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  1. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S714...'
  2. EST 'FK176730.1'
  3. Transcript 'KH2012:KH.L137.2.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L137.2.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

RNF139; RNF145; SYVN1

Location

KhL137 [36,549 / 45,718]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 616

>KH.L137.2.v1.A.SL2-1
KCCKSVPKNMDEDENIKVIGVILRLPGVFMLELLYMEALTLKNIIGFNDILNIDFVLYVI
AWLLVVLPIKLLIKVYKNCIAAGCLVASHCVFYKLLIQSQVIVHMDDYGNLTPSPTWNGS
WLLLVTNSRKNTETCITTILLQTSLALLTYKLWDRKPPFVGVVMWPILSWLTGYFQPSVL
VVLLQTMSYFALAGLLFCLFNSLVILRNHLRQFLLKCRMVITIFGWQAMLTWAREEYQIQ
HLLVTCWLLRYFIQAYTNIHQQLNISNLNTDLFNHINVKVVNWKNAHIVTTMFMAAVQCM
TTTINLFGFVCIVKEVIKLQYFIIRSWLHCSFHNHPPDPVSDPLTGTIDGITFLIMSLYT
DILNTDLEGRFLILIYILFTIASSQFQSIFNIIDPILMTLATAHNGTFWKHLRTVMLATV
LLFISGVLSYISFFTMSSTFWVFIIAYNYVNTFSLMLGSMSIYLVLMIDYHTLRGWQSLD
DVMFYIRGACRAVEFIVTLCMCGYIMMTFYMEMTSAAGIVMLAAYTYYCIVQRGGKGWKI
WMMRRQASCKVQSLPRATKEDLRNKSDLCPICYQMMESEVRVMHCKHYFHENCLKKWFYI
QDKCPLCYAQFQSVAF

Nucleotide sequence

Length: 2,547

>KH2012:KH.L137.2.v1.A.SL2-1
ATATTAAATAATGTTAAAACGTAACATGTAAAAATGTTGTAAATCTGTCCCTAAAAATAT
GGATGAAGATGAGAATATCAAAGTGATTGGAGTGATTCTTCGGTTGCCCGGTGTGTTTAT
GTTGGAACTCCTGTACATGGAAGCTCTTACCCTAAAAAACATTATTGGTTTCAATGATAT
CCTAAATATTGATTTCGTACTTTATGTCATAGCGTGGTTGCTTGTGGTTCTTCCCATAAA
ATTGTTGATCAAAGTTTACAAAAATTGCATTGCTGCTGGATGTCTGGTTGCAAGTCACTG
TGTGTTTTATAAATTACTTATTCAGTCACAAGTTATTGTACACATGGATGATTATGGTAA
CCTAACACCTTCTCCAACTTGGAATGGATCATGGTTGCTTCTTGTAACGAATAGTAGAAA
AAATACCGAAACCTGCATTACTACCATTTTGCTACAAACTTCACTTGCTCTTCTTACATA
CAAATTATGGGATCGTAAACCACCTTTTGTTGGTGTCGTAATGTGGCCGATCTTATCATG
GCTAACAGGATATTTCCAACCAAGTGTTTTGGTGGTTTTGTTACAAACTATGTCATATTT
TGCACTTGCGGGACTTTTATTTTGTTTATTTAACAGTTTGGTTATCTTACGAAACCACCT
CCGGCAGTTTTTATTAAAATGTCGAATGGTAATTACAATATTTGGATGGCAAGCTATGCT
GACATGGGCACGTGAAGAATATCAAATTCAGCATCTGCTTGTTACTTGCTGGTTGCTGCG
ATATTTTATTCAAGCTTACACAAACATTCATCAACAACTCAACATTAGTAACTTGAACAC
AGACTTGTTTAACCACATCAATGTTAAAGTGGTGAACTGGAAAAATGCTCATATAGTAAC
AACAATGTTTATGGCAGCAGTTCAGTGCATGACAACTACCATCAACTTGTTTGGATTTGT
TTGCATAGTGAAGGAGGTCATCAAGCTGCAATATTTTATAATAAGGTCATGGCTTCATTG
TTCATTTCACAACCACCCACCAGATCCAGTCAGCGACCCCTTAACTGGTACCATTGATGG
AATTACTTTTCTTATAATGTCCCTTTACACTGATATTCTTAACACAGACCTAGAAGGAAG
ATTTCTTATTTTAATTTATATTTTATTCACAATTGCTTCATCACAATTTCAGAGTATCTT
CAATATAATTGATCCAATTCTTATGACATTGGCGACTGCTCACAATGGAACTTTTTGGAA
ACATCTTCGCACTGTCATGTTGGCAACTGTGTTGTTATTCATATCTGGTGTTTTATCATA
TATCTCCTTTTTTACAATGAGTTCAACATTCTGGGTGTTCATCATTGCGTACAATTATGT
GAACACTTTCTCATTAATGCTGGGCTCAATGTCAATTTACTTGGTTTTAATGATTGACTA
TCACACACTGCGTGGATGGCAGAGTTTGGATGATGTAATGTTTTACATACGAGGTGCATG
TAGAGCTGTAGAGTTTATAGTTACGCTCTGTATGTGTGGATATATTATGATGACTTTCTA
CATGGAAATGACAAGTGCAGCAGGTATTGTAATGCTGGCTGCTTACACATATTACTGTAT
TGTCCAACGGGGTGGAAAGGGTTGGAAGATTTGGATGATGAGAAGACAAGCTTCTTGTAA
AGTTCAATCACTGCCAAGAGCAACCAAAGAAGATCTTCGAAATAAAAGTGATTTATGTCC
AATTTGTTACCAGATGATGGAGAGCGAAGTACGGGTCATGCACTGCAAACATTATTTCCA
TGAGAATTGCCTTAAGAAGTGGTTCTACATTCAAGATAAATGTCCGTTGTGCTACGCTCA
GTTTCAATCAGTTGCTTTCTAACTTAAATAAGCAATAAAACACCATTATTATAAAGTTTG
TGACTACCCAATTTAAGAGTTAAAGTTTGTGACTACCCAATTAAAGAGTTAAAGTTTATG
ACTACTCATAAAGTCCTGGGGCAATGAAAGGTTTAAAGACTGAGTTACAACATACGCCAG
CTTGTGTCTCATTAAACCTTGCACCCTAATCTCTGTGCAATATAGGCAGGTGTGTCATGG
AACCAAACGTTACACATATCTATTCAAATGGCCTGTTATTTAGGTAACCCAAGTAGCCAG
TACATTTTATTTTACTTTTCAATGACCTGTTTATGTAGCATCAGCTAAATTTTTGTTTTG
TTTAGATCAATTGGTTTTTTGTTCATTGTGCATCTAAAAAGCCTCAAATACTACAACACT
TCAGCAACCCGTAATCCTAAATAATTTTACAATGATTCTTTCTACTTAAAACCATGTTTT
GTGTTATTGGCTGCAATTACATGAAGTTGATAAATTAACGATTTTAGTTGCTATATTCGG
TACACCAAAACAAAATAAATCTTGCCGCTAACGAAACATTAACAGTGAAGACCATTATTG
TAAAGCACTGTGACAAAGTTCATACCTTTTTCTGGCTTTGCTACTACATATGGTGTATTT
ATAACAGAAAATACATGTAACTAAGCA

InterProScan

Pfam
TRC8_N_dom (IPR025754) - T[17-538] 6.4E-55
Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[542-614] 4.3E-15
Pfam
Znf_RING (IPR001841) - T[568-607] 1.2E-9
ProSiteProfiles
Znf_RING (IPR001841) - T[569-607] 11.973
SMART
Znf_RING (IPR001841) - T[569-607] 8.0E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RN139_HUMAN 26.551 % 154 1.23E-39
RN145_HUMAN 27.07 % 201 3.82E-56