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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C11.46.v1.A.SL1-1
Possible name(s)
H3F3A; HIST2H3A; HIST2H3D
Gene model
Location
KhC11 [921,312 / 922,712]
Amino acid sequence
Length: 152
>KH.C11.46.v1.A.SL1-1
YLVKVYNYLRLLRKLKMARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRP
GTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGL
FEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRAERA
Nucleotide sequence
Length: 1,400
>KH2012:KH.C11.46.v1.A.SL1-1
GTATTTAGTTAAAGTATATAATTATTTAAGACTTTTGAGGAAACTTAAGATGGCACGTAC
CAAGCAAACCGCTCGTAAATCTACTGGAGGAAAAGCTCCTCGTAAACAGCTCGCTACCAA
GGCAGCGAGAAAGAGTGCTCCCTCTACTGGTGGAGTGAAGAAGCCACATCGCTACCGACC
CGGTACTGTCGCTCTTCGTGAAATTCGACGATACCAGAAGTCGACTGAGTTGCTCATACG
AAAACTTCCATTCCAACGTCTTGTTCGTGAGATTGCTCAAGACTTCAAGACCGATCTTCG
CTTTCAGAGCGCTGCTATTGGTGCCCTTCAAGAAGCAAGTGAAGCTTATCTGGTCGGCCT
CTTCGAGGACACAAACCTTTGTGCCATCCACGCTAAGAGGGTCACCATCATGCCCAAGGA
TATACAGCTCGCTCGTCGTATTCGAGCCGAACGTGCTTAAACTGGTGGCGCAGCTTTGCT
GAATGCTGAGGACACATTGTATATATCTTATCCCCATAAACACTTGATTGTCTAGCACCG
TAGTTGGATGTTTTTTATATGAGCCTGATAATATGTTTTACCAACATAATTCCTGAACGT
AATACTAGCAACCACTTCGACAGTAACTCAAATTCACTCGACCACAAAATAAGATGTTTT
AAAACTAAGTTTTCAATTTTTTTTCAATGAATAAATATTACCTCGCTTAAATGATAATTT
TGTAACAATGTAAAAGTCCGGATTAAACCCAAACCAACCAAGGTTCAATAATATTGTGTT
TTGTTTAATTTTGTGTTTTACATTTATTAACCTTGATTTCCAGCTTAACGTTTGACTTTG
TATTATTTTCATGGGGGAGTAAAGAAATCCCAAGTGTTTAATATTAAAAGCATTTTAAAT
TAACATTAGTGGTAATACTCAGTTAAAAATTAATTTTGTTGGAACAGTCTGTTTTATTAA
TGTTCGCCCAAATAATTATAATAACTAGAATTTTTATCTAAATATTAAACAGCGGACCAT
CATTTTTTAAATTTGATTAATTTTGAATGTGTATAGTCAGCTGCCAGTAATTTTTATCTT
CTGTGTTTCTGATTTGTGTCTAATGTCTACTTTTAAACAGGCAGTCTTTCACTTGTAAAC
AGCTTTTTTAAGACAGAATTTGCTTAAATTTATTAATTGACAATTTTACATTACTGGTTT
CTTTTGTTAACACTGTTAATTAAAATAGTTGTCTACATAAAAACTTTAATTTCTAAAATT
TTTGCAAACAAAAAATTGTTTTGTGTTTAAAATTAAAATAAAAAATTGTTGGGTATAATT
CATTTTAATAATTCAAAAATTTCAATACGTAATTGTCACATTTGTTTTGAAGTGCATGTT
AATGTTGTACATATTCGTAG
| Pfam |
Histone_H2A/H2B/H3 (IPR007125) - T[17-148] 1.2E-53 |
| PANTHER |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[17-152] 2.1E-91 |
| SUPERFAMILY |
Histone-fold (IPR009072) - T[18-148] 3.55E-56 |
| Gene3D |
Histone-fold (IPR009072) - T[18-152] 2.9E-78 |
| PRINTS |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[19-33] 2.5E-84 - T[33-47] 2.5E-84 - T[50-71] 2.5E-84 - T[74-91] 2.5E-84 - T[96-114] 2.5E-84 - T[114-130] 2.5E-84 - T[130-151] 2.5E-84 |
| ProSitePatterns |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[31-37] . - T[83-91] . |
| SMART |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[50-152] 2.8E-72 |