Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL22-3

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,233 / 4,111,315]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 265

>KH.C12.696.v1.A.nonSL22-3
PALHFDDPRLNLNEFLLCFKAKKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDS
TTVEDEHTFERKKLTGDVTCEFLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPL
NLYIAGIMTSVKPLIDQGIVKRVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHS
FRAVLTNLVTYVRADNDTKLPTSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKL
SSVKSIVNSSGFGIQLFILENIENS

Nucleotide sequence

Length: 1,082

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL22-3
ATATACCAGTAACCTGCGTTGCATTTCGATGACCCAAGGTTAAATTTAAATGAATTTTTG
CTGTGTTTTAAAGCTAAAAAAGCACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGT
GAAATCATTGAAGATAGTTTAAATGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACC
ACGGAAGACTCAACAACAGTGGAAGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGT
GATGTAACGTGTGAGTTTTTAGAAGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTT
TACCCGTGGGATATATTCGTTGCTCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGT
TATCCGCCTTTGAACTTGTACATAGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGAC
CAAGGCATTGTAAAACGTGTAGTACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAA
TTTGTATTTGAATTATCTGGAGAGTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAAT
GTTGAACATTCATTTCGTGCGGTGCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAAT
GACACAAAGTTGCCAACTTCATTCCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCC
GACTTGTTTTCGACTGACGGCACTGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAAC
AAATCAAAGCTTTCCTCCGTAAAATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTA
TTTATATTGGAAAATATTGAAAATTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCT
GCGATTGCTGTAATTTTCATTTCCAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAAT
CTGTCTTATGGTACTATTGATCAGTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCA
GTTTCCTGTTTTGCTATTCTTATTTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTA
TTTAAAAAACCAGGATTGGTTTATTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTC
AG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[68-261] 1.3E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[73-258] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[77-212] 3.27E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.4	1.1E-22