Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C3.246.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

MIEN1; SELENOT

Gene model

KH2012:KH.C3.246

Location

KhC3 [2,523,434 / 2,524,543]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 146

>KH.C3.246.v1.A.SL1-1
GYRRAFEEYAQIINQRYSEVRIDGGNYPPPKFNQMAAMVLSVIKFMLIGCILTGVNPFEK
VGMETPQIYHWARENMIYACIMLFFFSNAIETQLTSTGAFEILLNDVTIWSKLKSGRVPR
VDELMQIIDSQINVGKMNPTDNFVQS

Nucleotide sequence

Length: 1,109

>KH2012:KH.C3.246.v1.A.SL1-1
TGAAGATGCTCCTATACCAAAACTGAAAAACCAGTTCACTGTACCAGTGGTCAAGTTTCT
TATCTGCCAATCCTGAGGTTACCGTCGTGCCTTCGAAGAATATGCGCAGATTATTAATCA
GCGCTATTCGGAGGTACGCATTGATGGGGGAAACTACCCACCCCCTAAGTTTAACCAAAT
GGCTGCTATGGTATTGTCTGTAATTAAGTTTATGTTGATTGGTTGTATTCTCACTGGTGT
CAACCCGTTCGAAAAAGTTGGCATGGAAACACCTCAGATTTATCACTGGGCGCGTGAAAA
TATGATTTACGCTTGCATAATGTTGTTCTTTTTCTCCAACGCCATTGAAACTCAACTCAC
ATCTACTGGTGCGTTTGAAATATTACTAAATGACGTCACAATCTGGTCAAAGCTGAAATC
AGGAAGAGTGCCCCGTGTGGACGAATTGATGCAAATAATCGACTCCCAAATAAACGTCGG
AAAAATGAATCCTACGGACAACTTTGTGCAATCATAAACTGAAGATGGTGTTTCGAAACT
TTTCAACTTTAGCAATAGTTGTTAAAAAACTATGTGGTGTTGGTGTCATTAGCTGGCATT
AATCATTTCAACTTCTAACAGATGTTTTAAGATTCGAAATAGAAAGGTCATGGAATTTTA
CAGGATTTCATTTAAAAAATAAAAACTGCAAACTGTCATTTCACATTTATATATATTTTG
TTAATTTGTTTTATTTGTTAATCTTATGTCCTCATTGGTATGTGATTTTTTTCCATTTAT
TGCATTGTGTCTTCATAGTTTATTTATGATTCACTATTCAGATATTATACATGGGTTTAG
GCAAATTTGTAGTACGGTAGCAGGAGCTGGTACTTTCGTGAACATTTCTGTTGTGGGATT
TTAATCAAATTTATGATGGTTTTATGTCGAAAGTTGAATGACTGACATAAACTTGATGTA
GCTTATTGGGTAGATAAGCGTATTGATTATATTTCATTTGCAGTTTAATGATTTTTCGTT
GTGCTCGTTCTGTGCTACTTTACAAATTTTATGGACTGTATAATTTGTGCACGTGGTAAC
ATCAGCTTCATTCTATTGTTTGTCTTCAG

InterProScan

TIGRFAM	Selenoprotein_Rdx-typ (IPR011893) - T[1-129] 2.3E-20
SUPERFAMILY	Thioredoxin-like_sf (IPR036249) - T[1-29] 4.47E-13 - T[96-134] 4.47E-13
PANTHER	Selenoprotein_T (IPR019389) - T[1-134] 2.3E-54
Pfam	Selenoprotein_Rdx-typ (IPR011893) - T[2-129] 3.0E-12

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
SELT_HUMAN	52.239 %	157	1.49E-49