Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.245.v1.C.nonSL3-1

Possible name(s)

DRG1; DRG2; GTPBP10

Gene model

KH2012:KH.C12.245

Location

KhC12 [4,403,791 / 4,405,915]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 201

>KH.C12.245.v1.C.nonSL3-1
EAVGIRLNKKRPNIYFKEKKGGGISITATCILTKISERMINLILHEYKIFNADVVFRDDC
GTEEFIDVVVGKRKYMPCLYVYNKIDQISIEEVDRIAWQPHCVVISCNMLLNLEHLKEMI
WRYLHLITVYTKKPGKKPDFNDGLILRSNCTVEHACHAIHRTLVQNFKYAQVWGHSAKYN
GQHVGLSHKLSHEDVLLVTKK

Nucleotide sequence

Length: 2,124

>KH2012:KH.C12.245.v1.C.nonSL3-1
GGAAGCTGTCGGAATAAGGCTGAATAAGAAGCGGCCGAATATTTATTTCAAGGAGAAAAA
AGGTGGAGGGATTTCTATAACTGCTACTTGCATTCTGACCAAAATATCAGAAAGGATGAT
CAATCTTATACTTCATGAGTACAAGATATTCAATGCAGATGTGGTGTTTAGGGATGACTG
CGGCACGGAAGAGTTTATTGATGTTGTGGTGGGAAAGCGAAAATACATGCCATGTTTATA
TGTCTACAACAAGATCGATCAAATCTCCATTGAAGAAGTTGATCGTATTGCATGGCAACC
TCACTGTGTTGTCATTAGTTGCAATATGTTGCTAAACCTGGAGCATTTAAAAGAAATGAT
CTGGAGATATCTGCATTTGATTACTGTTTACACCAAGAAACCCGGGAAGAAACCAGACTT
TAATGATGGTCTCATCTTGCGTTCGAATTGCACCGTAGAACATGCATGCCATGCCATTCA
TAGGACTCTGGTTCAGAATTTTAAATACGCTCAGGTTTGGGGCCACAGCGCTAAGTATAA
TGGACAGCACGTGGGGTTATCGCATAAATTGTCTCATGAGGATGTTTTGCTTGTTACGAA
AAAGTAACAGATAACCTTTGGGATAATAAAATGTAAAAGATTAAGCACTAGGAAATCACG
CATGCCATTGCTTGTTATTTAAGGTCATGGCTTGTGGTGTATGTTTCTATATTCTGAATC
CTACCGCTCTTGTTAAGTTCATACATTTGTGCAGTGCTGCCCTGTCTAATATTCTCTCTA
AACTTGTGCCCAAATCAAAGTTGGTGATGGTGTTGATTGGCAACATTGCTGAATTTACTT
CTTTCTTGCAAAAAAGTCACATCAAAGTAAAACAAAAACATTCTTGTTTGTGTGGCAACA
AATGTATTGCAATATGAATTATGAATACTGAACATTTTAATGCAGAGCTAAAAGCAATAT
TAATGATAATTAATAATTAGTAAAATAAGTTAGTAAAAATGTGAGTTAGTAAAATAACAA
ATAGGTAGATTGGGTCACTGAAATGCAATTCTGAATAAAATCATAATAAAAGAAGTCACT
TTTGTAAAAAAAAATCTCTATACAAAATCTATTGCAGCAGGTTACTAACATAAACAAGTT
TTAAACATAAATACAAAATAAAAAAGTGCAATAGATCTTTTATGAATAAATGACACTTAT
TTATGCTTGTATGGCGGGGCAGTGATAGTTTTTATAACATGGGTGCCCTATTTCATACAC
CTTGTGCTCATGTAGTCCTAACAGATAAGTTAGTGGATGCTATTTATTTTTTAAATGGTT
GACAACCCATTACTGATTTCTAAGTTTGTCTGGTAAGTGTCTTTGTATATGATTCTATAT
GGGCAAAAGGACCTTAACATAGAAGCTATATATATAACTTGGTAATGGGTCCACCCCTTT
TTAGTTGTTTTTCAATTCACTTCCACAGTCATCAAGTTGTATCATCAACTCCTGTTCCAA
GTAAGATGGGTTATTACTACAAGTACAATATAGCTTTTTGAATTTTACGTCATATAAGTC
TGGTAACTTTCCTTACTGTTTCTGCTTATTAGATGCAAGACAGCTAACCTAAATTATTGC
TTTATGGCCCTGTTGTTCAGCTCTTATAAAAAGTTGAATATGTTACATAGACATAGTCTT
ACCTTGTTTCTCAATTGTTGTAAAGCTTGTTGTAATTTCAGCCTTTCCTCTTGATTTGCA
TTTCGTGATCCCTTTTTACCAGCAAAACATTTGACAATGCAAAGCTTTTTATTGATTTTT
GGAAGAATCTGGCACATTGTATCAACATCTGAGCTGTCAAGTTCATTGTGACAGACACAG
AATTCATCAATCTAAAAATGGAAGCAATATTTAGTAACATAAATGAGTGTAACAAATTTA
TCCTGGTATTGTGGTGGAATGACAGTCGTAATACGACAGGTTTTCTGTCCCATCATACAC
CATATGCCCGCTTATAATTTATCATGGTTTACCTTTGTGGGTGATTATTTTTTCAAACCT
ATAAATTATGGTCCAAAGGTGAGTGCTCCAACCATTACGACTGTAATAAAAAGTTAAATT
GTTGCGCATTTTATGATGAACAAA

InterProScan

SUPERFAMILY	P-loop_NTPase (IPR027417) - T[3-161] 6.67E-17
Pfam	GTP-binding_2 (IPR031662) - T[22-126] 3.7E-42
Gene3D	Beta-grasp_dom_sf (IPR012675) - T[119-201] 2.8E-32
SUPERFAMILY	TGS-like (IPR012676) - T[121-199] 2.09E-17
Pfam	TGS (IPR004095) - T[127-198] 4.9E-20

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
DRG2_HUMAN	64.677 %	290	7.7E-99
DRG1_HUMAN	51.485 %	204	3.86E-65