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  1. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R16....'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C4.351.v1....'
  3. Transcript 'KH2012:KH.S115.4.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.S115.4.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

KHDRBS2; KHDRBS3; QKI

Location

KhS115 [99,954 / 119,006]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 394

>KH.S115.4.v1.A.SL1-1
RIYSKMQSPMHPMQLQLIHQSAATQQMPQPTHIQIQSPPPPLPKPHNYHQQAVVSPPGSA
SPSSSSSSQPTTNGAVVHEEDRKVRDKCLYLKQLLQDKKQIQNLTGCFLHLDRILDEEIV
KVRSVLFQNGDKQPLELPPPQGPTITLTEKVYVPVKDHPEYNFVGRLLGPRGLTAKQLEQ
ETKCKIMVRGKGSMRDKKKEDLNRGKPNWEHLNDELHVLITVEDTDNRARVKMQRAMEEI
QKLLIPTEGEDELKKKQLMELAIINGTYRDYSALSGQPRLMTAPHQVLQAPALRSPTPGQ
PPLNVYNPIISRLPNGQTVISNGVAQPPPMIAPTDGSLLYYTPFEYPHSALAPALEYNIV
DTNGLLGAACGTKIVRPQAGNRVHPYQRPPAATN

Nucleotide sequence

Length: 3,740

>KH2012:KH.S115.4.v1.A.SL1-1
CAGCTTTGTTATGTAATTAACGTGTGATTAATCCTACTAATAATTGCTGATTATTATAAG
ACAACTAAACCGCTGCAAACGCTTTCTGACGTCGATTCTGAAAATCAAATCCGAAGAACT
CAATCCATCATTTATCGCGACCTATTACGTCATACCTACGTCACGACTACTACGTCATTG
ACGCATTTATTCCAAGATGCAATCCCCAATGCACCCGATGCAGTTACAACTCATCCACCA
ATCAGCGGCCACCCAACAGATGCCACAACCCACCCATATTCAAATACAGTCCCCGCCCCC
GCCACTCCCCAAACCGCATAACTACCACCAGCAGGCGGTAGTGAGCCCACCGGGATCCGC
CTCCCCATCATCGAGTAGCAGTAGCCAGCCTACCACCAACGGCGCTGTGGTGCACGAAGA
GGACAGGAAGGTGAGGGACAAATGTCTTTACTTGAAACAGCTTCTGCAAGACAAGAAACA
AATCCAGAACCTCACCGGCTGCTTCTTACACCTTGATAGGATACTTGACGAAGAAATCGT
AAAAGTACGATCGGTGTTATTTCAAAATGGAGACAAGCAACCTCTTGAACTTCCCCCTCC
ACAAGGGCCAACTATAACTCTGACTGAGAAGGTGTACGTGCCTGTTAAAGATCATCCAGA
GTACAACTTTGTGGGACGATTGTTGGGACCACGAGGACTGACAGCAAAGCAGTTGGAACA
AGAAACCAAGTGCAAAATAATGGTCAGAGGGAAAGGGTCCATGAGGGACAAGAAAAAGGA
GGATTTAAATCGTGGAAAGCCGAACTGGGAACACTTGAATGATGAACTACATGTGTTGAT
CACAGTCGAGGACACTGACAATCGTGCCAGAGTGAAAATGCAAAGAGCAATGGAAGAAAT
CCAAAAGCTTCTGATTCCCACTGAAGGTGAAGATGAATTAAAGAAGAAACAGTTGATGGA
ACTCGCAATAATCAATGGAACCTACAGAGATTACTCTGCATTATCTGGTCAACCTCGATT
GATGACAGCACCCCACCAAGTGTTGCAAGCTCCAGCATTGAGGTCACCCACACCAGGGCA
ACCGCCACTTAATGTTTACAACCCCATTATATCAAGACTACCTAACGGACAGACTGTAAT
TTCCAATGGAGTGGCCCAGCCCCCTCCCATGATTGCACCAACTGATGGATCACTGTTGTA
TTACACACCATTTGAGTATCCACACTCAGCTCTTGCTCCAGCATTGGAGTATAATATAGT
TGACACCAATGGTTTACTAGGAGCAGCTTGCGGAACTAAAATAGTTAGACCCCAAGCCGG
TAACCGGGTACACCCGTACCAGCGGCCCCCAGCAGCCACTAATTGACACATACCTTCTGC
ATAAGAAGAACCTGCATGCGTAGATCGCATTAACACTTTAACAGCAACAACCAGGCCCTG
GAGTTCCATGAGATTTTAAATCGTTTGTGCACTAACTAATACGTGCCTTTACGTTCCTAA
AACAGTTACATTCAAGTGCATGTCTACCTGTAGAGATAACTTTCATTAAATCCTTGTTCA
GTGTTACCAAATTTTTCGCCGATAAATGTTAAAATCCGCCCCTTTTACCACAACACAAAC
ACAACACAAACACAACACAAACAACGTTTTCAACACATACACCACACAACCCTCCACACA
CCCCTATCCCACCTAACCCTAACAGTTGGATGCTACTACTTCATTATGCACTTGATGGAC
GTAACAACTTCTAACACCACCCCCCCTGCTTCTTATTGGTAAGCATGTTCACCAATAATT
AGAACAAATTAATTGGTTTGTGGCAAACTTTAGTTCAGTTCAGCTTACAAGCAAATTTAG
TGATTCTTTAAAGACAAAACCAACTCTGGTATAATTCCTTGGAATTAATGCCATTTGACT
TGGTATCCAATTCATATAGAACGATGTTGTGCATTACATTTAGCCTTTGCTGATTTTCAA
CTTAATTTGAAAACCAGTCTTGGCGAAAAATCTGGATAATTAATCTTTTAATCCTGTTAA
GTTTTAAACGGAAAAGTTTGCCCAAAGGTGAAGAGTTACTCTGAATGTTTATCTTTTAGA
TAAACAATTTTATATTAAACTTTAACCTTCCCAAGGGCAAGTTCAAAATCCATCATGATA
ACTTGAGTAATTAGAATGAACTTTGCCCTAATGTAGACAAATCAAGTTCATGATAAAGGA
TATGTAAACAGTTCTGGTTAAGTTGAAATGGGTGATAAAGTTTGTTTAAACAACATTTAA
ACTTTACATAATGATTGAATGTGTGGAAGTGGCCCAATCAGTTTTAGTGAACTAACAGTC
TGTTAATGATAAAATAGCATTTGAAGTGTTGTTTAATGACTCAAAGGTGGGGGTTCATGT
ATATTTCGCATTCTGAGTTCTAGTTTATATTGAAATGGTGTCATATTAGTTAAGACTGGG
ATTTAAACAATGAAGCAGGTATTTCCGAATACAAACATGCACTCAAATTGAATTGGCATA
ACAGTATTCATATTACACATGAAGCTTATTCCATTTCCATGTCATTTTCTATTAATTACC
TTCTATTTTAAAGTGCCTTTCGATATCTTGTTATTGTGGTATCGTTCTGAGTATCAAAAG
TTTCATAATGTTAGTTTTATTGCAAGCCATTGGTTTTCAGCGCTCACAAATTTATTGGTA
ATTGTTTCCAACTTCCATTCATTTTTGTAGTAGGTTGTTTCTTTGGTGCCTTACTGTATC
AAAGTTTGGCAGAATTTTCTCCACAGACGATAAATATTATAACATGTTGTTTAATTATTT
GAATTAAATCTTTAACATTCAACGGCACAAAGTATAAGGTGCTGAAATACTTTTGTATTT
TGTTACAAGTTTATATTCTTCGCTATAAACTGTATTTACCTGTTTGTATTTTATTCATAT
GATTTTTATCGTGTATAAAACGACGTAAGTCGAATGTGGCTTCTTTTCCAAGTTCCGTTA
CACACAAGAAAAGCCAAACTATTGGCAATTGGCCAAGCTAAAGCTGCCAAAGCCAGCTCT
TGCCCGAACCCACAAACTTTTTACACGTCTTATCTTTTCTAAGGTTTATCAATTATCAGT
ATTGAAAAATTTCAATGTAGTTTTATAAAATAAAGTATAGACTCTCACAATGTTGTTTTC
CACTACATATTACCATGACTGTATAACCAATAACTCTTCTTTTTTAACCAGAAATTTTAA
TTTTCTGTGTTCTGTTTTGTTGTATTACAGTCCTAATACAGTGCCGACTAAATCCATTAA
ATTTGCTGTGTTATATGATTTCTATTAATGCATTTGATGTGTCAACTAATCCACTCATGC
CAACACATCACTAACTAACAAGTGCTTTTTGATTCAAGTTTTAATCATTCAACTTGTAGA
TAAATAGGCGCTGTATAGCAATGGGGATAATTATACACTACAGCTTGCCCACCCAATAAT
GTAGCTTTTATCATTTGTAGAATGCACTGATATTGTGCATGATAACTTTCCATTGTTAAG
ATTTGTTTATGTGTTTATATTTGTGGCTTAATCCTTTCTTTATATTGTGACAAAATATTC
ATCTCCACATAAATGATCAAGTTTAATCCAGAATGTTGTGTTTGTTACCTAACAATGCTT
GCTATCGACTCACAATGTACATAACAATGTTCCTTTGTAGTGATGTAGTGTAATGGTGAA
TAAATTGATTTCTGTCACAA

InterProScan

Gene3D
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[85-276] 1.5E-75
Pfam
STAR_dimer (IPR032377) - T[89-130] 3.9E-18
SMART
KH_dom (IPR004087) - T[145-241] 6.2E-9
SUPERFAMILY
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[147-269] 4.43E-32
Pfam
KH_dom_type_1 (IPR004088) - T[150-198] 2.1E-5

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
KHDR3_HUMAN 41.206 % 126 4.51E-33
KHDR2_HUMAN 42.778 % 139 5.81E-38
QKI_HUMAN 54.321 % 301 2.03E-100