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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.L85.1.v2.A.SL1-1
Possible name(s)
ARPP21; R3HDM1; R3HDM2
Gene model
Location
KhL85 [11,168 / 51,438]
Amino acid sequence
Length: 913
>KH.L85.1.v2.A.SL1-1
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SVEPINEENKVSRKKLSRGKSLNHDEMCDKQELVHDESVFPSPFVITQEEVRYSIHILNI
TILSYTSLFCDCQESFTYNCQTYLIIYLSLTIVFNTECLDSMGVDVHEFLVKALQGNSRD
RSILLKLEHDMVQFVSNSEIAFMKFPEMTSYHRMLVHRVAAYFGLDHNIDAKGKSVIINK
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SFEEREVNYEKIRARIFNEAEQLNDGLDKSQVGDLWSRKQWDGTEQSSSRDNSSSPLPPS
DDTPSNLRPKPGITVLSRRHNPEFNGSTSPSSSTSSTNQFVANESSNEHLNGGTHVPSYQ
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NHDTAQQLSHSSSAHNYVYNGEPAQGGQIPIFPNGNMNEEMFTEECHPVLVGGDNIVLTS
PMLNVFAAKYNSKIAQLQLNEESDNSIYLVFQSTDDMNRALEDHKSGNEKFSLSEIANMD
ERNEVILQIRTVQ
Nucleotide sequence
Length: 4,610
>KH2012:KH.L85.1.v2.A.SL1-1
TTTTGCTTTATAGATTCATGTTATGATGGTGACAAAATTAGCTTAGTTTCCAACTTGGTT
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TCAATAGAAATTCTAAGGTGAAAATGTCTGTTGCTCTGTCAATGACAAACTCAACAGAGC
CAATGCTTCATTCTGCATCCAATATTCCCCTTTCCTCGTGCACAGATGCAACCGTGAATG
TTGAAGCACAGAATGGTAGTTTAGATGAAGCTTGTAATATTGAATCTACAAATATTCAAT
CTGTTGAACCAATCAATGAAGAAAATAAGGTTTCTCGTAAAAAACTAAGCCGCGGCAAAT
CCCTGAACCATGATGAGATGTGCGATAAACAAGAACTTGTTCATGATGAATCAGTGTTTC
CATCTCCATTTGTCATTACCCAGGAAGAAGTAAGATATTCTATTCATATCTTAAACATCA
CTATTTTAAGTTATACTTCACTGTTTTGTGATTGTCAAGAAAGTTTTACTTATAATTGTC
AAACATATTTAATCATTTATTTAAGCCTGACCATTGTTTTTAACACTGAATGTCTTGATT
CGATGGGAGTGGACGTGCATGAGTTCCTCGTTAAAGCTCTGCAGGGAAATTCCCGTGATC
GTAGCATCTTGTTGAAGCTCGAACATGACATGGTTCAATTTGTCAGCAATTCAGAGATTG
CATTTATGAAATTTCCGGAAATGACATCCTACCATAGAATGTTAGTACATAGAGTTGCTG
CATATTTTGGTTTGGATCATAATATTGATGCAAAAGGGAAATCTGTGATCATCAACAAAA
CAGCGTACACAAGAATGCCTGAGAAGAAGTTTAGTGACTATTCATATCACGGTGAAATAT
GTAGCTCACGTGATGAAGATATGAGACGCAGATCGATATTGAAAAGGATGAAAAATTGTC
AAAGTTTTGAACATTTCAAGTCTGAGCCCCATAAAAGTTGGAAGATGATGAAGCAACGAT
CGTTTGAAGAGAGAGAAGTTAATTATGAGAAAATACGTGCAAGAATTTTCAATGAGGCTG
AGCAACTAAACGATGGTCTTGATAAATCACAAGTTGGGGATTTATGGAGCAGAAAGCAAT
GGGATGGAACAGAACAAAGTTCTTCAAGAGATAACAGTTCCTCTCCACTGCCTCCTAGTG
ATGATACACCTTCAAATCTGCGACCAAAACCTGGAATCACAGTTTTATCCCGTCGGCATA
ATCCAGAATTTAATGGTAGCACCAGTCCTTCCAGCAGTACCTCTTCTACTAACCAGTTTG
TAGCAAATGAAAGTTCAAACGAGCATTTGAATGGTGGCACACATGTCCCGTCTTACCAAG
GAGCTCCGTATGTAACTGTTGATGGCCAACCCCTTTTGTACCCATCTAAACCCCTCATGG
TCCCTACATACCCCACACCACCCTTCCCCGTGCAGATGGGCTACCAACCCCTTCACAGAC
CCAACAAATTCTACTCCACCCATTACCCAGCCCATAGGCCTCCATATGCCAACAATCACT
GTTTCATGCGACAAGATTCCAGAGAAAGCTTAATGTCTCACCCACGTAATGGTTACTCTA
ATGTACCACAAATGACTGAAACAAGTGAAGGAAATTACCCCCAGCCCCAGTACTACCCCC
CTACCTACCAACCTGCTCCAGTTCAACTGGTATATTACCCCAACCCTGTACAGGTGGTTC
CAGTTGGTAAAAACAATCAACTTACATTGAGTGAAGATGACAAAGAAAATATTAATTCTA
AAATGGATGAATTGAATATTTCTGATACACAAACTCAAGTGGTTTCTGATGAATCAAATC
TGTCTCAAACAAATGAAGCTTCTGAGAATAATGAAGCATCTAATAATGTAAATAAACGTT
CACTCAATCAGAATGGTTATACAAATGAGGTTGGTCTTGATGTTAAAGTGCTCAATATAT
CAGAGGCCATTACAGTGATGCCAGATAACGGTGTTGCCGATCTACAAAATACGAAGAGTA
TTGTAGAAACAGATGAAGTAGCGAATATAAGCACAGTAGCCACAACACCAGCTAACGTAG
TTTCCACAATTCATGCTGGACCCGGTAGTATCACATACTACACCCCCAACACCATCACCG
CCTCAATTAACACATCACATCCCCAACCTGGGGTGGTGGGGCCACCAGTAATTCCCCCCG
CAAACCCACACCTGGGTTTTGGAAATTCTACCCCAAGCACTGACATGAATGCTCAGGCAC
GCATGCCGGCTTACTATATACCAGGTTACCCCAACAACCCAATGTTTAACTACAACCCAC
CACCTCCACAAACAGTTTATTATGTGATGGGTCCTAATGGTTTGCAACCTTATCAGGTTG
TACCAAACCAACCACCAATGCACTACAACAACATTTTTTACCCTCCTACCTGTCTTTACA
ATCATGACACTGCCCAACAACTAAGCCACTCATCAAGTGCACATAACTATGTTTATAATG
GTGAACCAGCACAGGGCGGCCAGATACCAATATTTCCCAACGGAAACATGAATGAAGAAA
TGTTTACTGAAGAGTGCCACCCAGTGTTGGTAGGGGGAGATAACATTGTATTAACATCAC
CTATGTTAAACGTGTTTGCTGCAAAATATAATTCCAAAATCGCCCAGCTACAACTGAATG
AAGAATCAGATAATTCTATTTACCTTGTTTTCCAATCCACTGATGACATGAATCGAGCAT
TGGAAGATCACAAGTCTGGGAACGAGAAATTTTCACTTTCCGAGATTGCTAACATGGATG
AGAGGAATGAAGTCATCTTACAGATCAGAACTGTGCAATAATCTATCTCCAAGTGGTTTG
ACAATGATGGGTGTACGATGTAACAGATACTTTACAGTTATCATGGCTCAAACTGTTCAT
TCAACTTTTTGTTTACCTCCATTCTGACAAATTAAATAAAGAAGGCCTTACAATGCTAAA
TTTTTCATGATGTATCACTGCTGTGTATTTATTTCTCACAAGTTTTTATGTTGCACAGCT
GTTGCATTTTACATGTTTTCCTTAACCCTGCAATCATGATTTTTACCCCCGTCACTAAAC
AAACTTTACACTTATAATCATGCTGAGTAAAAAAGACCTAATTTTCAGCACTGGTTTGTT
GTATCTGAAGCCTCTAGCTATATAGAGTATCGCCTATATCTTCGTTCGACTTACCATGTA
TTAGGCAAACAGTTTAATGTTGCTGTTCCACTGATTCAGTATCATTTATAAACTAAAAAA
TAGCCAATCACGCACTGTGGTATGAATGTACCCACAATGTAGGTGTGTCCTATCAAGAGT
AAAAGCTATTTTCTCCTGTTTATAGACAATCTTGTGTTTGTACGCTTGTTACTGTCGAAG
CTGTCCCATGTTACTCTCAAGGCTACATGTGAAGGTTGAATAACTTGAAATTCTGTTCCA
TCCTTTTTTACGATTTTTTTTATTTTTACTAAAACTTAGAATTTTTTTAAAAAATTGTTC
TTGTTCATACTCTCCAAACAAAGTAGTTAATGGTATGTAGCCCAGACTCGTTGCCTAATC
CTCTCTGTGGTGCTGATGTAAACTCGTGCATGTCTGTTGCAAGTTCACCCCCTTTTCTTC
ACATTTTTCACCAGATATGGGAATCCTGCCTCTTACACACACACATAGGACATTGAATTA
TACTAAGTTAAACGTCACACCATTGCCATGTACATGTGATACGTAAGTTTTTGGTTTACT
TTAATGGTGCCTGATCAGTTAATTCCACTGCTAATAGCTTTTTTAGTAGCCCTGTTTTTT
CAGCTTTTCTGTATTTTACTTTTATGTCGATGTAAGAAGAAATATCGGAAAATAAATTGT
TCTTTTGTGCTCCCAATTAAAAGAATTGTTTAGCAGGTTATGGCAGGCCTGATTAGTTAT
ATGTAAGTCCTAATATTTATGCTTCCGCTGTAAAGGCAGTTGTTGTTTGTTGACTGGCGT
TATTCCAAATCCGGTAAACACCAAATAATGAATGTAATTTATTTACGCTCACCAACAGCC
ACAATAACATGGTATTCGGTTTTAAACGCATCATGCTCAGTTTCAACATAACAGTTTTCA
CCAAAGGTAGTAAAGACCGGTTTACACCAAGTGCGCTTTACACATCACTCACTAACTCAG
GTGCGGATCCAGGGGGAGGAGGGCGATCGCCCCTCCTAGACCTGGCCGTAGCACAAAAAA
TCACTATATTTTTCTTTTAAACTAAAATCTGTTGCAACTCGACGCCTAAAGTGACGTCAC
CCAACCACAATAATCCGTCAATCACGTCAACACTGCGGATACGACTTATCTCATGGGAGA
CTATTCTCATGAAAATACACCCCCCGTTGAACGAGGTTGATGATATCCCGTTTAGCCGCT
GACAGGCCCAAATCGATTCCATTTTAACGCGTGACGTCACACTGCTGTCACGTGATTCTG
TCCGATATATAATTCGCCCTTTCCCTAACATAAGAACTAATAACAAGAAACCACTTTCTG
CACTGAGACCTCTGCCCAGCCGTCAAGCAAGCTTTCGCCCGATACCGTAT
| Gene3D |
R3H_dom_sf (IPR036867) - T[154-280] 2.7E-40 |
| SUPERFAMILY |
R3H_dom_sf (IPR036867) - T[158-256] 3.34E-28 |
| SMART |
R3H_dom (IPR001374) - T[164-241] 5.3E-11 |
| ProSiteProfiles |
R3H_dom (IPR001374) - T[181-244] 11.956 |
| Pfam |
R3H_dom (IPR001374) - T[184-238] 6.0E-11 |
| ProSiteProfiles |
SUZ (IPR024771) - T[245-321] 10.905 |
| Pfam |
SUZ (IPR024771) - T[268-320] 7.7E-9 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| ARP21_HUMAN | 46.914 % | 159 | 4.34E-40 |
| R3HD1_HUMAN | 49.39 % | 161 | 1.9E-40 |
| R3HD2_HUMAN | 54.167 % | 145 | 1.26E-35 |