Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L134.4.v1.A.ND2-1

Possible name(s)

CDY1; CDY1B; CDYL

Gene model

KH2012:KH.L134.4

Location

KhL134 [88,368 / 91,805]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 265

>KH.L134.4.v1.A.ND2-1
FISEYFEICIQSKQFNNSMVDDEESDSAPTNIPEETQPYRNFITLEVMEDITACLRKAED
DLSKAVLLCAKGSIFSYGLDVEDLMEHENPQKVLDALRRMIDSFIRFPKPIIAAVQGPCA
SLGASILGLCDLVVASNKAAIQMPYTLQGLTPDSCSSYLLPTIVGAQQANSLLLGNKILT
AFEAHQIGYFTEVVSHEELMGSVMNHMNSLRFAALPSIIATKKLLKAPHIAQLVYVNDSE
IRNLSACLLDPQCQSNMRTFVKSMY

Nucleotide sequence

Length: 1,353

>KH2012:KH.L134.4.v1.A.ND2-1
CCAAGTTATTAGTGCACGTGACTTCTTCTTTAAGCTGTGATGTTGCTGCTGTTGGAACTC
AATGTAGTGGTAAAGTTCTTTGGATTTAAAAAATCACAATATTTATTTATTTATATTCTA
TAATACTAGATGCGAGTTTATAAGAAAATTACACATTGAAAATTTAATTTAAAATCCTGT
TTAATTTATTTCAGAGTACTTTGAGATATGTATCCAGTCAAAACAGTTCAATAATTCAAT
GGTTGATGATGAAGAGTCAGATTCTGCCCCAACAAATATTCCTGAAGAAACGCAGCCATA
TAGAAATTTCATTACACTTGAGGTTATGGAAGACATTACTGCTTGTCTTAGAAAAGCCGA
GGATGATTTATCAAAAGCAGTTTTGCTTTGTGCAAAAGGAAGTATATTTTCTTATGGTCT
CGATGTGGAAGATTTGATGGAACATGAAAATCCACAGAAAGTTCTTGATGCATTAAGGAG
AATGATTGATTCTTTCATTCGGTTTCCTAAACCAATAATTGCCGCAGTTCAAGGTCCTTG
TGCAAGCTTGGGTGCTTCAATACTCGGGTTATGTGATCTGGTTGTGGCAAGTAACAAAGC
TGCGATACAAATGCCCTACACACTACAAGGGTTAACACCTGATAGTTGTTCTTCTTATTT
ACTCCCAACTATTGTTGGCGCACAGCAGGCGAACTCTCTGTTGCTTGGAAACAAAATTCT
CACAGCATTTGAGGCTCATCAGATCGGGTATTTCACGGAAGTTGTTTCACATGAAGAGCT
CATGGGAAGTGTCATGAATCATATGAATAGTTTGCGCTTTGCAGCACTGCCGTCTATTAT
TGCAACCAAGAAGCTGTTGAAAGCTCCACACATTGCCCAGCTTGTTTATGTGAATGATTC
TGAAATCAGAAATCTCTCTGCCTGTCTATTAGACCCACAATGTCAATCAAATATGCGAAC
ATTTGTTAAAAGCATGTATTAAAATTTTCAAGAAATTTATTAACAAACCTTTTCTATCGT
GCTAATTTTACAATTAGCTAATGTTGTGCTTTAATGTTTTTACAAAACTTGTTGTATTTG
TTTTTTATTATTTTTAATAAATATTAGTGTTTTCAAAATATTTCAGTAAAGTGAAAATCT
CAAAAACTTATTGTTTGGGACAATATGGTGTTAAAAACCCAATTTTAAATAAAGTAAAAA
ATGAGATTTTTAGTAACGCAAATTCAGTGTCCAAATATGCTTAATTTTCGTTGTTCACTT
CTTGTTTTCTTGCATAGTGTATTTAAATAGATTAAAACATTTGATTTAATCTCTTTGGTG
TATTTCACGCCTAAATAAACACACTGCTTGAAA

InterProScan

Pfam	Enoyl-CoA_hydra/iso (IPR001753) - T[39-260] 2.6E-29
SUPERFAMILY	ClpP/crotonase-like_dom_sf (IPR029045) - T[39-263] 2.78E-45
Gene3D	enoyl-CoA_hydra_C (IPR014748) - T[215-262] 2.7E-5

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CDY1_HUMAN	41.875 %	124	1.28E-32
CDY2_HUMAN	40 %	122	6.67E-32
CDYL_HUMAN	41.808 %	128	1.19E-33