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  1. Transcript 'KH2012:KH.C14.467.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C14.467.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

AGPAT5; LCLAT1; LPGAT1

Location

KhC14 [4,446,270 / 4,448,886]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 411

>KH.C14.467.v1.A.ND1-1
SNQIQLGYFLCFECFSKMVSHTRQYNFSTFTNLCYRVIILIYWLYQTIFGPILFVTTFVL
LQPLKLLSKKFFLAIVDTLYVLYMSSAGSWGDLAGHTFLLTGDDVSVIAGEESLLLLNHQ
TPVDIAVLMRCLHATPNAAASTMWVSDWLIQFIPYGWMAKCHNDFFLLQSVDAKRLKMFF
KNSETSNELVRLQKSIVDNFRSRNRKWVIVFPEGGFLSKRRSGSQRFARKNDLPILEHVA
LPRSGAVQCILDTLGVDGKYPGKNGSCDNSAGFTALGPTTNRNSSDSCPIKWIIDVTIGY
KQTMSCSEFIIGHRGRQTIHVHYRIKPASEIITSTPCNNGNYDVTKWLYELFYEKEELLS
YFYKHGKFPSENGTSPRVAPLYYRHIIMVNIYVILGWAFIYNICSLCFSLF

Nucleotide sequence

Length: 2,616

>KH2012:KH.C14.467.v1.A.ND1-1
TTAGCAGGTAGTATTAGTAAATGTTTTGTAGTTTATAATAATATGCCACTGTGAGTCATA
AGGAGTCAATTCTACAATTCTACCTCAGTGTGATGTCATAAAGCAGAACAGTTTGTTACA
TTTTGCCAAAAATCTCAAAAGAGGATAAAAATCGTTTCTATTCTATATGGGAGAGGTTCT
AAGGGGGCTGATCCAACCAAATTCAACTTGGTTACTTTCTTTGTTTCGAGTGCTTCAGCA
AAATGGTGTCCCATACCCGCCAGTATAATTTTTCCACCTTCACAAATCTATGCTACAGAG
TTATAATACTGATATATTGGCTTTACCAAACTATATTCGGACCCATATTGTTTGTTACTA
CTTTTGTTTTGCTGCAACCATTGAAGCTTCTAAGCAAGAAGTTTTTCTTGGCAATTGTAG
ACACCTTGTATGTGTTATACATGTCATCTGCTGGGTCATGGGGCGACTTAGCTGGACATA
CTTTCCTTCTGACTGGAGATGACGTATCAGTTATAGCAGGGGAGGAATCATTGCTTCTAC
TTAACCATCAAACCCCTGTAGATATAGCTGTTCTGATGAGGTGTCTGCATGCTACACCTA
ATGCAGCCGCAAGCACAATGTGGGTGTCTGACTGGCTTATACAATTTATCCCCTATGGCT
GGATGGCAAAATGTCACAATGACTTTTTTCTTCTACAATCAGTTGACGCAAAAAGATTGA
AAATGTTTTTTAAAAACTCTGAAACATCAAATGAGCTTGTACGACTTCAAAAATCTATTG
TTGATAATTTCAGGAGCAGGAATCGTAAATGGGTGATAGTTTTTCCCGAGGGTGGATTCC
TAAGCAAGCGAAGGAGTGGTAGTCAAAGATTCGCTCGTAAAAATGATCTCCCAATACTGG
AGCATGTTGCCCTGCCTAGATCAGGTGCTGTGCAGTGTATATTGGATACCTTGGGTGTGG
ACGGGAAATATCCAGGAAAAAATGGAAGTTGTGACAATTCTGCTGGTTTTACTGCATTGG
GCCCAACGACAAATAGGAATTCGAGCGATTCTTGTCCAATAAAGTGGATTATTGATGTAA
CAATTGGATACAAACAAACAATGAGTTGTAGTGAGTTCATAATAGGCCATCGCGGCCGGC
AAACCATACATGTTCATTACAGAATCAAACCAGCAAGTGAAATAATTACTTCCACACCAT
GTAATAATGGTAACTATGATGTCACTAAGTGGCTTTATGAATTATTCTATGAGAAAGAAG
AATTATTATCATATTTCTATAAGCATGGTAAATTTCCCTCGGAAAATGGCACTTCTCCTC
GCGTTGCACCTTTGTATTATAGACATATTATAATGGTAAACATCTATGTTATTCTAGGTT
GGGCTTTTATTTACAACATATGTTCTTTATGTTTTTCATTGTTTTAAATATACAGCAAAT
GTTTCGCCAAGTCTACTCAGTATTTTACAAGCACTGATGATAGCAACAGTTTTTGTGTGT
TATACAAAAAATATGTAATTAATAAGGTTACAATTATCATTATGGCAGACTGAGTAGACT
TTGTGAAACATCTGCCATTGTAGGCTTTACTTATATTAAATTGGATTGATTTTAAATTGT
TTTACCCAAAGAAACATTTTTCCACCTCTTTTTAAGTTATATTGCACAAGTGTTATAACA
AGGAGTTCTCATATATACTTTGTTTGTTGTCATATATTTTGCTTTATTCATATACTTATC
TAATGTTAAAGATATGAACCCCAATATGTTGTGATTTTTACAACCATATATATTGGTTAA
ACATAAGGAACCTCTAAGTTCCTGTGGTGAATCCAGTATATAATGTTTTTCAGTACTTCA
TATGCACGGCCTGTACCCATAGTTACCTACTGTTAAAGATATAACGTCTTAACATGCTTA
CTCATAGTTGTTAAACACAGAGAACCTCATTGATTATTGTGGCGAATGTAATGTATTTTG
GCTTTGCTTGTTTGTATATACACCTAACAGCAGGGTAAACTCTAGGTGACATTGTTAAAA
TACAGTTACACTTATAGTTGTCAAATATAGGGAACCTCATTGATTAATGTGGTGAATGCA
ATATACTTTGGCTCTGCTTGTTTGTATAGACACCTAACAGCGGGGTAAAAGCTGTTTTAA
GCTTAAAACTTTGGTTCCAAAATATGTTACCCCTGTTAAAAAACTTTGCCGCCAATATAC
TACGTACATACCTTTTAGTTTTAATTCCAATATTGTTACTATAGTATATACCCAGATAGA
TAGAGCCATCTTCAATATTGATTTAAATACAATCAATATTTTCATTACTGAATTGTATTT
TTCCTGCTACTGTGACAATACTATGATTGTTATTATGACATCACTGTGGTCGCTATTACC
TCGTAAAGTGTTCCAAACAAAAAACTAAAAATAAAAATACCACTGCTTTTTATGTCGTTA
TCATATTTATGTCATATATTATATTCAAAATATGCACGCTACCAAATGTAGACTGCCCAA
TGCTAACTGTGATATGTTTATTATACTGTGAAAAACTTTACACTGTTTCCTATGTACTCT
CAATGTATTACCTCGTTTGTGTTTACATTCATATAG

InterProScan

Pfam
Plipid/glycerol_acylTrfase (IPR002123) - T[108-221] 1.4E-6
SMART
Plipid/glycerol_acylTrfase (IPR002123) - T[113-240] 1.9E-4
Pfam
Acyltransf_C (IPR032098) - T[316-374] 1.2E-9

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
LGAT1_HUMAN 34.857 % 217 4.68E-67