Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.357.v4.A.SL3-2

Possible name(s)

SLC30A5; SLC30A6; SLC30A7

Gene model

KH2012:KH.C10.357

Location

KhC10 [1,546,359 / 1,554,212]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 456

>KH.C10.357.v4.A.SL3-2
SARRTLAFIIFNLLIIFILLSWCKSTNSLALRSFAYLTVFDFFTLITCMISIWSTANQIS
QSEEGTIVFNYERIEVVSVFSSVVLASLGSIFILKECIIRIIDQPEVSIGRLLPGLLVGF
LFHVMITLSVNNKPLQCITNASQSSVLQEHMADMSQTLCSIIPALSKILLPRINPFLLTS
FIGASLIFLTNLLIQMNLYYFADTVSAILISTCTLCTMWPVASCSARVLLNTTPPYLLGQ
LDKLLSEAQTLDGVLEIRNERFYTVSLSVNNKKRYHNGLTMVGSINVRVRRDADEQMVLA
HVTHRLSTLVSHLTVQVSKDDWGSVPMVSSGVINIPRAVRSTSGSKPSSASSSIIYGFNK
PAAAVAPMPHNPSKYTTTIAEKKSADDFSFAPTKSKPQIKSLAPPSAGSNIARMYKAAGF
STPPPSKPSTNMLKQVSGTKLATGILSSANLKLTKS

Nucleotide sequence

Length: 1,593

>KH2012:KH.C10.357.v4.A.SL3-2
AAGTGCTAGAAGAACTTTAGCATTTATTATTTTTAACTTGTTGATCATTTTTATCCTCTT
ATCATGGTGTAAATCCACCAATAGTTTAGCATTACGTTCCTTTGCTTACTTGACAGTGTT
TGATTTTTTCACTTTAATTACTTGTATGATTTCTATTTGGTCTACTGCCAATCAAATAAG
CCAATCAGAGGAAGGAACAATTGTTTTCAATTATGAGCGGATAGAAGTTGTTTCTGTGTT
TTCTTCTGTTGTCCTTGCTAGCTTAGGATCAATTTTTATTTTGAAGGAATGTATAATCAG
GATAATTGACCAGCCAGAAGTGTCTATTGGAAGGTTATTGCCTGGTTTATTGGTTGGCTT
CCTTTTCCATGTTATGATTACTTTGTCTGTTAATAACAAGCCGCTGCAGTGTATTACAAA
TGCTTCACAATCTTCAGTGTTACAAGAACACATGGCAGATATGAGCCAAACACTATGTAG
CATTATACCAGCTTTAAGCAAGATATTGCTACCAAGAATAAACCCTTTTCTTCTTACTTC
GTTTATTGGGGCTTCGCTGATTTTTTTGACAAATCTTCTTATTCAAATGAATTTGTATTA
CTTCGCTGATACAGTCTCAGCGATTTTAATATCAACGTGCACGTTGTGTACTATGTGGCC
TGTTGCCTCGTGCAGTGCACGAGTGTTGCTCAACACAACTCCTCCTTACTTACTGGGGCA
GCTGGATAAACTTTTAAGTGAAGCTCAAACTTTAGATGGTGTCCTTGAAATTCGAAACGA
AAGATTTTACACAGTCTCATTGTCTGTTAATAATAAGAAACGATATCATAATGGGTTAAC
AATGGTTGGTAGTATTAATGTGCGTGTACGTCGAGATGCAGATGAACAGATGGTGCTGGC
ACACGTCACACACCGTTTGTCAACTCTTGTTTCTCACCTTACTGTGCAGGTATCCAAGGA
TGATTGGGGTTCTGTACCTATGGTTTCCAGTGGGGTAATTAACATTCCTCGAGCTGTTAG
AAGCACTAGTGGTTCAAAACCAAGTAGTGCTTCATCAAGTATAATATATGGCTTCAACAA
GCCAGCAGCAGCCGTAGCTCCAATGCCACATAATCCATCAAAATACACAACAACTATAGC
CGAGAAAAAATCAGCAGATGATTTCAGCTTTGCTCCTACAAAAAGCAAACCACAAATAAA
ATCATTAGCTCCCCCATCCGCCGGTAGTAACATAGCCCGCATGTATAAAGCAGCTGGCTT
CAGTACACCCCCACCATCCAAACCATCTACCAACATGCTCAAACAAGTATCTGGAACCAA
ACTTGCAACAGGAATTTTAAGTTCTGCAAATTTAAAACTAACAAAGTCATAGGAAATGAT
TGTGCACATTTTAGGGATTCTAAAATGTTCTGTTACTTAATTTTTATCTTAAGTTTTTAT
TATATACCTTCCCTGCAAAGATAAGTGTATTGATGAAATAAGACAGATGATGATTGTTTC
GGTTTATGTATGTGTATGACCCATTATTACTTACAACCATCTTGCCTTGCACATGAATGA
TCACTTTTTCTTGTTTGATTTAAAAACTACTAG

InterProScan

Gene3D	Cation_efflux_TMD_sf (IPR027469) - T[2-230] 4.3E-5
SUPERFAMILY	Cation_efflux_TMD_sf (IPR027469) - T[3-130] 1.2E-10 - T[163-230] 1.2E-10
Pfam	Cation_efflux (IPR002524) - T[6-230] 2.6E-15

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
ZNT6_HUMAN	50.47 %	327	8.02E-108