Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.596.v1.A.nonSL18-1

Possible name(s)

DYNLT1; DYNLT3; TCTEX1D2

Gene model

KH2012:KH.C10.596

Location

KhC10 [1,356,479 / 1,357,227]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 129

>KH.C10.596.v1.A.nonSL18-1
FALNFSLLRFLNPKIKMDDFQAGEETTFVVDDVSNVIKESIETTIGGNAYQHNKVNQWTS
NVVEQCLNQLTKLGRSFKYIVTAVIMQKNGAGLHTASSCYWDNSTDGSCTLRWENKSMYC
IVSVFGLAI

Nucleotide sequence

Length: 748

>KH2012:KH.C10.596.v1.A.nonSL18-1
ATTGAGGCCTAATTTGCTTTAAATTTCAGTTTGTTAAGATTCCTGAACCCTAAAATTAAG
ATGGACGACTTCCAAGCCGGCGAGGAAACCACTTTTGTCGTAGACGACGTAAGCAATGTC
ATAAAAGAGTCGATCGAAACCACAATCGGTGGAAATGCGTATCAACATAACAAAGTCAAC
CAGTGGACCTCAAACGTGGTCGAGCAGTGTCTGAACCAGCTTACTAAGCTTGGTAGATCG
TTCAAGTACATCGTCACAGCAGTTATCATGCAGAAAAATGGCGCTGGATTGCACACAGCA
AGTTCCTGCTACTGGGATAACTCAACCGACGGAAGTTGCACTCTACGTTGGGAAAACAAG
AGCATGTATTGCATTGTCAGTGTTTTTGGACTTGCTATATAGACGTGTATGTGTTTGGTA
CTGTTTCCACCATATAATACTGTTTTAACGCTTCCTTGCTTTTCATTTTTAATGTATAAA
ACGTGTTTCAAATAAATATTTAAACAAATTGTTAGAATTCTTAAGCTACTACTTCTTTAA
AACAGCTAAAAAATGAAATATAAAGTTATTTGACGTTGTGACTTGCGGTATATTATTTGG
CTGAAGAGGTTTCCGTATTTATTTGCAGTATTTCAGTGCTGGTTACCTTACCTAAACAAC
ATGTAAAGCAAATGGAATTTAGTGTTTTATTTGTCAAACTGTATATCCTGTTTTATATAT
AAAATTTATGTTTGTGAACAAAAATTAG

InterProScan

PANTHER	Tctex (IPR005334) - T[17-129] 8.4E-63
Gene3D	Tctex-1-like_sf (IPR038586) - T[30-129] 1.3E-44
Pfam	Tctex (IPR005334) - T[33-127] 6.6E-32

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
DYLT1_HUMAN	79.646 %	201	1.56E-68
DYLT3_HUMAN	50.943 %	134	8.96E-42