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  1. Transcript 'KH2012:KH.L153.46.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L153.46.v1.C.SL1-1

Possible name(s)

SELENOV; SELENOW

Location

KhL153 [112,056 / 113,687]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 73

>KH.L153.46.v1.C.SL1-1
GYRPRYERLKDDLSKDYDQNEVEFSSEGTPEVTGYLEVLVNGTLVHSKKNGDGYIDSEAK
LKKICNAIDKCLQ

Nucleotide sequence

Length: 1,428

>KH2012:KH.L153.46.v1.C.SL1-1
AATTATATAACCGTGATCTATGACCAGTTTAAGAGTGTTGTTAATTGTTGAAAACCCGAT
CAGGAAATATAAGATTTAATGTGGTAATCTTACTAGAAAATAATTAAACACAATGACTTG
TTTGTCTGTTAAGTGCAGTGTAGCAACCACACTTTTAAATGTAAATATTGACTCCTATAT
CATATATTCAACCAAAATATTACAATGCCCAACAAAGTGAAAATACATGTAGTTTATTGT
GGTGGATGAGGGTATCGCCCACGCTACGAACGACTAAAAGATGATTTATCCAAAGACTAT
GACCAAAATGAAGTCGAATTTTCTTCCGAAGGCACCCCAGAAGTAACAGGCTACTTGGAA
GTCTTGGTTAACGGAACACTGGTTCATTCTAAGAAAAACGGAGATGGCTATATCGATTCG
GAAGCAAAACTCAAGAAAATTTGTAACGCCATTGATAAATGTTTACAGTAAATAAATTAT
ATATTAATAGCCCTTAATTAAAAAATGTGGAAAATTCATCTTGGACTAATTCCTTATTTT
ATTACAAAATTTGATCATTTTAAAATGTACACAGTTGATTTTGGCCTCTTTTGGGTATAA
TTGTTTATTTTTTTTACAAAATTTGGTCATTTATTTCATAATAAAATTTTAATGATGTTA
ACCTTTATGAAAATTGTGAGACTCCATTTCATATCACATGAGCACTATATGACGAGACTA
GTTTAAACTGTTTCAGTGACTAAGCTTTGATGATTTGTACTTATGTGTATGAATATGATA
GTCCACTTGTCCTACTGTTTAAAAAACCTCATTTTTGTCAAAACTATTCAGTTTCTGTAA
CTTTTTTTCGTATCTATGCTTTACAAATGTTGTGGTTTTGGTAACTTATGACGTATTAGA
TCTAAATGGTGACATGATTTAATATTGAGCACTCTACCATACATAACATACTTTGCTGTT
TTTGTTGTTTTGTTACAGAATGGTGCTGTGGGTTTTCAGTTTTCCTAAAACGGATAAAAA
AATGTGTGCTAGCAGTTTGAAGGTTTTAAAATCAACTATTAATTCCAAAAACACTAGTAT
GTAAATATGTGTGCTGTCAATTTGAAGTAAAAAAAAATTATACTTTTTTTCAGAAATGAT
TCCAAAAAATGAAATATAGATTCCAAAAAATGAAATATAGATTCCAAAAAATGAAATATA
GATTCCAAAAACTTGTATGGTACATGCCCTAAAACTGTAAATGTTTGTTTTTTTCCTAAA
GGCTAAAGATATTTTTATCACAAATACTGTATATCATACTACTTCCAAGTTTACACCTCC
TTATCAAATGTTGCTTCACTATTGCTAACTATACCTATTACTTATGTTTTTTTCCAGCAA
CGGATTTTGTATTGTCCACAATAAAGAGAAAACGTGATGTGTAAAACA

InterProScan

TIGRFAM
Selenoprotein_Rdx-typ (IPR011893) - T[1-64] 1.3E-11
SUPERFAMILY
Thioredoxin-like_sf (IPR036249) - T[1-69] 1.12E-7
Pfam
Selenoprotein_Rdx-typ (IPR011893) - T[1-63] 3.2E-5

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SELW_HUMAN 44.444 % 70.5 4.92E-18