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  1. Transcript 'KH2012:KH.L134.4.v3....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L134.4.v3.A.nonSL8-1

Possible name(s)

CDY1; CDY1B; CDYL

Location

KhL134 [85,437 / 91,805]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 607

>KH.L134.4.v3.A.nonSL8-1
TGKKLKNHPPVSMIKTHVRKFAKESKISDENTSDTTDTDLEDEEPLISDEEEKNLDSSDS
EELMTLSELRERKLSRENNDEFADVENEKKFKDSDQEDVSSNPDLNQPVSSPEEIEQSSY
KERASPSKKVGNRKYGLGKVNGSPGLSSKRLAVLRRGKAKLDAKSSVYKATHYGNLRAKR
VTEKTKKRKYTKPVKETYTFPKANERNGKPVLQSLVLKRKPGRPRKDESNENNVEIYHGK
KTRVVVSKPRTFKHFGTVVPIMKRNKLQTIQKGKVVNILNSSYKSQERNIHKLENGTTSL
GDNHVTRSYRQQKKINWGNYQPPKLLVHVTSSLSCDVAAVGTQCSEYFEICIQSKQFNNS
MVDDEESDSAPTNIPEETQPYRNFITLEVMEDITACLRKAEDDLSKAVLLCAKGSIFSYG
LDVEDLMEHENPQKVLDALRRMIDSFIRFPKPIIAAVQGPCASLGASILGLCDLVVASNK
AAIQMPYTLQGLTPDSCSSYLLPTIVGAQQANSLLLGNKILTAFEAHQIGYFTEVVSHEE
LMGSVMNHMNSLRFAALPSIIATKKLLKAPHIAQLVYVNDSEIRNLSACLLDPQCQSNMR
TFVKSMY

Nucleotide sequence

Length: 3,753

>KH2012:KH.L134.4.v3.A.nonSL8-1
ATAATTGCTCGACACGGCGCATAAGGTAGTTCCATTTTAACCAAGGTAAGTTTTGCATTC
AGTTATTCTTATGCATGACAAAATATGCTGTAAAATTGTTAAACATTTTTACCAAATTTG
TTATTTTTTTGGCATTCTTTTAACATTTTATATGGCGCAAAATTTGTGTAAAATTTTTCG
GTAAAAAAATTGTACGAAAAGTGTTTAAAAAATTATGTAAAAACGTGTTTAAATTTTAGA
AATTAAAATTAGTGAAACAAAACTAACTTTTAGCAGAGTAAAATTAAAAACTTTTTTTTT
ATTGTTTACAGAATAATATTAAACTACATAGAAATATTAAAATTGTTAGGTTGTTATATT
TTACTAATTTTGTAAAATTATTGCTGAAAACAAAAATTGTTGTGATGAACCAATTTCGCT
GTTTCTAGCTTGTATTTAATTTATCGCATTTTAAAAATTTTTTAATGTGTTGATTTTTGT
TTATTTAAAATTTACAGCTCCTTTTTTCTTTACTTAAATAATAGAAATTAAAGAGAAGAG
GAAAACATTGTTTTAAAGAAAATTAAATTACTATTTAATAAATTAAAAATTAGATGGAAT
AATAATGATTTATTACTATACGAATACATAATAGTACATGCTATTCTATCAAAATATATA
TTAAATGTATATATATATATATATGTATATACAATAAACCTATATAAAAAAATAACAATA
CTCATTGCACACACAAAAGTGACAAATGATTTTTTATACATTAAATAAACCTAAAAAAAA
ACTTAAACAAAATATTTTTTCCTTAAAAAAATTGGTATAAATATTTCTCTACTCTTGAAA
AAATTAGAAAAATGTTTAAAAAAAGGTTTAAGAAAAATTTATTCTGAGGGAACAGATCTG
GGGATTAGTGAATTGTACCAAAATTTTTAATTTTGACATTTAAAATCCTAAAAAATTCTA
TTTGTTGATAAAATTCATACTAATATTTTTAACTTGTATTCTCTCTCAAAAAAAAAAAAT
ATATATATATAAATTTTAGAGAAATTAAATTCAAAATATTTTCAACAGAAAATGGCAAAA
AGTCCTGCTAAAGAAAGTGAGGGCGTGGCCACAACAATTTATATTGAATGTACAGAAGAC
CAAGGTCCTCCCAATCTGTCTGCAGTTGGCCAGTTAAATGTTACAGTGAAAGAACCTTTG
GAGAATGAGGACATTTCTGAAGCTACTCCCAAAAAAAGAGGGCGGCCACGCAAAGATTCT
TTTAATGAAAATAAAAAAGTGAATGAAAAAAAAAATTTAAATGAGAATAAAAAAAGGGGG
AGGCCAAGAGGTTCTATAAAATCTAAAATTTCTCCTTCTCATGATAAAGTTGACTTGAGT
TTGGGTGAAAATAAAAGGGAAAGCAACGAGAGGCGGGACCAGAAATATCCGAAATTAGAT
GAAAATGTCACAGACCCTTTTTTAATGAAGATATCAAAAATATTTTCTATTGTGAAAGAT
GAGAATGTCTCAGGAAAAAATTCAAAAAATATCCCAGGTGTTCAAAATGCTGACGTAAAC
GGGAAAAAAATTGAAAAATCACCCACCCGTTTCGATGATTAAAACACATGTGAGAAAATT
TGCCAAGGAATCGAAAATCTCGGATGAAAACACTTCTGATACGACGGATACCGATCTTGA
GGACGAGGAACCTCTCATCTCAGATGAGGAGGAAAAGAATCTCGATTCTTCCGACTCTGA
GGAACTTATGACTCTCAGTGAGTTGCGTGAACGAAAACTCTCCCGAGAAAATAACGATGA
GTTCGCTGATGTTGAAAATGAGAAGAAATTTAAGGACTCGGACCAGGAAGATGTTTCTTC
AAATCCCGATTTGAATCAACCAGTTTCATCACCTGAAGAGATAGAGCAAAGCTCATATAA
AGAGCGTGCATCACCGTCCAAAAAGGTTGGCAACAGAAAATATGGTTTGGGTAAAGTAAA
TGGGAGTCCAGGATTAAGTAGTAAGAGGTTGGCAGTGTTAAGACGAGGGAAAGCAAAGCT
AGATGCTAAAAGTTCGGTCTACAAAGCAACACATTATGGGAACCTGAGAGCTAAAAGAGT
AACTGAAAAAACAAAGAAAAGAAAATACACCAAACCTGTGAAGGAAACTTACACCTTTCC
AAAAGCAAATGAAAGAAATGGTAAACCAGTTTTGCAAAGTTTGGTTCTGAAGCGAAAACC
CGGTAGACCACGCAAAGATGAGAGCAATGAAAATAATGTGGAAATCTATCATGGTAAAAA
AACGCGTGTCGTTGTATCCAAGCCCCGAACATTTAAACACTTTGGTACTGTTGTACCTAT
TATGAAAAGAAACAAGCTTCAAACAATCCAAAAAGGTAAAGTCGTAAATATTTTAAATAG
CTCTTACAAAAGCCAAGAGCGGAATATTCATAAATTGGAAAATGGGACAACTTCTCTTGG
CGATAACCATGTTACAAGATCTTACAGACAACAGAAAAAGATTAACTGGGGAAACTACCA
ACCTCCCAAGTTATTAGTGCACGTGACTTCTTCTTTAAGCTGTGATGTTGCTGCTGTTGG
AACTCAATGTAGTGAGTACTTTGAGATATGTATCCAGTCAAAACAGTTCAATAATTCAAT
GGTTGATGATGAAGAGTCAGATTCTGCCCCAACAAATATTCCTGAAGAAACGCAGCCATA
TAGAAATTTCATTACACTTGAGGTTATGGAAGACATTACTGCTTGTCTTAGAAAAGCCGA
GGATGATTTATCAAAAGCAGTTTTGCTTTGTGCAAAAGGAAGTATATTTTCTTATGGTCT
CGATGTGGAAGATTTGATGGAACATGAAAATCCACAGAAAGTTCTTGATGCATTAAGGAG
AATGATTGATTCTTTCATTCGGTTTCCTAAACCAATAATTGCCGCAGTTCAAGGTCCTTG
TGCAAGCTTGGGTGCTTCAATACTCGGGTTATGTGATCTGGTTGTGGCAAGTAACAAAGC
TGCGATACAAATGCCCTACACACTACAAGGGTTAACACCTGATAGTTGTTCTTCTTATTT
ACTCCCAACTATTGTTGGCGCACAGCAGGCGAACTCTCTGTTGCTTGGAAACAAAATTCT
CACAGCATTTGAGGCTCATCAGATCGGGTATTTCACGGAAGTTGTTTCACATGAAGAGCT
CATGGGAAGTGTCATGAATCATATGAATAGTTTGCGCTTTGCAGCACTGCCGTCTATTAT
TGCAACCAAGAAGCTGTTGAAAGCTCCACACATTGCCCAGCTTGTTTATGTGAATGATTC
TGAAATCAGAAATCTCTCTGCCTGTCTATTAGACCCACAATGTCAATCAAATATGCGAAC
ATTTGTTAAAAGCATGTATTAAAATTTTCAAGAAATTTATTAACAAACCTTTTCTATCGT
GCTAATTTTACAATTAGCTAATGTTGTGCTTTAATGTTTTTACAAAACTTGTTGTATTTG
TTTTTTATTATTTTTAATAAATATTAGTGTTTTCAAAATATTTCAGTAAAGTGAAAATCT
CAAAAACTTATTGTTTGGGACAATATGGTGTTAAAAACCCAATTTTAAATAAAGTAAAAA
ATGAGATTTTTAGTAACGCAAATTCAGTGTCCAAATATGCTTAATTTTCGTTGTTCACTT
CTTGTTTTCTTGCATAGTGTATTTAAATAGATTAAAACATTTGATTTAATCTCTTTGGTG
TATTTCACGCCTAAATAAACACACTGCTTGAAA

InterProScan

Pfam
Enoyl-CoA_hydra/iso (IPR001753) - T[381-602] 2.7E-28
SUPERFAMILY
ClpP/crotonase-like_dom_sf (IPR029045) - T[381-605] 2.87E-44

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CDY1_HUMAN 38.418 % 128 1.9E-31
CDYL_HUMAN 35.808 % 132 1.07E-32
CDYL2_HUMAN 35.586 % 126 6.64E-31