Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.398.v1.A.ND2-1

Possible name(s)

PPP1R3B; PPP1R3C; PPP1R3D

Gene model

KH2012:KH.C8.398

Location

KhC8 [758,402 / 760,430]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 362

>KH.C8.398.v1.A.ND2-1
IKRAFNILYKDPIAGCFLTHCIHCIMPADVSYLYSVSPPFHSFSSDFYPVQKRATDFQTS
NRYGDAGFTSSMLQYPVQKSLLKERVKTHSFNDADKQSVNNLKLKSIITHRKVLTSSNVG
VCSNGSKRKDKKVTFADTQGYSLTLTKYLTESTNEPPKSMTSGTLIRQLVKNLNLSSSDT
DSSTKEQKFAFKFTQPVANYVEFKRSLEQHNVSLENIVVKNSLCISGTVKVKNLSFDKTV
SVRITFDNWKSYSDHKCQYVKNAYENGALDTFQFNVDVPQCQSEDIQMCFQYVCDAGEFW
DNNRGQNYVISVINNRSSIEKSKSPVANHLSNISTHAPSTYMELPGPQFNTWVGWEGSGP
FY

Nucleotide sequence

Length: 1,858

>KH2012:KH.C8.398.v1.A.ND2-1
AGCAATAAGTGGTACGACAGTCTAAACTTAGTAATACAATAAAGCTTTTCAAAAAATACA
AATGTTTACCACTGGCCACAGCAACATGACAGTTCAGTTTTAAAAATCATTTTCGCTTTC
AGATATACCCTATAAGTTGATGATCTTGTAAAAATATTACTGTTGTCTGCTGTGTGCGGT
TTCATGCTGAATAAAACGTGCTTTTAACATTCTGTACAAAGATCCTATTGCTGGTTGCTT
TTTGACTCACTGTATTCACTGCATCATGCCTGCCGATGTGTCATACTTGTACAGTGTCAG
CCCACCCTTCCATTCATTTTCTTCAGACTTTTATCCAGTCCAAAAAAGAGCCACGGATTT
CCAAACATCTAATCGTTATGGTGATGCTGGTTTTACAAGTTCAATGCTTCAATACCCTGT
GCAAAAATCACTGCTTAAAGAGAGGGTAAAAACCCACAGTTTCAATGATGCTGACAAACA
ATCTGTTAACAATTTAAAACTGAAATCAATCATTACTCACCGCAAAGTGTTAACAAGCTC
AAATGTTGGAGTATGTTCTAATGGTAGTAAGAGAAAAGACAAGAAAGTTACATTTGCAGA
CACACAAGGTTATTCTTTAACACTCACCAAATATTTAACTGAGTCCACGAATGAGCCGCC
CAAGTCTATGACTTCTGGTACACTTATAAGGCAACTTGTTAAGAACTTAAACTTATCTAG
CTCTGATACTGATTCCTCTACAAAAGAACAAAAGTTTGCTTTTAAATTTACTCAGCCGGT
GGCAAACTATGTGGAATTTAAAAGAAGCCTTGAGCAACATAATGTATCACTGGAAAATAT
AGTTGTGAAAAACAGCCTTTGTATTTCTGGAACTGTAAAAGTGAAAAACTTAAGTTTTGA
TAAAACTGTTTCCGTGCGAATCACATTCGATAATTGGAAATCATACTCTGATCATAAATG
CCAATATGTTAAAAACGCATATGAAAATGGGGCCCTCGATACGTTTCAGTTTAATGTAGA
TGTTCCTCAGTGTCAATCAGAGGATATTCAGATGTGTTTTCAGTATGTTTGTGATGCTGG
TGAATTCTGGGACAATAACAGAGGACAGAACTATGTCATTTCTGTTATAAATAACAGAAG
TAGTATTGAAAAATCGAAATCACCTGTTGCAAACCACCTGTCCAATATTTCAACCCATGC
ACCATCCACTTACATGGAATTGCCTGGCCCACAGTTTAATACATGGGTGGGGTGGGAAGG
CAGTGGACCCTTTTACTGATACTGTCCACTGAAATAATTCTATAATTACACATATGCAAT
AACATTATTGTGAACTGCAGTATTAATACCCATGTCCTCCTGGTAGTCTGCGCTATTTCC
CAAGAAAGACAGGAAGCAAATTGTACAGTGTTGTTCATTGTGCACGTTTTATTGCGCATA
AATCGCCGCTTGCTGGTAGATCGGTGTTTGTCATGAGCACACATGTACAATCGCACTGTC
AAGGTTTATTGCTGTTGTGTCTACATTGGCATGTTGTGTCACGTCTTTATAATTTCAGCT
TAACTCTGGTGCTGTGAATGCTGCTGCAATTATTGTTGTTCATCACCCACAAAAGTGTTG
CGTTTGGCTGCCAATTAAGCAGCCATCTTTATAAAGTTGGAATGTTTCTTTTTAAATGCT
TACTGTTGCATATACTCTTAAAGTGATATGCCTAATTTCAGCACTTGCCTTCGTGAACAC
TTTTATACAGAACATAGCTATTTAATTCATTTCTAATGTATCCCATATTTTTGTACACCT
CTTGTCAAAGTGCCGTTAACACTGTTTGATATCAATAAATTCAACGTGGAAAGTTGTA

InterProScan

Gene3D	CBM21_dom_sf (IPR038175) - T[188-312] 2.6E-39
ProSiteProfiles	CBM21_dom (IPR005036) - T[204-311] 24.43
Pfam	CBM21_dom (IPR005036) - T[208-310] 2.0E-30

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
PPR3B_HUMAN	36.929 %	150	4.86E-43
PPR3C_HUMAN	34.211 %	130	3.05E-35