Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL20-4

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,201 / 4,111,288]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 260

>KH.C12.696.v1.A.nonSL20-4
DDPRLNLNEFLLCFKAKKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDSTTVED
EHTFERKKLTGDVTCEFLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPLNLYIA
GIMTSVKPLIDQGIVKRVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHSFRAVL
TNLVTYVRADNDTKLPTSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKLSSVKS
IVNSSGFGIQLFILENIENS

Nucleotide sequence

Length: 1,087

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL20-4
GATGACCCAAGGTTAAATTTAAATGAATTTTTGCTGTGTTTTAAAGCTAAAAAAGCACGA
ACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGTGAAATCATTGAAGATAGTTTAAATGAA
AATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACCACGGAAGACTCAACAACAGTGGAAGAT
GAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGTGATGTAACGTGTGAGTTTTTAGAAGTT
GCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTTTACCCGTGGGATATATTCGTTGCTCGC
AAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGTTATCCGCCTTTGAACTTGTACATAGCT
GGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGACCAAGGCATTGTAAAACGTGTAGTACTA
TTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAATTTGTATTTGAATTATCTGGAGAGTTA
CCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAATGTTGAACATTCATTTCGTGCGGTGCTG
ACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAATGACACAAAGTTGCCAACTTCATTCCAA
GTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCCGACTTGTTTTCGACTGACGGCACTGGT
TTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAACAAATCAAAGCTTTCCTCCGTAAAATCT
ATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTATTTATATTGGAAAATATTGAAAATTCA
TAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCTGCGATTGCTGTAATTTTCATTTCCAGT
CAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAATCTGTCTTATGGTACTATTGATCAGTGC
CTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCAGTTTCCTGTTTTGCTATTCTTATTTTA
GCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTATTTAAAAAACCAGGATTGGTTTATTTC
CATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTCAGATTTTGTTCTATAGTTTTCATTGCA
GAGTTAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[63-256] 1.2E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[68-253] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[72-207] 3.14E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.4	8.74E-23