Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L134.14.v1.A.nonSL27-1

Possible name(s)

KH.L134.14

Gene model

KH2012:KH.L134.14

Location

KhL134 [1,127 / 3,942]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 148

>KH.L134.14.v1.A.nonSL27-1
LKMKVLVAVDPSNIAEGAFDWYIKNVHQPDNEIVVCHQAEQPKLPTLGHGGAFPAEEIAR
IMTEHNKTLADLENQYTMKSKQAKKSKVVVETTEGKPGQAIVKLAEKSQVDLIVMGTRGQ
GAIRRTILGSVSDYVLHHTKIPVLICHG

Nucleotide sequence

Length: 1,030

>KH2012:KH.L134.14.v1.A.nonSL27-1
CTTTAAAAATGAAGGTTTTAGTCGCTGTAGACCCAAGTAACATCGCTGAAGGCGCATTTG
ATTGGTACATCAAGAATGTCCATCAACCAGATAATGAAATAGTCGTTTGCCATCAAGCAG
AACAACCAAAGCTCCCAACATTAGGACATGGGGGAGCCTTCCCAGCTGAGGAGATTGCTC
GAATAATGACCGAACACAACAAAACTTTAGCCGATCTTGAGAATCAATACACCATGAAGT
CTAAGCAGGCCAAAAAATCCAAAGTAGTCGTTGAAACAACTGAAGGAAAGCCGGGACAAG
CGATTGTCAAGCTTGCCGAGAAGTCTCAGGTTGACCTGATTGTGATGGGAACACGCGGTC
AAGGCGCGATTCGACGCACGATTCTGGGTTCCGTTAGCGATTATGTTTTGCATCATACTA
AGATTCCAGTCCTTATTTGCCACGGTTAATTCTAACATCCAATCTTGGACTGTGAGAGAA
ATACGAAGTGTAATTAATGCTTATGTTAAAGTTTAAATTTAATTTCAGTGATTCAGTAAC
ATGATGCCAAACTTTTTTTGTGAACTAACTTGTTCCACTACTATAATACATTGTGGTTGT
GAGTTTCTGGTTAACACTTTACGACCCATGACCATATACTGCTAAGCTAACAAACTAATC
TTTGCTAATATTGATTCTAAGGAGCCAAACGCAAACATGAAAGTAGTGTGTATGATGTAG
TAGTGCTTCTAAAATTGATTTCGTGCTTAATGTTTTAGTTCTAAGTGCTTTTGTAAATTT
TGTAACGAAATTTGAAACTAGCATTGTGATTATTATTTGTGATGCTAAAAATATTAACAA
ATTTGGTGTCAAATTCTTCAAATTTAGTTGAAACATAATGTGGTGTAGCAGAATAATTTG
TGTGTAGTCTCATTTTAGCTTTACTAATGTCATTGGTGTTTTAACAATCTGTTTTATGTA
CCAATTCTTTGCAATTCACACACTAACGAATATATTAATGCCGTTTTAATAAAAGCGCTT
AATTAGTGCC

InterProScan

PRINTS	Universal_stress_UspA (IPR006015) - T[2-20] 8.9E-16 - T[107-119] 8.9E-16 - T[125-147] 8.9E-16
Gene3D	Rossmann-like_a/b/a_fold (IPR014729) - T[2-148] 2.9E-35
Pfam	UspA (IPR006016) - T[4-147] 8.1E-31

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value