Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.696.v1.A.SL17-3

Possible name(s)

MAD2L1; MAD2L2

Gene model

KH2012:KH.C12.696

Location

KhC12 [4,110,233 / 4,111,242]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 244

>KH.C12.696.v1.A.SL17-3
KKARTRGKMNEDIDCEIIEDSLNENQTIAGVCKLTTEDSTTVEDEHTFERKKLTGDVTCE
FLEVAFHQILRSRQVYPWDIFVARKKYNIPVFMSCYPPLNLYIAGIMTSVKPLIDQGIVK
RVVLLLLSSLTVLEQFVFELSGELPQESSDEFFINVEHSFRAVLTNLVTYVRADNDTKLP
TSFQVKVYVTSCPSSDLFSTDGTGLLWVKCEKDENKSKLSSVKSIVNSSGFGIQLFILEN
IENS

Nucleotide sequence

Length: 1,009

>KH2012:KH.C12.696.v1.A.SL17-3
CTAAAAAAGCACGAACTAGGGGTAAAATGAATGAGGATATCGACTGTGAAATCATTGAAG
ATAGTTTAAATGAAAATCAGACCATTGCTGGCGTGTGTAAATTGACCACGGAAGACTCAA
CAACAGTGGAAGATGAACACACATTCGAAAGAAAAAAATTGACGGGTGATGTAACGTGTG
AGTTTTTAGAAGTTGCATTTCATCAGATTTTACGCTCCAGACAAGTTTACCCGTGGGATA
TATTCGTTGCTCGCAAAAAATACAACATTCCCGTTTTCATGTCATGTTATCCGCCTTTGA
ACTTGTACATAGCTGGTATTATGACTTCAGTTAAACCTTTAATCGACCAAGGCATTGTAA
AACGTGTAGTACTATTACTTTTAAGTTCATTGACGGTGCTGGAACAATTTGTATTTGAAT
TATCTGGAGAGTTACCACAGGAAAGTTCTGATGAATTTTTTATAAATGTTGAACATTCAT
TTCGTGCGGTGCTGACTAATTTAGTCACTTATGTTAGAGCTGATAATGACACAAAGTTGC
CAACTTCATTCCAAGTTAAAGTGTATGTTACCTCATGCCCAAGCTCCGACTTGTTTTCGA
CTGACGGCACTGGTTTATTGTGGGTAAAATGCGAGAAAGATGAAAACAAATCAAAGCTTT
CCTCCGTAAAATCTATTGTTAATTCTTCAGGGTTTGGTATACAGTTATTTATATTGGAAA
ATATTGAAAATTCATAGCAGCAATTTAATAAATACCCTTGAAAGTCTGCGATTGCTGTAA
TTTTCATTTCCAGTCAATTGCTGAATTTGCTGCAAACTTATTTTAATCTGTCTTATGGTA
CTATTGATCAGTGCCTATTTGTCAATCATCTTTTGTTGAAACTTGCAGTTTCCTGTTTTG
CTATTCTTATTTTAGCTTGTTTTGTTCTTTCGATTTGCACATTTTTATTTAAAAAACCAG
GATTGGTTTATTTCCATTCAGACTAACCTACATTCTTTTACTATTTCAG

InterProScan

Gene3D	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[47-240] 1.0E-33
ProSiteProfiles	HORMA_dom (IPR003511) - T[52-237] 20.302
SUPERFAMILY	HORMA_dom_sf (IPR036570) - T[56-191] 2.62E-23

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MD2L2_HUMAN	50.549 %	92.4	5.73E-23