Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL7-1

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,207 / 4,111,232]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 241

>KH.C12.696.v1.A.nonSL7-1
RTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDSTTVEDEHTFERKKLTGDVTCEFLE
VAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPLNLYIAGIMTSVKPLIDQGIVKRVV
LLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHSFRAVLTNLVTYVRADNDTKLPTSF
QVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKLSSVKSIVNSSGFGIQLFILENIEN
S

Nucleotide sequence

Length: 1,025

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL7-1
ACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGTGAAATCATTGAAGATAGTTTAAA
TGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACCACGGAAGACTCAACAACAGTGGA
AGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGTGATGTAACGTGTGAGTTTTTAGA
AGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTTTACCCGTGGGATATATTCGTTGC
TCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGTTATCCGCCTTTGAACTTGTACAT
AGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGACCAAGGCATTGTAAAACGTGTAGT
ACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAATTTGTATTTGAATTATCTGGAGA
GTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAATGTTGAACATTCATTTCGTGCGGT
GCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAATGACACAAAGTTGCCAACTTCATT
CCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCCGACTTGTTTTCGACTGACGGCAC
TGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAACAAATCAAAGCTTTCCTCCGTAAA
ATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTATTTATATTGGAAAATATTGAAAA
TTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCTGCGATTGCTGTAATTTTCATTTC
CAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAATCTGTCTTATGGTACTATTGATCA
GTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCAGTTTCCTGTTTTGCTATTCTTAT
TTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTATTTAAAAAACCAGGATTGGTTTA
TTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTCAGATTTTGTTCTATAGTTTTCAT
TGCAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[44-237] 9.7E-34
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[49-234] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[53-188] 2.48E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.8	5.02E-23