Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.68.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

PSTK; XPO7

Gene model

KH2012:KH.C1.68

Location

KhC1 [1,358,683 / 1,360,345]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 330

>KH.C1.68.v1.A.ND1-1
LSCWLRSNTMVAVCICVLSGLPASGKTTISTEITQRLTCIQICYDALIQWLDLTGEGKWK
LARNQVVSLVEKMLEMIKNVTDVDHVFPLSGNGYNLLNTESVFEVWDILVQYKRKGLDSL
VFFIDDTMQYRSMRYDYVQLAKKYQTGFCVIQTSCPLDICIKRNESRPKRQSVSRLSVVQ
IHAQLETIGRCAWEKECSILIETFGVINENTYKSLVQLIKNNLSNPLCENASPDPVEVKN
SRLANHKSVLHQADLIMRVLVGDMIKRIRTENLKVRNTQVLNAKKQILKDLKQDMDFEEF
ISSETKTVDVVCLKGKLEKLFNVFLNLDTN

Nucleotide sequence

Length: 1,662

>KH2012:KH.C1.68.v1.A.ND1-1
GACGAGAGTTTGTTATTGCGCAGTCTTTCTCTTGCTTGCATTCTGACGCTTATTTTTAGT
CTCTTCCTTATCTTACTGCATGTGTGTTATTTCACACATCTAATGCAATCTTGAAAAAAA
TATTTCACAACTAATGCACAACTGGATACTGTAGTTCTCTCTATATATAAAGCAACGCCG
GTTCATTGGTTTCTCGGAGAAAGAACACCCATTTTGTAAGCCTATCAATTATGATTTATA
TATTTTAATAACTCTAATTGTTGTTTGTATCAACGTACCACATGGGTGTCGGATAGACGT
TTACTCTCCTTCTTTACACAAGAATTATACATGATTGTTTGCCTACAGAAGTCTTCCTTT
TTACATTACTCTTATTACTTTTATTGCTAACCTGTGGTCTATGATGTGAACTGTAGTTGA
CAACTTGTATCTTTTAGTTATCATGTTGGTTACGCAGTAATACCATGGTTGCTGTTTGCA
TTTGTGTTTTAAGTGGTTTACCTGCTTCAGGTAAAACCACCATCAGTACAGAGATAACAC
AGCGTTTAACTTGTATTCAAATATGTTACGACGCCTTAATACAGTGGCTAGACCTCACTG
GGGAGGGAAAATGGAAACTGGCTCGAAACCAAGTAGTTTCTTTGGTGGAAAAGATGCTGG
AAATGATCAAGAATGTTACAGATGTGGACCATGTATTTCCATTAAGTGGAAATGGATATA
ACCTACTGAATACAGAATCCGTGTTCGAGGTATGGGATATATTGGTGCAATACAAGCGAA
AAGGTTTGGACTCCTTAGTGTTTTTTATTGATGATACAATGCAGTATCGTAGTATGAGGT
ATGACTATGTGCAGCTTGCTAAGAAATATCAAACAGGTTTTTGTGTAATTCAAACTAGTT
GTCCCCTTGATATTTGCATCAAACGCAATGAATCGCGACCAAAACGCCAATCTGTGTCAC
GATTATCTGTTGTTCAAATACATGCACAGCTTGAGACCATAGGTAGGTGTGCATGGGAAA
AGGAATGCTCAATTTTGATTGAAACTTTTGGGGTTATCAATGAAAACACGTATAAATCCT
TGGTCCAGCTTATTAAAAATAATTTGTCAAACCCTTTGTGTGAGAATGCGTCACCTGACC
CAGTTGAAGTTAAAAACTCAAGGCTTGCGAATCACAAAAGTGTCCTGCACCAAGCTGATC
TTATTATGCGTGTGCTTGTTGGTGATATGATTAAAAGAATAAGAACTGAAAATTTAAAAG
TTAGAAATACCCAAGTGTTGAACGCAAAGAAACAAATTTTAAAAGATTTAAAACAAGACA
TGGATTTTGAGGAGTTTATTTCAAGTGAAACTAAAACTGTTGACGTGGTTTGTTTGAAAG
GAAAATTGGAAAAGTTATTTAATGTGTTTCTGAATTTAGACACCAACTAGGTATGCCTAT
AGTTTGTTTATCTTGATTCGGAATAATATTTACTGTGTTTTTTCTGCCATTGCTAAATAA
TATTTGTTTTCATTTCTGGTTAAAAAAAGTTTATATTACATAGGCTACCTAAGTAACGGC
ATGGGCCTGTACAACTTTGTTGGATTTGTAGTCAGTTTAAAATGGATCGTTTTGGTTGCA
GAATTGTTTTAAACATGGCTTATGTTTTATTATATATTACAG

InterProScan

SUPERFAMILY	P-loop_NTPase (IPR027417) - T[16-49] 1.93E-15 - T[85-188] 1.93E-15
Pfam	KTI12/PSTK (IPR013641) - T[16-272] 4.0E-12

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
PSTK_HUMAN	25.606 %	91.3	7.77E-21