Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Clone 'cien84550'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C8.663.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.663.v1.A.nonSL2-1

Possible name(s)

NDC1

Location

KhC8 [3,516,287 / 3,530,914]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 678

>KH.C8.663.v1.A.nonSL2-1
ACCLVGLQFQQCLHIHISFKCVLRFYRFYEDNMAKNWLISQEFIWRNAAAAVWTWVVNSS
WLLVALFVWTFTPSNHIYAVYDYFLLLFSFRVWVLIFCISCLSSLFVKLHMQGSKVTCKL
PTTRFQSLVAMFSFKRIFLTMCHGVLCGVITAFLAGITESKFSTVYIQCKNTPDYVCLNE
SCYILILFGSVVGAANFVSRSNKHLYCLNFPIVQQARFISIKCNFHQMLVQSYKTCAKFL
QYFLIFYYLIGYLTREFVADLFRAGPCDGHIVSTLNIMGVISLAWTLWVSGTILLLLHDV
SWHLFNIYATKMFPFRMDSVFPEDKPKILTSNLTSDQPLLVQHLAFQYLSSIASSSSIKR
KQIYIISHDTGSANQPKWNLILDECLARLKKLTTSIKDHKQIALRMEQNKVKTTKSSKSS
SSSQSSSGQSPAPDSSQFMSVSAFNHRPKSCDTLDGVNMSCFDVSSLNTTNAGNPLNSPN
LNGSMLTVPTPKLWTKQIRKRAALHSNVSSPVPIIQPYQEVPQVPYKTLNSQIQALLQRG
ASAIKKFPVVSFLFNEIPSHSMANLYSEHNIYRWSIRSLSSLSAYSLNEDDYGVVQRRLH
EVINCLLDLVVTLDKHGKVLPICTSETTNLMLRQQQSIKNEAKSAVYRITDTFSTQLESI
PVDAEFRRKLRSFVEHQE

Nucleotide sequence

Length: 3,031

>KH2012:KH.C8.663.v1.A.nonSL2-1
ATAAATCAATTGTGAACTTTTAAGGGGCTAAGCTTGTTGCCTTGTTGGATTACAATTCCA
ACAGTGTCTACATATTCATATTTCTTTTAAATGTGTACTGCGGTTTTACCGATTCTACGA
AGATAATATGGCTAAGAACTGGTTGATTTCCCAGGAGTTTATTTGGAGAAATGCTGCAGC
AGCTGTTTGGACTTGGGTAGTTAATTCATCTTGGCTTTTGGTTGCTTTATTTGTATGGAC
ATTTACACCTTCAAATCATATTTATGCTGTGTATGATTATTTTCTTCTCCTTTTTTCATT
CCGTGTTTGGGTTTTGATCTTTTGCATATCATGTCTTAGTTCATTGTTTGTCAAGCTACA
CATGCAAGGCTCCAAAGTGACATGCAAATTGCCAACGACTCGTTTTCAATCTCTGGTTGC
CATGTTTAGTTTCAAACGGATATTCCTAACCATGTGTCATGGGGTTCTATGTGGGGTTAT
CACAGCTTTCCTAGCGGGTATTACGGAAAGCAAATTTTCCACTGTTTATATTCAGTGCAA
GAACACGCCTGATTATGTGTGTCTAAATGAATCATGTTACATATTGATACTATTTGGTTC
TGTGGTTGGTGCAGCCAATTTTGTTTCAAGATCTAACAAGCATCTGTATTGTCTTAACTT
CCCAATAGTGCAGCAAGCCCGTTTTATTTCCATAAAATGCAACTTCCATCAAATGTTGGT
ACAAAGTTACAAAACGTGTGCGAAGTTCTTACAGTATTTTCTAATCTTCTATTACTTGAT
TGGATATTTAACAAGAGAATTTGTTGCTGATCTCTTCAGAGCTGGACCATGTGATGGCCA
TATTGTAAGTACCTTGAACATTATGGGGGTTATATCACTTGCATGGACACTGTGGGTATC
TGGTACAATATTGCTGCTTCTTCATGATGTATCTTGGCATCTATTCAATATTTATGCAAC
TAAGATGTTTCCATTTCGAATGGATTCTGTCTTCCCAGAAGACAAACCAAAGATACTGAC
ATCAAATCTCACCTCGGACCAACCACTTCTTGTTCAGCACTTAGCGTTCCAGTACTTGAG
TAGCATTGCAAGTTCTTCAAGCATTAAAAGGAAACAAATCTACATTATCTCCCATGACAC
CGGTAGTGCTAACCAACCAAAATGGAACCTTATTTTGGACGAATGCCTTGCACGACTGAA
GAAATTAACCACAAGTATAAAAGACCACAAACAAATTGCTTTGAGAATGGAACAAAATAA
AGTGAAAACGACAAAATCTTCTAAATCTTCATCATCCTCTCAATCCTCGTCCGGTCAATC
ACCTGCACCAGATTCGTCTCAGTTTATGTCCGTTTCTGCATTCAACCATCGACCTAAGTC
ATGTGACACGTTAGACGGAGTGAACATGTCTTGCTTTGACGTATCTTCACTGAATACTAC
AAACGCTGGCAACCCACTTAACTCACCCAATTTAAACGGGTCAATGCTGACTGTTCCAAC
ACCAAAGCTATGGACAAAACAAATACGAAAGAGAGCTGCATTGCATTCAAATGTTTCTAG
TCCAGTGCCAATCATCCAACCTTATCAGGAGGTCCCACAAGTGCCATACAAAACACTGAA
CAGTCAAATCCAAGCATTATTACAACGTGGAGCTTCCGCCATTAAAAAGTTTCCAGTGGT
ATCTTTTTTGTTCAATGAGATTCCCAGCCACAGCATGGCAAACTTATATTCGGAGCACAA
TATTTATCGTTGGTCAATTCGTAGTCTGTCTTCATTATCTGCATACTCACTTAATGAAGA
TGACTACGGTGTCGTGCAACGTCGTTTACATGAAGTTATTAACTGCTTGTTGGATTTAGT
CGTTACGCTTGATAAACACGGAAAAGTCCTTCCTATTTGTACTTCAGAGACAACAAACCT
TATGTTGCGCCAACAGCAAAGCATCAAAAACGAAGCGAAAAGTGCAGTGTACAGAATAAC
GGACACTTTCTCTACACAGCTCGAGTCAATTCCAGTAGACGCGGAATTTCGACGTAAACT
ACGATCTTTTGTCGAGCATCAGGAATAAAGTAGACTCTATGTTGCAGCGAATGGCTAGCA
CAAATAAACAAGGCCAGACTGAGTTCATCGTGACGTTAATAAAAGTTCTTCTAAAAATCG
AAAAAATGCGGCCTTTCTGTACCATTTCTTGTATGATGTTTTCTTGTGTTTGGTGCGTAT
GTGGTAAGGTGGCTATTACTTTTCCTCTGCGACAGTGAGGCTCATTCTAGCATTCTTCTT
TGTTTAGTCATCACTGGTCAAGCAGACGTGAAAAACACGTTCTCCCGGCAATGAATTATC
ACCCGACCGATCGACACGTACACTGAGGCCCAAAATAACTCGCAAAATGTCAACCGACCA
AAATATCGTGCTTAACCAGTGGGTCACGTCATTTCCACTTCATGTGTAACGGCCGGGACT
TGGTGAAAGCCCTGCTCTTTAAACAGACTTATTAATCATACAGAATGGCCTAAAAGCCGC
TACTAACTTGTAAGTTCACGATTTCTGTCGTAAAATAAGAGAACTGTAATCACGTTACAC
CTAAGACCCCCTAGTTTCGAATATATTCGCTATTTTTTTTCTTTAAGCAGATGCGGTATT
GGAATAGGAGTTATTTTTGCCACTTTAAAGCTAAAACATGAAAGTTTCGGGTAATTGCCG
CTAATTTGTTACCTTCCTATTGTAGCCATGTTTGTATGACAACGATCCTCGTGTTTGTTT
GTTCCTTTGTTCGCCCAGCGAAACATGCCTCCTGTCACCGAACACCAGCCTTTCATTCTC
CTTTTGTTTTTACGTTTGCCTCGTTGACGACAATCCATATGGCGATCAGTTTGCACAACC
TTCAATCCGTAAACGTAAGAGGTGTGGACTGTGTTTCGTGTCTGTCACATTTAAAATCAT
ACAGGAGGAAAGCGTTTAACGAGGCTTTGTTCATTCGAACGTGTCAATATTATTTCAACT
TTACGAAAGCGTCGGTAGAGTCTTTCAACAC

InterProScan

PANTHER
Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup (IPR019049) - T[34-678] 6.5E-142
Pfam
Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup (IPR019049) - T[45-671] 2.1E-84

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NDC1_HUMAN 25 % 160 1.15E-41