCATAAAGATTTTTTGTTA
TTTTTCTGGTTAAAACCTATAAGCTGAAAGCTATGTCGCAATTTTTGCTTATATTTTACA
AAAAAAAATGATTTTTTTTCTCATCTTTTGTTGCTAATTTTAAGCATGAAATAACTGAAA
TTGATGTCATTCTATCTTTATATCATATATGAGTAGTAATTGTTAAGCATAGGAGAACTT
GCACATAACAAAACCTATCTGAAACATGGTCATCATTTGGACACTCTCCTATAGTTGAAT
TTGGATTGTAAATTAGCGTTTCATTTACACATGGGCAAATGACTGAATGTGCAAGCAACA
CTTCTTGGATGTGAACCTTTCCCCAGACTTTCTCCAGACTAAAGTTTTATTTTGTCACAA
TCCAACAGAATGCCTTAATTTTGGAAACTGTTTAAATTATAGAAAAAAGTTAAATTTTCA
GCAGTTGGCAAACTTACTGGCTGTATACAAATTCTGTTTATCAATCAAAATACAATATTT
GTTACACAGTTTGGAATATATGCTAACATACTAATTCTCAATGATAACTTTTAAGATTTG
TTAGCCTAAAAAAAGGCTAGAAATATGCTTTTTAATACTCCAAAAAGGCGGTATGGGTTA
AAAATTGCTTTGTGGGACAGATTTGATAATTCTGCCATAGTTTGCCCTCTGCTGAAGTAA
ACCATTATCAAGGGTTTTATTTTTAACCTCATAACTGCTGCTGCATGAAAGCATCATTCA
AATAGCTGTGTACATAAAATTTAGATTTGTAAATACTCGCTTTAAGTCTGGGATGTCTTA
GAACAAATTTTACCGTAGTTCTCCATTAACAGTTATTTTTTATTTAAAATTTTGGTTGAA
AACTTTGAAATTAATTTAAAAATTCTGGATTTTTTTTGAGTGTTTTATATTAAAAATCGT
AAATATTTTTATAATTGCTTCAGTTTGTACCACAAGCTTTGAAAACTTTTAAAACATGCT
TGTCTAAACACAAAATTGTCATTTGCTTTTATTTAAGATTAATTTGAAAATTAAAAATGA
TGAAAATTTATGTTTTTTAAAAACGAATCTACTAATTCAATTTTAACAAAAATTCCTAAC
TTTTATTGCATAACCTGACATAATTTGAATAACTTTTTGATGCATTTACTGTCCATATAT
TCTAATATGTCTGGTGTCTTTGGTGAAACACAGACTACATATTGTTCAATTTGTACTTTA
CTATTTGCAACAAAAATAAATTGTCACTTTAACATTATTCCAAACAACCGCAATGTAACC
TGAAAGACTTGCACACCATGAAGACGGCAGGCTTTGCACTTACAGAAATACAAAAATGCA
CTAAAAATTGTCATTTCTACCAGGTGTCATTCATTTAACTCATTTTGCACAAAAAGGTAA
AAATCTTGTTTTTTTGCATAAAAATCCTGTTTCTTTGCAAAAAATCTTGTTTATTAAAGT
TAAATTCTTAAAAATTAAAGTGTTTTAAATTTTTGAGATTACAATTCCACTATAA
| SUPERFAMILY |
EF-hand-dom_pair (IPR011992) - T[4-188] 1.26E-53 |
| Pfam |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[42-92] 6.6E-6 - T[101-174] 1.9E-16 |
| ProSiteProfiles |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[63-98] 11.305 - T[99-134] 13.481 - T[147-182] 12.282 |
| SMART |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[67-95] 0.18 - T[103-131] 3.2E-6 - T[151-179] 0.012 |
| CDD |
EF_hand_dom (IPR002048) - T[70-129] 2.75341E-15 - T[103-177] 2.02455E-15 |
| ProSitePatterns |
EF_Hand_1_Ca_BS (IPR018247) - T[112-124] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| HPCA_HUMAN | 78.01 % | 318 | 1.6E-112 |
| HPCL1_HUMAN | 80.105 % | 330 | 3.52E-117 |
| NCALD_HUMAN | 77.487 % | 322 | 3.92E-114 |