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  1. Transcript 'KH2012:KH.S115.4.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.S115.4.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

KHDRBS2; KHDRBS3; QKI

Location

KhS115 [99,954 / 119,003]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 394

>KH.S115.4.v1.A.SL2-1
RIYSKMQSPMHPMQLQLIHQSAATQQMPQPTHIQIQSPPPPLPKPHNYHQQAVVSPPGSA
SPSSSSSSQPTTNGAVVHEEDRKVRDKCLYLKQLLQDKKQIQNLTGCFLHLDRILDEEIV
KVRSVLFQNGDKQPLELPPPQGPTITLTEKVYVPVKDHPEYNFVGRLLGPRGLTAKQLEQ
ETKCKIMVRGKGSMRDKKKEDLNRGKPNWEHLNDELHVLITVEDTDNRARVKMQRAMEEI
QKLLIPTEGEDELKKKQLMELAIINGTYRDYSALSGQPRLMTAPHQVLQAPALRSPTPGQ
PPLNVYNPIISRLPNGQTVISNGVAQPPPMIAPTDGSLLYYTPFEYPHSALAPALEYNIV
DTNGLLGAACGTKIVRPQAGNRVHPYQRPPAATN

Nucleotide sequence

Length: 3,737

>KH2012:KH.S115.4.v1.A.SL2-1
CTTTGTTATGTAATTAACGTGTGATTAATCCTACTAATAATTGCTGATTATTATAAGACA
ACTAAACCGCTGCAAACGCTTTCTGACGTCGATTCTGAAAATCAAATCCGAAGAACTCAA
TCCATCATTTATCGCGACCTATTACGTCATACCTACGTCACGACTACTACGTCATTGACG
CATTTATTCCAAGATGCAATCCCCAATGCACCCGATGCAGTTACAACTCATCCACCAATC
AGCGGCCACCCAACAGATGCCACAACCCACCCATATTCAAATACAGTCCCCGCCCCCGCC
ACTCCCCAAACCGCATAACTACCACCAGCAGGCGGTAGTGAGCCCACCGGGATCCGCCTC
CCCATCATCGAGTAGCAGTAGCCAGCCTACCACCAACGGCGCTGTGGTGCACGAAGAGGA
CAGGAAGGTGAGGGACAAATGTCTTTACTTGAAACAGCTTCTGCAAGACAAGAAACAAAT
CCAGAACCTCACCGGCTGCTTCTTACACCTTGATAGGATACTTGACGAAGAAATCGTAAA
AGTACGATCGGTGTTATTTCAAAATGGAGACAAGCAACCTCTTGAACTTCCCCCTCCACA
AGGGCCAACTATAACTCTGACTGAGAAGGTGTACGTGCCTGTTAAAGATCATCCAGAGTA
CAACTTTGTGGGACGATTGTTGGGACCACGAGGACTGACAGCAAAGCAGTTGGAACAAGA
AACCAAGTGCAAAATAATGGTCAGAGGGAAAGGGTCCATGAGGGACAAGAAAAAGGAGGA
TTTAAATCGTGGAAAGCCGAACTGGGAACACTTGAATGATGAACTACATGTGTTGATCAC
AGTCGAGGACACTGACAATCGTGCCAGAGTGAAAATGCAAAGAGCAATGGAAGAAATCCA
AAAGCTTCTGATTCCCACTGAAGGTGAAGATGAATTAAAGAAGAAACAGTTGATGGAACT
CGCAATAATCAATGGAACCTACAGAGATTACTCTGCATTATCTGGTCAACCTCGATTGAT
GACAGCACCCCACCAAGTGTTGCAAGCTCCAGCATTGAGGTCACCCACACCAGGGCAACC
GCCACTTAATGTTTACAACCCCATTATATCAAGACTACCTAACGGACAGACTGTAATTTC
CAATGGAGTGGCCCAGCCCCCTCCCATGATTGCACCAACTGATGGATCACTGTTGTATTA
CACACCATTTGAGTATCCACACTCAGCTCTTGCTCCAGCATTGGAGTATAATATAGTTGA
CACCAATGGTTTACTAGGAGCAGCTTGCGGAACTAAAATAGTTAGACCCCAAGCCGGTAA
CCGGGTACACCCGTACCAGCGGCCCCCAGCAGCCACTAATTGACACATACCTTCTGCATA
AGAAGAACCTGCATGCGTAGATCGCATTAACACTTTAACAGCAACAACCAGGCCCTGGAG
TTCCATGAGATTTTAAATCGTTTGTGCACTAACTAATACGTGCCTTTACGTTCCTAAAAC
AGTTACATTCAAGTGCATGTCTACCTGTAGAGATAACTTTCATTAAATCCTTGTTCAGTG
TTACCAAATTTTTCGCCGATAAATGTTAAAATCCGCCCCTTTTACCACAACACAAACACA
ACACAAACACAACACAAACAACGTTTTCAACACATACACCACACAACCCTCCACACACCC
CTATCCCACCTAACCCTAACAGTTGGATGCTACTACTTCATTATGCACTTGATGGACGTA
ACAACTTCTAACACCACCCCCCCTGCTTCTTATTGGTAAGCATGTTCACCAATAATTAGA
ACAAATTAATTGGTTTGTGGCAAACTTTAGTTCAGTTCAGCTTACAAGCAAATTTAGTGA
TTCTTTAAAGACAAAACCAACTCTGGTATAATTCCTTGGAATTAATGCCATTTGACTTGG
TATCCAATTCATATAGAACGATGTTGTGCATTACATTTAGCCTTTGCTGATTTTCAACTT
AATTTGAAAACCAGTCTTGGCGAAAAATCTGGATAATTAATCTTTTAATCCTGTTAAGTT
TTAAACGGAAAAGTTTGCCCAAAGGTGAAGAGTTACTCTGAATGTTTATCTTTTAGATAA
ACAATTTTATATTAAACTTTAACCTTCCCAAGGGCAAGTTCAAAATCCATCATGATAACT
TGAGTAATTAGAATGAACTTTGCCCTAATGTAGACAAATCAAGTTCATGATAAAGGATAT
GTAAACAGTTCTGGTTAAGTTGAAATGGGTGATAAAGTTTGTTTAAACAACATTTAAACT
TTACATAATGATTGAATGTGTGGAAGTGGCCCAATCAGTTTTAGTGAACTAACAGTCTGT
TAATGATAAAATAGCATTTGAAGTGTTGTTTAATGACTCAAAGGTGGGGGTTCATGTATA
TTTCGCATTCTGAGTTCTAGTTTATATTGAAATGGTGTCATATTAGTTAAGACTGGGATT
TAAACAATGAAGCAGGTATTTCCGAATACAAACATGCACTCAAATTGAATTGGCATAACA
GTATTCATATTACACATGAAGCTTATTCCATTTCCATGTCATTTTCTATTAATTACCTTC
TATTTTAAAGTGCCTTTCGATATCTTGTTATTGTGGTATCGTTCTGAGTATCAAAAGTTT
CATAATGTTAGTTTTATTGCAAGCCATTGGTTTTCAGCGCTCACAAATTTATTGGTAATT
GTTTCCAACTTCCATTCATTTTTGTAGTAGGTTGTTTCTTTGGTGCCTTACTGTATCAAA
GTTTGGCAGAATTTTCTCCACAGACGATAAATATTATAACATGTTGTTTAATTATTTGAA
TTAAATCTTTAACATTCAACGGCACAAAGTATAAGGTGCTGAAATACTTTTGTATTTTGT
TACAAGTTTATATTCTTCGCTATAAACTGTATTTACCTGTTTGTATTTTATTCATATGAT
TTTTATCGTGTATAAAACGACGTAAGTCGAATGTGGCTTCTTTTCCAAGTTCCGTTACAC
ACAAGAAAAGCCAAACTATTGGCAATTGGCCAAGCTAAAGCTGCCAAAGCCAGCTCTTGC
CCGAACCCACAAACTTTTTACACGTCTTATCTTTTCTAAGGTTTATCAATTATCAGTATT
GAAAAATTTCAATGTAGTTTTATAAAATAAAGTATAGACTCTCACAATGTTGTTTTCCAC
TACATATTACCATGACTGTATAACCAATAACTCTTCTTTTTTAACCAGAAATTTTAATTT
TCTGTGTTCTGTTTTGTTGTATTACAGTCCTAATACAGTGCCGACTAAATCCATTAAATT
TGCTGTGTTATATGATTTCTATTAATGCATTTGATGTGTCAACTAATCCACTCATGCCAA
CACATCACTAACTAACAAGTGCTTTTTGATTCAAGTTTTAATCATTCAACTTGTAGATAA
ATAGGCGCTGTATAGCAATGGGGATAATTATACACTACAGCTTGCCCACCCAATAATGTA
GCTTTTATCATTTGTAGAATGCACTGATATTGTGCATGATAACTTTCCATTGTTAAGATT
TGTTTATGTGTTTATATTTGTGGCTTAATCCTTTCTTTATATTGTGACAAAATATTCATC
TCCACATAAATGATCAAGTTTAATCCAGAATGTTGTGTTTGTTACCTAACAATGCTTGCT
ATCGACTCACAATGTACATAACAATGTTCCTTTGTAGTGATGTAGTGTAATGGTGAATAA
ATTGATTTCTGTCACAA

InterProScan

Gene3D
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[85-276] 1.5E-75
Pfam
STAR_dimer (IPR032377) - T[89-130] 3.9E-18
SMART
KH_dom (IPR004087) - T[145-241] 6.2E-9
SUPERFAMILY
KH_dom_type_1_sf (IPR036612) - T[147-269] 4.43E-32
Pfam
KH_dom_type_1 (IPR004088) - T[150-198] 2.1E-5

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
KHDR3_HUMAN 41.206 % 126 4.51E-33
KHDR2_HUMAN 42.778 % 139 5.81E-38
QKI_HUMAN 54.321 % 301 2.03E-100