Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL1-1

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,207 / 4,111,322]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 265

>KH.C12.696.v1.A.nonSL1-1
PALHFDDPRLNLNEFLLCFKAKKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDS
TTVEDEHTFERKKLTGDVTCEFLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPL
NLYIAGIMTSVKPLIDQGIVKRVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHS
FRAVLTNLVTYVRADNDTKLPTSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKL
SSVKSIVNSSGFGIQLFILENIENS

Nucleotide sequence

Length: 1,115

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL1-1
AAATATTATATACCAGTAACCTGCGTTGCATTTCGATGACCCAAGGTTAAATTTAAATGA
ATTTTTGCTGTGTTTTAAAGCTAAAAAAGCACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATAT
CGACTGTGAAATCATTGAAGATAGTTTAAATGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAA
ATTGACCACGGAAGACTCAACAACAGTGGAAGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATT
GACGGGTGATGTAACGTGTGAGTTTTTAGAAGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAG
ACAAGTTTACCCGTGGGATATATTCGTTGCTCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCAT
GTCATGTTATCCGCCTTTGAACTTGTACATAGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTT
AATCGACCAAGGCATTGTAAAACGTGTAGTACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCT
GGAACAATTTGTATTTGAATTATCTGGAGAGTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTT
TATAAATGTTGAACATTCATTTCGTGCGGTGCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGC
TGATAATGACACAAAGTTGCCAACTTCATTCCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCC
AAGCTCCGACTTGTTTTCGACTGACGGCACTGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGA
TGAAAACAAATCAAAGCTTTCCTCCGTAAAATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTAT
ACAGTTATTTATATTGGAAAATATTGAAAATTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTG
AAAGTCTGCGATTGCTGTAATTTTCATTTCCAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTA
TTTTAATCTGTCTTATGGTACTATTGATCAGTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAA
ACTTGCAGTTTCCTGTTTTGCTATTCTTATTTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCAC
ATTTTTATTTAAAAAACCAGGATTGGTTTATTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTA
CTATTTCAGATTTTGTTCTATAGTTTTCATTGCAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[68-261] 1.3E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[73-258] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[77-212] 3.27E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.4	1.1E-22