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  1. Transcript 'KH2012:KH.S522.2.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.S522.2.v1.B.SL1-1

Possible name(s)

CNTN3; LRIG1; SIGLEC11

Location

KhS522 [43,558 / 49,657]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 779

>KH.S522.2.v1.B.SL1-1
IFSKMNQNIKLYVVYLSLFHVLNTTGNFIHLPASDNKTTRALGISNLKISTTISTTGVSS
CGWRYGGEFDVSGFYSGFGCSNYTGVNETITCVNNSGTVTSQLTLLQPQYKNLNINMQCS
PSPTYSVNITLKQCSATNQVNVTSSKNDYNSIGNASCPSGSELFYKVNGSFVVDRTTTCN
AYAEWTNINNMQCSKGPGTLFITGNYTGGVIRGNKIALHCSYSGETPPAKFSRFYFNQKT
RNVSRSSTWISHPLQASDNNKVVECKAVNQYTNYFNQSHRAIITLNVTYPPQAVATHITV
SRFLLRLQDIYLMRSDQILNMTCSANSNPNPVYRWKICPTATVCIQHNGNYYMGSVPLNT
NSVFCQAQNFLGITKSQRVNITVVSTNRLVSIQATPNTSPENGMKLERHLGHNTTITCSV
DHQGKLNTTHALKLPNGSIITKPTIELAALATTDTGNYSCVTNDVFGSFNGSVYIDVIYP
PQTATPMVICDWVIGNTGFCVITFLSNPPVNMIELKNVKGEIIDQSIQTSHYNTETQVYN
FTVRKVMAKDFGNHTLKVKSTKFPRSGLTITVVINGVGLAPPATTNRALLIAVTSGAFVL
LVILIVIMYILYKKKQKGAAIIKRNNSVNRETVTRAAEVEPHYVPVNINLSYISNTETNT
DQKPRAREPDYVNIQTDVEVTELNNGYVSLAIPVESTEAGNSSNDIQNPYEDLNTKSTKN
KKAGNSRNDNQAFQSPYEDLNTKRVKNKKVGNSSNDNQAFPSPYENLNTKSDKNRSQKF

Nucleotide sequence

Length: 2,978

>KH2012:KH.S522.2.v1.B.SL1-1
GATTTTCAGTAAAATGAATCAGAATATTAAGCTTTATGTTGTATATTTAAGCTTGTTTCA
TGTACTTAATACAACAGGTAATTTTATCCACCTACCAGCATCTGATAACAAAACAACAAG
AGCACTTGGTATAAGCAACCTTAAGATATCAACAACAATATCAACAACTGGTGTTTCTAG
CTGTGGATGGAGATATGGGGGAGAGTTTGATGTTAGTGGATTTTATTCTGGGTTTGGATG
CAGCAACTACACTGGTGTAAATGAAACAATCACTTGTGTTAACAATAGTGGTACAGTGAC
ATCACAACTAACATTGTTACAACCACAATACAAGAATTTGAATATAAACATGCAATGTTC
TCCATCACCAACTTATTCAGTAAATATCACTCTAAAACAGTGCAGCGCAACAAACCAAGT
TAATGTGACATCCAGCAAGAATGATTATAACTCAATTGGAAATGCATCATGTCCAAGTGG
ATCTGAGTTGTTTTATAAAGTAAATGGATCATTTGTAGTGGACAGAACAACAACCTGTAA
TGCTTATGCTGAATGGACAAATATAAACAACATGCAATGTTCAAAAGGTCCAGGGACATT
ATTTATTACTGGTAATTACACTGGGGGAGTTATTAGAGGAAACAAGATTGCTTTGCATTG
CAGCTATTCAGGGGAGACACCACCTGCAAAATTTAGCAGATTTTACTTTAACCAAAAAAC
AAGAAATGTATCAAGGTCATCAACATGGATATCACATCCATTACAAGCAAGTGACAACAA
CAAAGTAGTTGAATGTAAAGCTGTCAATCAATACACAAACTACTTCAATCAAAGTCACAG
AGCAATTATTACACTCAATGTCACTTACCCACCACAAGCAGTGGCAACTCACATTACAGT
GTCAAGATTTCTGCTTAGGCTTCAAGATATTTATTTAATGAGATCTGACCAGATCCTTAA
TATGACCTGTTCGGCAAATTCAAATCCAAATCCTGTTTACCGGTGGAAAATTTGTCCAAC
AGCTACAGTGTGTATTCAACATAATGGAAACTATTACATGGGTTCTGTGCCGCTAAATAC
CAACTCAGTATTCTGCCAGGCACAAAACTTTCTTGGAATCACAAAAAGTCAACGGGTCAA
TATTACAGTAGTTTCAACAAACAGATTAGTGAGCATTCAGGCAACACCTAATACAAGCCC
AGAGAATGGAATGAAATTGGAACGACATCTCGGTCATAACACTACAATCACATGCAGTGT
TGACCATCAAGGAAAACTAAACACAACTCATGCATTGAAACTACCTAATGGAAGCATTAT
TACAAAACCAACTATTGAACTGGCAGCACTGGCAACAACAGATACCGGAAATTATAGCTG
TGTTACTAATGATGTTTTTGGGAGCTTCAATGGCTCAGTTTACATTGATGTTATATATCC
ACCACAGACAGCCACACCTATGGTTATATGCGATTGGGTGATTGGCAATACTGGATTTTG
TGTCATCACATTTTTATCCAATCCACCCGTTAATATGATTGAACTTAAAAATGTTAAAGG
TGAAATAATAGACCAGTCAATACAAACTTCTCACTACAACACAGAAACACAGGTTTATAA
CTTCACAGTACGAAAGGTAATGGCTAAAGATTTTGGAAATCATACTCTTAAAGTAAAATC
GACCAAGTTTCCAAGAAGTGGCCTAACTATTACAGTTGTTATAAATGGTGTTGGATTAGC
TCCACCAGCAACAACCAACAGGGCACTTTTGATTGCTGTCACATCTGGGGCATTTGTGTT
ACTTGTTATTCTCATTGTCATTATGTACATTTTGTACAAGAAGAAGCAGAAAGGTGCTGC
CATCATCAAAAGAAACAATAGTGTTAACAGAGAAACGGTAACTCGAGCTGCTGAAGTTGA
ACCTCATTATGTTCCTGTCAACATCAATCTGTCGTATATTTCAAACACAGAAACCAACAC
AGATCAGAAACCAAGAGCAAGAGAACCTGACTATGTGAATATACAAACAGATGTAGAAGT
TACAGAGTTAAACAACGGTTATGTTTCTTTGGCAATACCTGTAGAATCTACGGAAGCTGG
GAACAGCAGTAATGATATTCAAAACCCTTATGAAGATTTGAACACCAAAAGTACCAAAAA
CAAGAAAGCTGGTAATAGCAGGAATGACAATCAAGCGTTTCAAAGCCCTTATGAAGATTT
GAACACCAAACGTGTTAAGAACAAGAAAGTTGGTAATAGCAGCAATGATAATCAAGCGTT
TCCAAGCCCTTATGAAAATTTGAACACCAAAAGTGATAAAAACAGAAGTCAAAAATTTTA
AAAAGAATAAAACAACAAAATGGATCAGAAACAGAGACCAGAGGCCAAGCTACAGACCTT
TATGATTATTGAGTTTTTTTAACATGTTTAAATATATAGGTGTAAAATTGATCGGTTGCA
CATGTGTGCTGACCAGTCCAACTTTTGAGACATTTCTAATCTTTGTGGCTAAGGTCCATA
CCTAGGATGAAACACAATTCTGGCAGAATAAATATTTATGACTGAAACAGTGGGGATTAG
GTGCTGATGAATTTTATAATAAGGCCCATGATATTTTGCGATAACAGCCTAGTGCCACAT
GGTATCTGTCAAATGAAACTAAAACGTAAAGGCTTTTATAACTGGGTATTTGATATATTT
TTATATTTTGTAAAAGCTTTGCTACTGTTCAATTTTCTATACAATGCACAAAACAAAAAG
AATAACATTAAATTAAATACACTGTATATCGATACACATTGCTGTACTTTTCTAACAGTA
TCTAAAAGTGTTTAGTTTCACAGTATTAAAGTAGTATGGAGATAAATTTGGTCCTTTCAA
CGGTAACCTAAATCTCATTCTGGTATGTGTATAGCTACTGTTGCTTTAATGATGTTTGCA
TTTTATATTTAGCTGTGATCTAACTATATACAAATACA

InterProScan

ProSiteProfiles
Ig-like_dom (IPR007110) - T[291-382] 6.506
SUPERFAMILY
Ig-like_dom_sf (IPR036179) - T[410-482] 1.89E-5

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value