Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL29-3

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,233 / 4,111,300]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 264

>KH.C12.696.v1.A.nonSL29-3
ALHFDDPRLNLNEFLLCFKAKKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDST
TVEDEHTFERKKLTGDVTCEFLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPLN
LYIAGIMTSVKPLIDQGIVKRVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHSF
RAVLTNLVTYVRADNDTKLPTSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKLS
SVKSIVNSSGFGIQLFILENIENS

Nucleotide sequence

Length: 1,067

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL29-3
GCGTTGCATTTCGATGACCCAAGGTTAAATTTAAATGAATTTTTGCTGTGTTTTAAAGCT
AAAAAAGCACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGTGAAATCATTGAAGAT
AGTTTAAATGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACCACGGAAGACTCAACA
ACAGTGGAAGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGTGATGTAACGTGTGAG
TTTTTAGAAGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTTTACCCGTGGGATATA
TTCGTTGCTCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGTTATCCGCCTTTGAAC
TTGTACATAGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGACCAAGGCATTGTAAAA
CGTGTAGTACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAATTTGTATTTGAATTA
TCTGGAGAGTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAATGTTGAACATTCATTT
CGTGCGGTGCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAATGACACAAAGTTGCCA
ACTTCATTCCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCCGACTTGTTTTCGACT
GACGGCACTGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAACAAATCAAAGCTTTCC
TCCGTAAAATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTATTTATATTGGAAAAT
ATTGAAAATTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCTGCGATTGCTGTAATT
TTCATTTCCAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAATCTGTCTTATGGTACT
ATTGATCAGTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCAGTTTCCTGTTTTGCT
ATTCTTATTTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTATTTAAAAAACCAGGA
TTGGTTTATTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTCAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[67-260] 1.3E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[72-257] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[76-211] 3.27E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.4	1.01E-22