- Transcript 'KH2012:KH.L153.21.v2...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.L153.21.v2.A.SL9-1
Possible name(s)
CTSD; CTSE; REN
Gene model
Location
KhL153 [511,702 / 516,739]
Amino acid sequence
Length: 404
>KH.L153.21.v2.A.SL9-1
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KYLKFMAANAAPEPLTNYLDAQYYGKIYIGTPPQPFTVVFDTGSSNLWVPSVHCAITDIA
CLIHNKYKASESSSYKSNGTSFAIQYGSGSLSGYVSSDIVSIAGVKSKNQLFAEATKEPG
LTFVAAKFDGILGMGYPEISVNGITPVFNQMFKQEALAHNQFSFYLNRDANASSGGELYL
GGVDTKKFTGSFSYHPVTVKGYWQISMDSVSVGSSTSACVSGCKAIVDSGTSLLAGPTDE
IEKINKLIGATKFLNGEYIVQCNKMATMPDITFSLSGVKYILKPNDYVMKESTAGESICI
SGFMGLDVPPPRGPLWILGDIFMGKFYTTFDFANNRVGFAQLAK
Nucleotide sequence
Length: 3,454
>KH2012:KH.L153.21.v2.A.SL9-1
CCATACAGGTTTTCCTTATTGTAACTGTTATTTTAATTTGAACATCATGAAAATCGCTGC
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AAAATACCTGAAATTCATGGCCGCAAACGCTGCCCCAGAACCACTTACAAATTACCTAGA
CGCTCAATATTACGGCAAAATTTATATCGGAACACCTCCACAGCCCTTTACTGTTGTTTT
TGATACAGGGTCTTCTAATCTATGGGTACCTTCTGTACATTGCGCTATAACAGATATCGC
ATGTCTTATCCATAACAAGTACAAAGCTAGTGAATCTTCCAGTTACAAATCAAACGGCAC
TAGTTTTGCTATACAGTATGGGAGTGGCAGTCTTTCTGGTTATGTCAGTAGTGATATAGT
TAGCATTGCTGGCGTAAAAAGCAAAAACCAATTATTTGCTGAAGCTACAAAAGAACCTGG
TCTTACTTTCGTTGCCGCGAAATTTGACGGCATTCTTGGTATGGGCTACCCTGAGATTTC
TGTAAACGGTATAACACCAGTGTTCAACCAAATGTTTAAGCAAGAGGCTTTGGCTCATAA
CCAGTTCTCGTTCTATTTAAACCGGGACGCCAATGCTAGTTCTGGAGGGGAACTGTATCT
TGGCGGTGTAGATACTAAAAAATTTACTGGCAGTTTCAGCTACCATCCTGTTACTGTAAA
AGGCTACTGGCAAATTAGTATGGACAGTGTGAGCGTAGGCAGCTCTACAAGTGCATGCGT
TTCTGGCTGCAAAGCTATCGTAGATAGCGGTACTTCACTTTTAGCTGGGCCCACTGATGA
AATTGAAAAAATTAACAAGCTTATTGGTGCAACCAAATTTCTAAACGGCGAATATATAGT
TCAATGCAATAAAATGGCGACCATGCCCGATATTACATTCTCTTTAAGCGGTGTTAAATA
TATCTTGAAGCCAAACGATTATGTTATGAAAGAATCTACTGCTGGTGAAAGCATATGCAT
CTCTGGTTTTATGGGTTTGGACGTTCCTCCCCCTAGAGGACCCCTCTGGATTCTCGGCGA
TATTTTCATGGGAAAATTCTACACTACGTTTGATTTTGCTAATAACAGAGTGGGATTCGC
ACAGTTGGCAAAATAAATTTAAAAGAACTGCCAAAAAATTATACAGAAACATAAAATATA
TTCTCAAAAAAAATTTTCAAAAAAATTATCAAGGAACATAAAAACATTTTCTCATGGCAT
ATAGCTTTGTGTATTGGTTATCATACATGCATAACACTTGTGTTTTCATTAAATGTTTAT
AAAATTTGTCATTATGTACCAACATTTGTTTGAGTTTTCCTTCTGGTTAAATATAGTTGT
ATTATTATTCAGTGAAATTAATTTCATTTAATGCATTTTGTCAATGGTAAAAATGCAATT
GAATAAAATTCATGGTACAAACGCATTTTATTTAACTATAACAGTGCTTCTCAACTTTTT
CAGTGTGACCAAAATAAAACATTTTTTTTAGTAAAAAACATATATATATATATATATGAT
TAGTAAAAAAACTTTGGCTGAAAAACTTCTAAAACTACATTTAAACGCAGAAATAACTTA
AATTAAAAAAACAGTTACAAAAAATACTTTCAAAATATTGTAGTAAATAACCTTAAGAGT
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AGTATATGTAAAAAGGCAATAAAAATTATAATTTCATTTTTTTCATTACTTAGATTCTAG
TAAAATGTCCCATAGGAGTTTTAGTGTGTTCAGAAAAATATTTTCTGAATTTTCAAAGTT
ACCATTAAGGGGTGTAGCAATAAAACAGCAAACTGCGTATACACATAAAAGTGAATTGTT
GGCGTCCTTACAGCAAGTAAAAACGTTTCATACTACCCCTATTGTTGCAAAGGACAAAAT
TACAATCAATCTAATAGACAGAAAAGGCGAGAAGCACACCACTTCTGCTAACATTGATGA
TACTATACTAGATGTTGTTTTAGACAATGAACTAAACTTTGAAAGTTTTGGAGTGTGTGA
AGGTACGGTGTCTTGTTCTACTTGCCATGTTATATTCGAAGATGGCGTTTACTCGCTATT
GGAAGAACCGTTGATGGATGAAATGGACATGCTAGACTTGGCTTGCGGTTTAACAGAAAC
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ACCTCGTGAAATTACTGATGCCAGAGATGTATAATGACAATAAAAACCAAACTTAGGAAA
TACATAATACATCTGTACCAGCATTTTGAACATTTTTTACATTGTGATATAGTAGGGTGC
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ATTTCAAAGAATTATAAATCCCTATCCTCACAACTCCCATAGACCGTTGTTTTGTTTAAA
ATATTATCGGAATATTGGGATATTATTTTGCTAAAGGTGTCCCATCTTCCCCCACAGTAC
TATACGAAAATGTACGACTAGTAGGTTGTATAATTTTAACAATTAAATACTGTTAAAAAA
TTATTTATCTGTAACAACTTTTTGTAGCATGGTAATTTTTTTTACACAGACATTTTTGAA
CTCATAAAATACAGACTGTAGCAAAGTGCTTTCTAATTTTAGTAGCTAGTTAGTCCAACC
TCCATAAAACTGTTGAATAATACAGTAAGAAAACCCACATTTCAATAAAAAAAAAAGTTG
TCGAATTATTTTAGATGTAAAAATGTAAAGCCGAAATTTTTTGCAAAAATTATAAAATTG
TAATTTTAACAGTACTAAAAATAGTTGCAACACTGGTATATTACCATTTTTAACAGTACT
GCGTAATAAATATACATTTTTCTTACTAAAAATCTATGCATTTTGTACACACAATCACCT
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TTTTCGGTTTTATTTTAATTTTAGAAATCAAGGAATTTCTTTAGTATAGTAGGGTGGGGA
AGATGGGACACCTTTTCATTCTATTTCCTGGTCACATTCGGTAGTAAACAAAGAACATTT
AAAGAATTATAAAACCGTATCCTCACAAATCCCATTTACCGTTGTTAATTGTTTAAAACA
CGATCAAGATATTTAGATATTATGTTCTAAAGGTGTCCCGTCTTTCCCAACAGTACTATA
TATACCCTTTAATTTATTTTTACCTACCTTGTTTTAAAAGTTTTGTGGTGTATGTATTAA
ATGGTGGTCGGATTACATAATATGTTTTAAGATA
| PANTHER |
Aspartic_peptidase_A1 (IPR001461) - T[20-402] 1.8E-150 |
| SUPERFAMILY |
Peptidase_aspartic_dom_sf (IPR021109) - T[21-401] 2.82E-122 |
| Gene3D |
Peptidase_aspartic_dom_sf (IPR021109) - T[65-164] 4.0E-40 - T[165-402] 4.2E-83 |
| Pfam |
PEPTIDASE_A1 (IPR033121) - T[82-401] 2.1E-123 |
| ProSiteProfiles |
PEPTIDASE_A1 (IPR033121) - T[83-400] 80.184 |
| PRINTS |
Aspartic_peptidase_A1 (IPR001461) - T[89-109] 3.2E-27 - T[236-249] 3.2E-27 - T[285-296] 3.2E-27 - T[376-391] 3.2E-27 |
| ProSitePatterns |
Aspartic_peptidase_AS (IPR001969) - T[98-109] . - T[285-296] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CATD_HUMAN | 54.639 % | 444 | 1.84E-155 |
| CATE_HUMAN | 46.667 % | 368 | 1.04E-125 |
| RENI_HUMAN | 45.43 % | 348 | 7.62E-118 |