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  1. Clone 'cien43607'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C1.989.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.989.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

TM6SF1; TM6SF2

Location

KhC1 [9,204,794 / 9,207,905]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 378

>KH.C1.989.v1.A.SL1-1
LDFKLLAVMANFIGVLASCFISLSGIPLVVFVTNSDVLSQPINLMAIGFTSMATIVVFVY
LVVPPNGIKKEEGKEGRGVLYYTCCLFMWASMTDLALQGQRFGLFGLKSGTGYFEHGEPY
LDTPFGLGVQGWNAIVNYLLYIHIIYNIDNNKDPRYTAIYWAGGILTSQFCVIVGAYSGS
FATYLPPSVAMNIVFVVFPMWVFFHFLNKPRSDKIQAINSTKYRALDIFLITGLLVASFF
MIIRGLGALDSPFPLTKYYVTTHEPYIMEPGKFGATWVLYGFIYGVPFQLFAIYGLLHSG
CEWMMDLVVFYAAGMLQGTCVYMAYTWFPMSNPEYHIPQASMYMVIAINVFLVFISNLLL
WRCFAEPQYFVKGKLKKN

Nucleotide sequence

Length: 1,670

>KH2012:KH.C1.989.v1.A.SL1-1
CCTTAGATTTTAAGTTACTTGCAGTAATGGCCAACTTTATCGGTGTTTTGGCGTCTTGTT
TTATTAGTCTAAGCGGCATACCGCTTGTTGTTTTCGTTACTAATAGTGATGTATTATCAC
AACCCATTAACTTGATGGCGATCGGTTTTACTTCAATGGCGACAATAGTGGTGTTTGTGT
ACCTTGTGGTGCCACCTAACGGAATCAAAAAAGAGGAAGGAAAAGAGGGCAGAGGTGTTT
TGTATTACACATGCTGTCTCTTTATGTGGGCAAGCATGACAGACCTAGCTCTTCAAGGTC
AACGCTTTGGGTTGTTTGGTTTAAAATCAGGTACTGGTTATTTTGAACATGGTGAGCCAT
ACCTGGATACTCCATTTGGGCTTGGTGTTCAAGGCTGGAATGCCATCGTGAACTACCTCT
TGTACATTCACATCATATATAACATTGATAATAACAAGGACCCGAGATATACTGCAATAT
ATTGGGCTGGAGGAATACTTACAAGTCAGTTCTGTGTGATTGTTGGAGCATACAGTGGTA
GCTTTGCGACGTATCTTCCTCCCTCTGTTGCAATGAATATCGTGTTTGTCGTCTTTCCAA
TGTGGGTATTCTTTCACTTCTTGAATAAACCAAGATCAGACAAGATCCAAGCGATAAATT
CAACCAAATACCGAGCATTGGATATTTTCCTTATCACCGGTTTACTCGTTGCTTCTTTCT
TCATGATAATACGGGGCCTCGGGGCGCTTGATTCACCCTTCCCCCTTACTAAGTATTATG
TCACAACACATGAACCTTACATTATGGAACCTGGAAAGTTTGGAGCTACCTGGGTGTTGT
ATGGTTTCATATATGGAGTGCCATTCCAGTTGTTTGCAATATATGGTTTGTTACATTCTG
GTTGTGAATGGATGATGGACCTGGTTGTATTTTATGCAGCAGGAATGCTACAGGGTACAT
GCGTGTATATGGCTTACACCTGGTTCCCAATGTCCAATCCTGAATATCACATTCCTCAAG
CATCAATGTACATGGTTATTGCTATCAATGTCTTCCTTGTGTTCATTTCAAACTTATTGC
TCTGGAGATGTTTTGCTGAACCTCAGTATTTTGTGAAAGGGAAACTCAAGAAGAATTAAC
TTTATTTAAACTTGCGATATAATATGGGCTTAGGTCTATACAAATAGTATTCTTTTTTTT
TAAACTAATAATCAAGAACTTTTTTTAACGACTATAAAACATTTTTTCTTCTTTATAAAT
CATTTATTCATCTCATGATTTAGTATTATCTTGCCTGCATGGTTTTTAAATGAGCAATTG
TATACTTAAGGACATCATTCGATACTATTTTGTTGTTTTACAATTTTATAATAAGTTTAA
TTAAGAAAAGTTTCATAAAATTTGAATTATTTATTTTAATCACGGGTTACAGCTATAGGT
TTAGTAGCCACACTTTTTTCTTCAGTATTTTTCTACAACTGATGTTCAAATTTAATTTTT
TGTTGCTTTAAATAATATAAGTTTTCTGTAATCAAAGAATCTTTTTCGAACAACACTTAT
AACCTTATAATTTTTTTCAGTACAGCATTGAGCATTATAAAAACTTTTAACTTTATTAAG
TTGAACCTTTTTATAAACCCTATATATTTATAACCTAGATTAATTTATAG

InterProScan

ProSiteProfiles
EXPERA (IPR033118) - T[77-203] 9.514 - T[226-360] 11.586

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TM6S1_HUMAN 27.869 % 158 8.16E-45
TM6S2_HUMAN 25.556 % 123 7.33E-32