Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL9-3

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,233 / 4,111,295]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 262

>KH.C12.696.v1.A.nonSL9-3
HFDDPRLNLNEFLLCFKAKKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDSTTV
EDEHTFERKKLTGDVTCEFLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPLNLY
IAGIMTSVKPLIDQGIVKRVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHSFRA
VLTNLVTYVRADNDTKLPTSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKLSSV
KSIVNSSGFGIQLFILENIENS

Nucleotide sequence

Length: 1,062

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.nonSL9-3
GCATTTCGATGACCCAAGGTTAAATTTAAATGAATTTTTGCTGTGTTTTAAAGCTAAAAA
AGCACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGTGAAATCATTGAAGATAGTTT
AAATGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACCACGGAAGACTCAACAACAGT
GGAAGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGTGATGTAACGTGTGAGTTTTT
AGAAGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTTTACCCGTGGGATATATTCGT
TGCTCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGTTATCCGCCTTTGAACTTGTA
CATAGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGACCAAGGCATTGTAAAACGTGT
AGTACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAATTTGTATTTGAATTATCTGG
AGAGTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAATGTTGAACATTCATTTCGTGC
GGTGCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAATGACACAAAGTTGCCAACTTC
ATTCCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCCGACTTGTTTTCGACTGACGG
CACTGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAACAAATCAAAGCTTTCCTCCGT
AAAATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTATTTATATTGGAAAATATTGA
AAATTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCTGCGATTGCTGTAATTTTCAT
TTCCAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAATCTGTCTTATGGTACTATTGA
TCAGTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCAGTTTCCTGTTTTGCTATTCT
TATTTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTATTTAAAAAACCAGGATTGGT
TTATTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTCAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[65-258] 1.3E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[70-255] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[74-209] 3.14E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.4	1.14E-22