Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.S494.5.v1.A.nonSL4-1

Possible name(s)

ALKBH1

Gene model

KH2012:KH.S494.5

Location

KhS494 [46,924 / 49,927]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 342

>KH.S494.5.v1.A.nonSL4-1
RFFASCLTDFVVAPLILRSLNTYNEGGLSKMDDETNDNIFKQTFKYYKQKATQPSFDDVI
DFKNARNLDSVIVKQVPSPSNDLIGELGLKYKENWEIYELKKVPGLFIIPNSFTDKGRRM
WANKCVTEYFKKPHETNVDPFDDNPDKMWESSCEYLQSNAGKGSCTYEDSLSLLKCCPIW
KLRWATLGYHHNWNSKQYSEQPCSELPSELRKTSKLFASMIGTDDFKAEASIVNYYHVGN
ALSPHDDTSELYLEAPLVSLSFGLSAVFLIGGTSKDQKPEALFIRSGDVIIMSGASRLAY
HAVPRILKPTSDAQLKSSSVADNLDLFMSHSRLNINIRQVHS

Nucleotide sequence

Length: 1,740

>KH2012:KH.S494.5.v1.A.nonSL4-1
GTGTCAAGTGGTCACCAAAGCTTACACCCCCTCCTGCAATTAACGTCGCTGCTGTATCGC
CACAACTCCTAACCAACCAAGTTCCAGACACCATAGAGGTTTTTCGCGTCGTGCCTGACC
GATTTCGTCGTCGCCCCGTTGATATTGAGGAGCTTGAATACATACAACGAGGGGGGCCTG
AGTAAAATGGACGACGAGACAAACGACAACATTTTCAAACAAACTTTTAAATATTACAAA
CAAAAAGCCACACAGCCATCATTTGATGATGTAATTGATTTTAAAAACGCCCGGAACCTT
GATTCTGTTATTGTTAAACAAGTACCTTCACCTTCCAATGACTTGATTGGTGAACTTGGT
TTAAAGTACAAAGAAAACTGGGAGATTTACGAGCTTAAAAAAGTCCCTGGTTTGTTTATT
ATTCCGAACTCATTCACTGACAAAGGGCGAAGGATGTGGGCGAATAAATGCGTGACCGAG
TATTTTAAGAAACCTCACGAAACAAACGTGGATCCGTTTGATGACAACCCAGATAAGATG
TGGGAATCAAGTTGTGAATATTTACAAAGCAATGCGGGCAAAGGTTCATGCACGTATGAA
GATTCTCTATCCTTACTAAAGTGTTGCCCGATATGGAAACTACGTTGGGCAACACTGGGT
TACCATCATAATTGGAACAGCAAGCAATACAGCGAACAACCTTGTTCAGAACTCCCAAGC
GAACTTCGTAAAACAAGCAAACTGTTCGCTTCCATGATTGGAACGGATGATTTTAAAGCA
GAGGCGTCCATAGTAAACTACTATCATGTTGGTAACGCCCTCTCACCCCATGATGACACA
TCAGAGTTGTATTTGGAAGCTCCGTTGGTTTCACTGAGTTTCGGGTTGTCTGCAGTCTTC
CTTATTGGAGGGACGAGTAAAGACCAAAAACCCGAAGCTTTATTTATTCGTTCTGGTGAT
GTCATAATTATGAGTGGCGCTTCACGCTTGGCTTACCACGCTGTACCAAGGATATTAAAA
CCTACCAGTGATGCCCAACTTAAATCTTCCAGTGTTGCCGACAACTTGGATTTATTTATG
TCACATTCTCGTCTTAACATTAACATACGCCAAGTTCACTCCTAATAATACACCATATCT
CAACGTCTATACAACCTCAATTTTGGTGATTAGCATAGTTCTAAAGATTAATTAAACGAA
ATATATATTTGTTGATATTGTAAAAGAGAATTTAATAGCTTGGCTGACAATTTGGACAGC
TCGTTAGTGACCACTAGGTTGGAGCAATCGCTGTAGAGTTGCATACACCCACACTTGTAG
CAGCGCCGAGCCTTGAACCTGTAACCTACAAGTTAGAGGCAAGGACGCTAACCACCAATG
TGACAATGCGGGAATATTAATAATAAAACACAGATGTTTTGTTTTTTAACATTTCATTGC
AGTAACACTTTGTCACTTTGGGTTTTTTAAATCTTAATTTTTGCAAATATATTTTTCTTT
TCGCATCTTCCTTTACAAAAGTACAAACTGCATAATAGAATTGCTTTAATAACAGTTCAA
ATCACTCCAAACAATTAAATGATATAATTGCAATGCCGCATATATTGTGTAACATCAATC
TACACACAGTCAACCTGCAACTGCGTGTTTGCATGTTCATAATAGATTCGTATACGAATC
AACTCATGCGCGTATCAATACGTTATGCACCATCCATAGAATTAAACATATCTTAAGATA

InterProScan

PANTHER	Alkb (IPR004574) - T[31-341] 4.2E-95
Gene3D	AlkB-like_sf (IPR037151) - T[132-341] 1.6E-44
Pfam	AlkB-like (IPR027450) - T[181-338] 8.0E-36
ProSiteProfiles	Oxoglu/Fe-dep_dioxygenase (IPR005123) - T[227-341] 9.024

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
ALKB1_HUMAN	34.87 %	192	3.4E-58