Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL10-3

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,233 / 4,111,251]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 247

>KH.C12.696.v1.A.nonSL10-3
FKAKKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDSTTVEDEHTFERKKLTGDV
TCEFLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPLNLYIAGIMTSVKPLIDQG
IVKRVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHSFRAVLTNLVTYVRADNDT
KLPTSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKLSSVKSIVNSSGFGIQLFI
LENIENS

Nucleotide sequence

Length: 1,018

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL10-3
GTTTTAAAGCTAAAAAAGCACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGTGAAA
TCATTGAAGATAGTTTAAATGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACCACGG
AAGACTCAACAACAGTGGAAGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGTGATG
TAACGTGTGAGTTTTTAGAAGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTTTACC
CGTGGGATATATTCGTTGCTCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGTTATC
CGCCTTTGAACTTGTACATAGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGACCAAG
GCATTGTAAAACGTGTAGTACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAATTTG
TATTTGAATTATCTGGAGAGTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAATGTTG
AACATTCATTTCGTGCGGTGCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAATGACA
CAAAGTTGCCAACTTCATTCCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCCGACT
TGTTTTCGACTGACGGCACTGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAACAAAT
CAAAGCTTTCCTCCGTAAAATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTATTTA
TATTGGAAAATATTGAAAATTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCTGCGA
TTGCTGTAATTTTCATTTCCAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAATCTGT
CTTATGGTACTATTGATCAGTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCAGTTT
CCTGTTTTGCTATTCTTATTTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTATTTA
AAAAACCAGGATTGGTTTATTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTCAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[50-243] 1.1E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[55-240] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[59-194] 2.62E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.8	5.42E-23