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  1. Transcript 'KH2012:KH.C11.460.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C11.460.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

SLC10A2; SLC10A3; SLC10A5

Location

KhC11 [1,398,247 / 1,401,036]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 448

>KH.C11.460.v1.A.SL1-1
TLGSLGCEMLRKCVLGFCLSFIGISNFVTGNNVTLTSLNVFEGEIKNLKLNCSRSDEEIK
TVNSEDIKIGGILINNESKPIDYGEFMCVNGSVVILVKGGHLGITHLHVDTKIGIHSNVI
KSESVTINVLRKITLFDELAVFILGPLILLNKCAFGAKIEVETLKKIVTQPVEICLCLVT
QFVLLPLVAVGLGFAFKLEQTMALALLVSAACPGGGGGYVFSFLVDGDITLAITESLVST
LVAMLAMPSVLGLYTSLVTIPNHIVIPYIKILLMLVAIATPISLGMLLRRKKPALAKKLV
VIIRPMSLFLIFAGLVIVVVTSKYVLYGPRIGFLLALIIPVSGFLIAIGLAQLFSINWPL
TKAIALEGGLKNTVLGVAVIELSFPQPQADLASILIIMVTVGQIVAAMCWYLFHVINQRL
QQKKFRTPAKDLHQDRQETELFLLQNEE

Nucleotide sequence

Length: 2,789

>KH2012:KH.C11.460.v1.A.SL1-1
GCACGTTGGGTTCTTTAGGTTGTGAAATGTTGCGAAAATGTGTACTAGGTTTTTGTTTGT
CATTTATCGGAATATCCAATTTTGTAACCGGAAACAACGTCACTTTGACGTCATTGAACG
TATTTGAAGGAGAAATCAAGAATTTAAAGTTGAATTGTTCAAGATCAGATGAAGAAATAA
AGACTGTTAATTCAGAGGATATTAAAATTGGTGGGATACTTATAAACAATGAATCAAAAC
CAATTGACTACGGAGAATTCATGTGTGTTAATGGGAGTGTGGTTATTCTTGTTAAAGGAG
GTCACCTGGGTATTACACACTTGCATGTGGATACAAAGATTGGAATTCATTCGAATGTGA
TTAAATCTGAATCGGTAACAATAAATGTTCTTAGGAAAATTACATTATTTGATGAACTAG
CAGTGTTTATCCTGGGTCCCCTTATTTTATTAAACAAATGCGCATTCGGTGCAAAAATTG
AGGTGGAAACACTGAAAAAAATCGTCACCCAACCTGTGGAGATATGTTTATGTCTTGTTA
CCCAATTCGTGTTGCTACCATTGGTAGCAGTTGGGCTCGGATTTGCCTTTAAACTTGAAC
AGACGATGGCTCTAGCACTTCTCGTATCCGCTGCTTGCCCGGGTGGGGGAGGAGGTTATG
TGTTTAGCTTCCTAGTCGATGGTGACATTACTCTTGCCATCACTGAGAGTTTGGTATCCA
CATTAGTCGCAATGCTTGCGATGCCAAGTGTGCTCGGTCTTTACACAAGTCTTGTAACGA
TCCCAAACCATATTGTGATCCCTTACATTAAAATTCTTCTCATGTTGGTGGCCATAGCAA
CCCCAATATCACTTGGAATGTTGCTGCGTAGGAAGAAACCTGCGCTGGCCAAGAAGCTTG
TTGTAATCATTCGTCCTATGAGTCTTTTTCTTATCTTTGCTGGGTTAGTTATCGTTGTTG
TAACATCCAAGTATGTTTTGTACGGCCCAAGAATTGGATTTCTACTTGCTTTAATCATTC
CTGTCAGTGGATTTCTTATAGCAATTGGTCTTGCTCAGTTATTCTCCATAAACTGGCCAC
TCACTAAAGCTATTGCACTTGAGGGTGGACTTAAGAACACAGTGCTTGGAGTTGCAGTTA
TTGAGTTATCTTTTCCCCAGCCTCAAGCTGACCTTGCTTCAATATTAATCATCATGGTAA
CGGTTGGGCAAATAGTTGCAGCCATGTGTTGGTATTTGTTCCATGTTATCAATCAAAGGT
TGCAACAGAAAAAGTTCCGGACACCAGCCAAGGATTTACATCAAGATAGACAAGAGACCG
AATTGTTTCTTCTTCAAAACGAAGAGTAATTTTTAACCAACTGGCGAAGAAATGTCAGTG
AAATAAGTTTTGTATTAAAAGGATAGATTTTACTTGTTAGTTGTATAAACCAAACAAAGC
AGTTTTAATGCAGAGAGTTTGCCATTTATGCTTGCCTGTTTTTGTTGACCAACATTTGTT
TCGATAGAAGCTGCCTAGGTCTATGCACATGAGTGATGTTTTGTAGACATTTTTAAAACC
CAATGCACGAGTTGCAGAAATCACTGAAATTCTTGTTTTAAATGTTTTCGTCACCAAATT
AAATTAAGTTTTATTCCAAACTTTATGTATTGTTCAAGTTGTTTGTTCCAATTTAACAGT
TACAGTTCCGCATTTGGTTTCTTTCCCTTTGTTGCCAAACAATGGACATTATGATCGTAG
AACACAGTCATTGTTCCATAACACTGAGCACTGTTTACACTTTCAAATGCAATATTATGA
CAGTGGTACTTTTATTGAATGTATTATGTGTGTGTTTTTACACCAGTTGTAGTTATATTG
TTATAAATATTAGAAACATTTTACCTTTTATCGGAACATGACTAAACAGTTTGTTTTTTT
CAAATTGAAACCAAATCTTTAATTGAAATATAAAATTTTACTTTTGTCACTAATTACGGT
GCGTATAAAAATAGAAGATTTTAATAAGAAACTGGGGTGCCAAAACAAACTATCTAATTA
ACAATTGGACTAAATATGAAAAAAATTAGACACCTCTAATATGCCACAAATGGCACTAGT
GTCTACATATTTTTTTTTAAATTGTTTAGAAATGTTGTATTTTTAAAGAAAGATTTTAAG
GAAGTAGTGTTGAATATGACATTTTAAGGTATTTTAAATATGCTAACCAGACTTTTTATG
TCCACTGTTATTTAAAAAGAATTTATTTTCTACATATGACCATGTTGTTATAAAGGTTTG
TGTTTAATCAATATATCATGTCGGCGTATTATTATACATAAGTTTTCAGCAACATTTGGA
AACTGTTTTTTTTTTGTATTTATTGTTGAATTTGTTGTATTAAAAAGTTAATGTTATTAT
ACTTTTTTCAATTCAAATTAATATAAACAAATACTAAGAGACTCTGCACTTACGAATCGT
TACGATACATTAAACACTGCTATCTAAGTATCTATTACATTACTCATTGTCTAATATATC
ACTGATATTATTATGTCGTCATATTATTACGAAGTGCCCTGTCATGTTGTTAGTGTGTTT
GTGAGCGTTGTAAATGGTTAAATACTGAGCACAGGTTTTATTTTTGTGACTTTTTCATGG
ATTAAATTAATGAAAACAATATGAATGCTCACTACACTATATTAATAGTCCTTATACGTT
ACAAGGGGTTATATTTATACCCAATTAACCTCTGGCTTTTACCCCAAAAAATATTGGCTA
ACATAATACATATATATTTTGCAAGTTTA

InterProScan

PANTHER
Bilac:Na_transpt (IPR004710) - T[125-423] 5.0E-65
Pfam
BilAc:Na_symport/Acr3 (IPR002657) - T[147-325] 1.8E-25

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NTCP2_HUMAN 26.712 % 122 4.16E-31
P3_HUMAN 34.553 % 142 2.23E-37
NTCP5_HUMAN 36.538 % 152 1.8E-41