Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L131.10.v1.A.nonSL2-1

Possible name(s)

MFSD6; MFSD6L; MFSD9

Gene model

KH2012:KH.L131.10

Location

KhL131 [17,683 / 20,789]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 521

>KH.L131.10.v1.A.nonSL2-1
EPHVVADSGLVVKVNAAVMKVEYDLLVVKLVNFLFYAGMACFMPYKAIYQKSIGLTPSQN
GLIQALEKLITLFSPPIVGAISDKFSFHKSSMIICILLSVGFTFPMYFVPKVNNGLNHNV
DCYVTNTTIVCSNSLNFTEGCNIIENVDAAYLLKCWDDYNNSATVTCEEPTVVNNQTEDA
IQLKCKDETTEQDTYGLTFMWVVVLTVFYAFFTNPVQPLIDASTMNMLGENRMQDYGKQR
LWGSVGFGSVALLVGFVTDVFTKSKSTEEKDYLFSFIGALVFGVLTSIVCYKLKVPKHNP
PSILSGLTTLVKDPRIIAFLCIVMVGGYNLGVKYAFVFWYAESLPGCNQTIIGLAILTGC
LTEVPMFFVSGWIAGKIGYNAILVFGLIFASLRCFLYTILTSAWQLLLVEALHGLSFALP
MAAMCSYAATLAPEGMTATLIGLTQGVYWGLGNMLGALLGGVLYRLYSPIVMFRITALIG
VVAAMFYSISMVCLINYNSGLKVEEGSEGEREACNIKTDEA

Nucleotide sequence

Length: 1,840

>KH2012:KH.L131.10.v1.A.nonSL2-1
GAACCACACGTTGTTGCTGATTCAGGTTTAGTCGTTAAAGTGAATGCTGCAGTCATGAAG
GTTGAATATGATTTGTTGGTCGTTAAACTTGTCAATTTCTTGTTTTACGCTGGCATGGCA
TGCTTTATGCCGTACAAAGCAATTTACCAGAAGAGCATCGGACTGACCCCCTCACAGAAC
GGGTTGATTCAAGCGCTGGAGAAGTTGATAACTTTGTTCTCTCCTCCAATTGTTGGAGCG
ATTTCCGATAAATTCTCGTTCCATAAATCTTCAATGATTATTTGTATTCTGCTCTCTGTT
GGCTTCACCTTCCCAATGTACTTTGTACCAAAAGTCAACAATGGGTTGAATCATAATGTC
GATTGTTACGTCACAAACACAACAATTGTTTGCAGTAACTCTTTAAATTTTACTGAAGGT
TGCAACATTATTGAAAATGTTGACGCTGCTTATTTATTAAAATGTTGGGACGATTATAAT
AATTCTGCCACAGTTACATGCGAAGAACCCACTGTAGTTAACAACCAAACTGAAGATGCA
ATTCAACTTAAATGCAAAGATGAAACAACAGAACAGGACACATATGGTTTGACCTTTATG
TGGGTTGTTGTATTGACCGTATTTTACGCATTTTTCACCAACCCTGTCCAACCTTTGATT
GACGCAAGCACAATGAACATGTTGGGTGAAAATAGAATGCAGGATTATGGGAAGCAACGC
TTATGGGGGTCGGTTGGGTTCGGCTCCGTTGCTTTGCTCGTTGGGTTCGTAACCGATGTT
TTCACAAAGTCAAAATCAACCGAAGAAAAAGATTATTTATTTTCATTCATCGGAGCGTTA
GTGTTTGGTGTCTTAACTTCAATTGTGTGTTATAAGTTAAAGGTTCCAAAACATAACCCA
CCATCTATATTATCGGGACTTACAACACTTGTAAAGGATCCACGTATAATAGCATTCCTA
TGCATTGTTATGGTGGGCGGGTACAACCTCGGCGTGAAATATGCGTTTGTGTTCTGGTAC
GCTGAAAGCTTGCCTGGTTGCAACCAGACCATCATCGGACTCGCCATTCTAACCGGATGT
TTAACCGAGGTTCCGATGTTCTTTGTGTCCGGATGGATAGCTGGAAAGATTGGGTATAAC
GCGATCCTCGTGTTTGGGTTGATATTTGCCTCATTACGCTGCTTTCTTTACACGATCCTC
ACATCGGCATGGCAACTTCTGCTCGTTGAAGCGTTACACGGCTTGTCATTCGCGTTACCA
ATGGCCGCCATGTGTTCGTACGCGGCTACTTTGGCTCCAGAAGGAATGACGGCGACACTG
ATCGGACTCACCCAAGGTGTATACTGGGGGTTAGGAAACATGCTCGGTGCGTTGTTGGGC
GGTGTTTTATATCGTCTTTATTCCCCGATAGTGATGTTCCGTATCACCGCACTTATCGGA
GTTGTTGCCGCAATGTTTTATTCTATTTCTATGGTTTGCTTAATAAACTACAACTCGGGA
CTTAAAGTGGAGGAAGGTTCTGAGGGAGAAAGAGAAGCTTGCAATATAAAGACTGACGAA
GCATAGAAACATCATTAATAATGAGTAGAAACAAATTTTTTTATAGCAAAAATTGATTAA
ATTTTTAGCCTGTTAAAAGCGATAAAAATTTGTTGCTTTAACAAATGCCCTAATAGCTGC
TTCTAAATAACAATATACTTGTCAGCAATAGTTAGTTTATATCTTTCTTCATTGTGAATA
TTGCCTTGCAGTGTTTTAATTGAATATACGATTCCTTTGCCTACATTTCATGTTTAAAAG
ATGTTTTCATAAGTTTAATACAAAACACAGAGAGATTTGG

InterProScan

SUPERFAMILY	MFS_trans_sf (IPR036259) - T[25-110] 7.32E-48 - T[194-490] 7.32E-48
Pfam	MFS_assoc_dom (IPR024989) - T[26-475] 9.9E-82
ProSiteProfiles	MFS_dom (IPR020846) - T[271-521] 13.44
CDD	MFS_dom (IPR020846) - T[318-487] 3.313E-13

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MFSD6_HUMAN	23.993 %	141	1.08E-35