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Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C11.46.v1.A.SL3-1
Possible name(s)
H3F3A; HIST2H3A; HIST2H3D
Gene model
Location
KhC11 [921,312 / 922,682]
Amino acid sequence
Length: 142
>KH.C11.46.v1.A.SL3-1
LLRKLKMARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRR
YQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIH
AKRVTIMPKDIQLARRIRAERA
Nucleotide sequence
Length: 1,370
>KH2012:KH.C11.46.v1.A.SL3-1
ACTTTTGAGGAAACTTAAGATGGCACGTACCAAGCAAACCGCTCGTAAATCTACTGGAGG
AAAAGCTCCTCGTAAACAGCTCGCTACCAAGGCAGCGAGAAAGAGTGCTCCCTCTACTGG
TGGAGTGAAGAAGCCACATCGCTACCGACCCGGTACTGTCGCTCTTCGTGAAATTCGACG
ATACCAGAAGTCGACTGAGTTGCTCATACGAAAACTTCCATTCCAACGTCTTGTTCGTGA
GATTGCTCAAGACTTCAAGACCGATCTTCGCTTTCAGAGCGCTGCTATTGGTGCCCTTCA
AGAAGCAAGTGAAGCTTATCTGGTCGGCCTCTTCGAGGACACAAACCTTTGTGCCATCCA
CGCTAAGAGGGTCACCATCATGCCCAAGGATATACAGCTCGCTCGTCGTATTCGAGCCGA
ACGTGCTTAAACTGGTGGCGCAGCTTTGCTGAATGCTGAGGACACATTGTATATATCTTA
TCCCCATAAACACTTGATTGTCTAGCACCGTAGTTGGATGTTTTTTATATGAGCCTGATA
ATATGTTTTACCAACATAATTCCTGAACGTAATACTAGCAACCACTTCGACAGTAACTCA
AATTCACTCGACCACAAAATAAGATGTTTTAAAACTAAGTTTTCAATTTTTTTTCAATGA
ATAAATATTACCTCGCTTAAATGATAATTTTGTAACAATGTAAAAGTCCGGATTAAACCC
AAACCAACCAAGGTTCAATAATATTGTGTTTTGTTTAATTTTGTGTTTTACATTTATTAA
CCTTGATTTCCAGCTTAACGTTTGACTTTGTATTATTTTCATGGGGGAGTAAAGAAATCC
CAAGTGTTTAATATTAAAAGCATTTTAAATTAACATTAGTGGTAATACTCAGTTAAAAAT
TAATTTTGTTGGAACAGTCTGTTTTATTAATGTTCGCCCAAATAATTATAATAACTAGAA
TTTTTATCTAAATATTAAACAGCGGACCATCATTTTTTAAATTTGATTAATTTTGAATGT
GTATAGTCAGCTGCCAGTAATTTTTATCTTCTGTGTTTCTGATTTGTGTCTAATGTCTAC
TTTTAAACAGGCAGTCTTTCACTTGTAAACAGCTTTTTTAAGACAGAATTTGCTTAAATT
TATTAATTGACAATTTTACATTACTGGTTTCTTTTGTTAACACTGTTAATTAAAATAGTT
GTCTACATAAAAACTTTAATTTCTAAAATTTTTGCAAACAAAAAATTGTTTTGTGTTTAA
AATTAAAATAAAAAATTGTTGGGTATAATTCATTTTAATAATTCAAAAATTTCAATACGT
AATTGTCACATTTGTTTTGAAGTGCATGTTAATGTTGTACATATTCGTAG
| PANTHER |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[7-142] 1.7E-91 |
| Pfam |
Histone_H2A/H2B/H3 (IPR007125) - T[7-138] 9.4E-54 |
| SUPERFAMILY |
Histone-fold (IPR009072) - T[8-138] 3.02E-56 |
| Gene3D |
Histone-fold (IPR009072) - T[8-142] 2.3E-78 |
| PRINTS |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[9-23] 2.0E-84 - T[23-37] 2.0E-84 - T[40-61] 2.0E-84 - T[64-81] 2.0E-84 - T[86-104] 2.0E-84 - T[104-120] 2.0E-84 - T[120-141] 2.0E-84 |
| ProSitePatterns |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[21-27] . - T[73-81] . |
| SMART |
Histone_H3/CENP-A (IPR000164) - T[40-142] 2.8E-72 |