Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Clone 'ciht012g18' > 
  2. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S503...' > 
  3. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S1...' > 
  4. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S81....' > 
  5. Transcript 'KH2012:KH.L85.1.v3.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L85.1.v3.A.SL1-1

Possible name(s)

ARPP21; R3HDM1; R3HDM2

Gene model

KH2012:KH.L85.1

Location

KhL85 [11,168 / 51,438]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 913

>KH.L85.1.v3.A.SL1-1
LNRNSKVKMSVALSMTNSTEPMLHSASNIPLSSCTDATVNVEAQNGSLDEACNIESTNIQ
SVEPINEENKVSRKKLSRGKSLNHDEMCDKQELVHDESVFPSPFVITQEEVRYSIHILNI
TILSYTSLFCDCQESFTYNCQTYLIIYLSLTIVFNTECLDSMGVDVHEFLVKALQGNSRD
RSILLKLEHDMVQFVSNSEIAFMKFPEMTSYHRMLVHRVAAYFGLDHNIDAKGKSVIINK
TAYTRMPEKKFSDYSYHGEICSSRDEDMRRRSILKRMKNCQSFEHFKSEPHKSWKMMKQR
SFEEREVNYEKIRARIFNEAEQLNDGLDKSQVGDLWSRKQWDGTEQSSSRDNSSSPLPPS
DDTPSNLRPKPGITVLSRRHNPEFNGSTSPSSSTSSTNQFVANESSNEHLNGGTHVPSYQ
GAPYVTVDGQPLLYPSKPLMVPTYPTPPFPVQMGYQPLHRPNKFYSTHYPAHRPPYANNH
CFMRQDSRESLMSHPRNGYSNVPQMTETSEGNYPQPQYYPPTYQPAPVQLVYYPNPVQVV
PVGKNNQLTLSEDDKENINSKMDELNISDTQTQVVSDESNLSQTNEASENNEASNNVNKR
SLNQNGYTNEVGLDVKVLNISEAITVMPDNGVADLQNTKSIVETDEVANISTVATTPANV
VSTIHAGPGSITYYTPNTITASINTSHPQPGVVGPPVIPPANPHLGFGNSTPSTDMNAQA
RMPAYYIPGYPNNPMFNYNPPPPQTVYYVMGPNGLQPYQVVPNQPPMHYNNIFYPPTCLY
NHDTAQQLSHSSSAHNYVYNGEPAQGGQIPIFPNGNMNEEMFTEECHPVLVGGDNIVLTS
PMLNVFAAKYNSKIAQLQLNEESDNSIYLVFQSTDDMNRALEDHKSGNEKFSLSEIANMD
ERNEVILQIRTVQ

Nucleotide sequence

Length: 4,610

>KH2012:KH.L85.1.v3.A.SL1-1
TTTTGCTTTATAGATTCATGTTATGATGGTGACAAAATTAGCTTAGTTTCCAACTTGGTT
AAGGAACTGCGTAGATAACTGATCATTAATTATGTTTCAAGTATTGAGAGCAACTCTAGC
TCAATAGAAATTCTAAGGTGAAAATGTCTGTTGCTCTGTCAATGACAAACTCAACAGAGC
CAATGCTTCATTCTGCATCCAATATTCCCCTTTCCTCGTGCACAGATGCAACCGTGAATG
TTGAAGCACAGAATGGTAGTTTAGATGAAGCTTGTAATATTGAATCTACAAATATTCAAT
CTGTTGAACCAATCAATGAAGAAAATAAGGTTTCTCGTAAAAAACTAAGCCGCGGCAAAT
CCCTGAACCATGATGAGATGTGCGATAAACAAGAACTTGTTCATGATGAATCAGTGTTTC
CATCTCCATTTGTCATTACCCAGGAAGAAGTAAGATATTCTATTCATATCTTAAACATCA
CTATTTTAAGTTATACTTCACTGTTTTGTGATTGTCAAGAAAGTTTTACTTATAATTGTC
AAACATATTTAATCATTTATTTAAGCCTGACCATTGTTTTTAACACTGAATGTCTTGATT
CGATGGGAGTGGACGTGCATGAGTTCCTCGTTAAAGCTCTGCAGGGAAATTCCCGTGATC
GTAGCATCTTGTTGAAGCTCGAACATGACATGGTTCAATTTGTCAGCAATTCAGAGATTG
CATTTATGAAATTTCCGGAAATGACATCCTACCATAGAATGTTAGTACATAGAGTTGCTG
CATATTTTGGTTTGGATCATAATATTGATGCAAAAGGGAAATCTGTGATCATCAACAAAA
CAGCGTACACAAGAATGCCTGAGAAGAAGTTTAGTGACTATTCATATCACGGTGAAATAT
GTAGCTCACGTGATGAAGATATGAGACGCAGATCGATATTGAAAAGGATGAAAAATTGTC
AAAGTTTTGAACATTTCAAGTCTGAGCCCCATAAAAGTTGGAAGATGATGAAGCAACGAT
CGTTTGAAGAGAGAGAAGTTAATTATGAGAAAATACGTGCAAGAATTTTCAATGAGGCTG
AGCAACTAAACGATGGTCTTGATAAATCACAAGTTGGGGATTTATGGAGCAGAAAGCAAT
GGGATGGAACAGAACAAAGTTCTTCAAGAGATAACAGTTCCTCTCCACTGCCTCCTAGTG
ATGATACACCTTCAAATCTGCGACCAAAACCTGGAATCACAGTTTTATCCCGTCGGCATA
ATCCAGAATTTAATGGTAGCACCAGTCCTTCCAGCAGTACCTCTTCTACTAACCAGTTTG
TAGCAAATGAAAGTTCAAACGAGCATTTGAATGGTGGCACACATGTCCCGTCTTACCAAG
GAGCTCCGTATGTAACTGTTGATGGCCAACCCCTTTTGTACCCATCTAAACCCCTCATGG
TCCCTACATACCCCACACCACCCTTCCCCGTGCAGATGGGCTACCAACCCCTTCACAGAC
CCAACAAATTCTACTCCACCCATTACCCAGCCCATAGGCCTCCATATGCCAACAATCACT
GTTTCATGCGACAAGATTCCAGAGAAAGCTTAATGTCTCACCCACGTAATGGTTACTCTA
ATGTACCACAAATGACTGAAACAAGTGAAGGAAATTACCCCCAGCCCCAGTACTACCCCC
CTACCTACCAACCTGCTCCAGTTCAACTGGTATATTACCCCAACCCTGTACAGGTGGTTC
CAGTTGGTAAAAACAATCAACTTACATTGAGTGAAGATGACAAAGAAAATATTAATTCTA
AAATGGATGAATTGAATATTTCTGATACACAAACTCAAGTGGTTTCTGATGAATCAAATC
TGTCTCAAACAAATGAAGCTTCTGAGAATAATGAAGCATCTAATAATGTAAATAAACGTT
CACTCAATCAGAATGGTTATACAAATGAGGTTGGTCTTGATGTTAAAGTGCTCAATATAT
CAGAGGCCATTACAGTGATGCCAGATAACGGTGTTGCCGATCTACAAAATACGAAGAGTA
TTGTAGAAACAGATGAAGTAGCGAATATAAGCACAGTAGCCACAACACCAGCTAACGTAG
TTTCCACAATTCATGCTGGACCCGGTAGTATCACATACTACACCCCCAACACCATCACCG
CCTCAATTAACACATCACATCCCCAACCTGGGGTGGTGGGGCCACCAGTAATTCCCCCCG
CAAACCCACACCTGGGTTTTGGAAATTCTACCCCAAGCACTGACATGAATGCTCAGGCAC
GCATGCCGGCTTACTATATACCAGGTTACCCCAACAACCCAATGTTTAACTACAACCCAC
CACCTCCACAAACAGTTTATTATGTGATGGGTCCTAATGGTTTGCAACCTTATCAGGTTG
TACCAAACCAACCACCAATGCACTACAACAACATTTTTTACCCTCCTACCTGTCTTTACA
ATCATGACACTGCCCAACAACTAAGCCACTCATCAAGTGCACATAACTATGTTTATAATG
GTGAACCAGCACAGGGCGGCCAGATACCAATATTTCCCAACGGAAACATGAATGAAGAAA
TGTTTACTGAAGAGTGCCACCCAGTGTTGGTAGGGGGAGATAACATTGTATTAACATCAC
CTATGTTAAACGTGTTTGCTGCAAAATATAATTCCAAAATCGCCCAGCTACAACTGAATG
AAGAATCAGATAATTCTATTTACCTTGTTTTCCAATCCACTGATGACATGAATCGAGCAT
TGGAAGATCACAAGTCTGGGAACGAGAAATTTTCACTTTCCGAGATTGCTAACATGGATG
AGAGGAATGAAGTCATCTTACAGATCAGAACTGTGCAATAATCTATCTCCAAGTGGTTTG
ACAATGATGGGTGTACGATGTAACAGATACTTTACAGTTATCATGGCTCAAACTGTTCAT
TCAACTTTTTGTTTACCTCCATTCTGACAAATTAAATAAAGAAGGCCTTACAATGCTAAA
TTTTTCATGATGTATCACTGCTGTGTATTTATTTCTCACAAGTTTTTATGTTGCACAGCT
GTTGCATTTTACATGTTTTCCTTAACCCTGCAATCATGATTTTTACCCCCGTCACTAAAC
AAACTTTACACTTATAATCATGCTGAGTAAAAAAGACCTAATTTTCAGCACTGGTTTGTT
GTATCTGAAGCCTCTAGCTATATAGAGTATCGCCTATATCTTCGTTCGACTTACCATGTA
TTAGGCAAACAGTTTAATGTTGCTGTTCCACTGATTCAGTATCATTTATAAACTAAAAAA
TAGCCAATCACGCACTGTGGTATGAATGTACCCACAATGTAGGTGTGTCCTATCAAGAGT
AAAAGCTATTTTCTCCTGTTTATAGACAATCTTGTGTTTGTACGCTTGTTACTGTCGAAG
CTGTCCCATGTTACTCTCAAGGCTACATGTGAAGGTTGAATAACTTGAAATTCTGTTCCA
TCCTTTTTTACGATTTTTTTTATTTTTACTAAAACTTAGAATTTTTTTAAAAAATTGTTC
TTGTTCATACTCTCCAAACAAAGTAGTTAATGGTATGTAGCCCAGACTCGTTGCCTAATC
CTCTCTGTGGTGCTGATGTAAACTCGTGCATGTCTGTTGCAAGTTCACCCCCTTTTCTTC
ACATTTTTCACCAGATATGGGAATCCTGCCTCTTACACACACACATAGGACATTGAATTA
TACTAAGTTAAACGTCACACCATTGCCATGTACATGTGATACGTAAGTTTTTGGTTTACT
TTAATGGTGCCTGATCAGTTAATTCCACTGCTAATAGCTTTTTTAGTAGCCCTGTTTTTT
CAGCTTTTCTGTATTTTACTTTTATGTCGATGTAAGAAGAAATATCGGAAAATAAATTGT
TCTTTTGTGCTCCCAATTAAAAGAATTGTTTAGCAGGTTATGGCAGGCCTGATTAGTTAT
ATGTAAGTCCTAATATTTATGCTTCCGCTGTAAAGGCAGTTGTTGTTTGTTGACTGGCGT
TATTCCAAATCCGGTAAACACCAAATAATGAATGTAATTTATTTACGCTCACCAACAGCC
ACAATAACATGGTATTCGGTTTTAAACGCATCATGCTCAGTTTCAACATAACAGTTTTCA
CCAAAGGTAGTAAAGACCGGTTTACACCAAGTGCGCTTTACACATCACTCACTAACTCAG
GTGCGGATCCAGGGGGAGGAGGGCGATCGCCCCTCCTAGACCTGGCCGTAGCACAAAAAA
TCACTATATTTTTCTTTTAAACTAAAATCTGTTGCAACTCGACGCCTAAAGTGACGTCAC
CCAACCACAATAATCCGTCAATCACGTCAACACTGCGGATACGACTTATCTCATGGGAGA
CTATTCTCATGAAAATACACCCCCCGTTGAACGAGGTTGATGATATCCCGTTTAGCCGCT
GACAGGCCCAAATCGATTCCATTTTAACGCGTGACGTCACACTGCTGTCACGTGATTCTG
TCCGATATATAATTCGCCCTTTCCCTAACATAAGAACTAATAACAAGAAACCACTTTCTG
CACTGAGACCTCTGCCCAGCCGTCAAGCAAGCTTTCGCCCGATACCGTAT

InterProScan

Gene3D
R3H_dom_sf (IPR036867) - T[154-280] 2.7E-40
SUPERFAMILY
R3H_dom_sf (IPR036867) - T[158-256] 3.34E-28
SMART
R3H_dom (IPR001374) - T[164-241] 5.3E-11
ProSiteProfiles
R3H_dom (IPR001374) - T[181-244] 11.956
Pfam
R3H_dom (IPR001374) - T[184-238] 6.0E-11
ProSiteProfiles
SUZ (IPR024771) - T[245-321] 10.905
Pfam
SUZ (IPR024771) - T[268-320] 7.7E-9

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ARP21_HUMAN 46.914 % 159 4.34E-40
R3HD1_HUMAN 49.39 % 161 1.9E-40
R3HD2_HUMAN 54.167 % 145 1.26E-35